Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 KLKP1-201ENST00000595979 403 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 AC012468.1-201ENST00000604888 430 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 AC007179.3-201ENST00000604976 235 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 AC006270.3-201ENST00000605967 1036 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 AC027045.1-201ENST00000609065 202 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 BX664730.1-201ENST00000616196 800 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 AC068831.7-201ENST00000616954 363 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 AC091304.6-201ENST00000619761 202 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 AL607023.1-201ENST00000620045 248 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 U6.101-201ENST00000637707 76 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 CYSLTR2-201ENST00000282018 4672 ntAPPRIS P1 BASIC3.53□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 AC007656.2-201ENST00000624902 4547 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 SCEL-201ENST00000349847 2386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 COMMD8-201ENST00000381571 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 AL365440.2-201ENST00000419738 2597 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.85
SGCGQ13326 AC104454.1-201ENST00000421341 1401 ntBASIC3.53□□□□□ -1.85
SGCGQ13326 TTN-204ENST00000360870 18218 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.85
SGCGQ13326 KIAA0586-209ENST00000556134 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
SGCGQ13326 LINC00670-201ENST00000313495 2953 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
SGCGQ13326 CUBN-201ENST00000377823 705 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
SGCGQ13326 RNU6-730P-201ENST00000383954 104 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SGCGQ13326 MIR506-201ENST00000384998 124 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SGCGQ13326 CXADR-203ENST00000400165 603 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
SGCGQ13326 AL133384.1-201ENST00000412744 351 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SGCGQ13326 GRM7-AS3-202ENST00000417482 454 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
SGCGQ13326 DBIP2-201ENST00000419076 262 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SGCGQ13326 TIMM9P2-201ENST00000419324 266 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SGCGQ13326 DUTP6-201ENST00000425573 462 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SGCGQ13326 AC097713.2-201ENST00000430199 356 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SGCGQ13326 AL008629.1-201ENST00000438615 184 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SGCGQ13326 AC044784.2-201ENST00000447297 366 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
SGCGQ13326 HMGB3P8-201ENST00000449709 577 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SGCGQ13326 AC098826.2-201ENST00000452011 651 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SGCGQ13326 RBMY2UP-201ENST00000453474 324 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SGCGQ13326 TBL1XR1-AS1-201ENST00000454723 414 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
SGCGQ13326 ANKRD26P4-201ENST00000455755 950 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SGCGQ13326 MTCO2P6-201ENST00000463134 685 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SGCGQ13326 AC017015.1-201ENST00000477387 286 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SGCGQ13326 AC004263.1-201ENST00000479327 332 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SGCGQ13326 AC025518.1-201ENST00000479856 347 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SGCGQ13326 MTND2P14-201ENST00000482139 351 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SGCGQ13326 SATB1-216ENST00000491519 1000 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
SGCGQ13326 AC097478.1-204ENST00000509723 547 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
SGCGQ13326 SNORA3.4-201ENST00000515969 96 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SGCGQ13326 RNU6-583P-201ENST00000516012 92 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SGCGQ13326 RNU2-27P-201ENST00000516185 142 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SGCGQ13326 RN7SKP83-201ENST00000516512 178 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SGCGQ13326 RNU6-579P-201ENST00000516879 102 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SGCGQ13326 OR5AK1P-201ENST00000524837 922 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SGCGQ13326 XIRP2-AS1-201ENST00000525330 776 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
SGCGQ13326 AP001636.2-201ENST00000525517 696 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
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SGCGQ13326 LINC02290-203ENST00000556662 577 ntTSL 4 BASIC3.52□□□□□ -1.85
SGCGQ13326 AC068875.1-201ENST00000561054 463 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
SGCGQ13326 AC023824.4-201ENST00000562572 476 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
SGCGQ13326 AC233702.6-201ENST00000584594 396 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
SGCGQ13326 LINC00907-210ENST00000593316 847 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
SGCGQ13326 CLIC4P2-201ENST00000601934 717 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SGCGQ13326 LINC02109-204ENST00000602801 563 ntTSL 4 BASIC3.52□□□□□ -1.85
SGCGQ13326 AC009220.3-201ENST00000604318 586 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SGCGQ13326 AC099566.1-205ENST00000609411 657 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
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SGCGQ13326 AP003485.2-201ENST00000623636 610 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SGCGQ13326 AL139220.2-223ENST00000625982 921 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
SGCGQ13326 XRCC4-203ENST00000396027 1530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
SGCGQ13326 DCUN1D1-201ENST00000292782 7954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
SGCGQ13326 HTR2B-201ENST00000258400 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
SGCGQ13326 PEX3-201ENST00000367591 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
SGCGQ13326 UFM1-201ENST00000239878 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
SGCGQ13326 AP002907.1-201ENST00000606361 1430 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SGCGQ13326 AC019117.3-201ENST00000637807 3523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
SGCGQ13326 MIR490-201ENST00000384865 128 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SGCGQ13326 LINC02337-201ENST00000401043 374 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
SGCGQ13326 MIR1284-201ENST00000408337 120 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SGCGQ13326 RAP1BP1-201ENST00000412709 553 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SGCGQ13326 AL354766.2-201ENST00000414085 423 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
SGCGQ13326 TRBV24OR9-2-201ENST00000416632 435 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SGCGQ13326 OR1AA1P-201ENST00000419597 916 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SGCGQ13326 AC233728.2-201ENST00000425348 757 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SGCGQ13326 CETN4P-201ENST00000432407 469 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SGCGQ13326 AC127537.2-201ENST00000439258 465 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SGCGQ13326 MTND2P20-201ENST00000440805 661 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SGCGQ13326 CHODL-AS1-201ENST00000447175 1117 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
SGCGQ13326 MTCO3P20-201ENST00000454926 688 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SGCGQ13326 AC067945.3-201ENST00000456176 386 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
SGCGQ13326 UBE2Q2P9-201ENST00000490086 202 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SGCGQ13326 AC069360.1-201ENST00000503469 431 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
SGCGQ13326 TMEM251P1-201ENST00000503717 318 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SGCGQ13326 AC147055.4-201ENST00000504399 745 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SGCGQ13326 AC008629.1-202ENST00000504820 525 ntTSL 4 BASIC3.51□□□□□ -1.85
SGCGQ13326 XKRY-201ENST00000510392 1100 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SGCGQ13326 AC104619.2-201ENST00000514293 646 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
SGCGQ13326 AC108467.1-201ENST00000515623 672 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
SGCGQ13326 AC104986.1-201ENST00000517978 436 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SGCGQ13326 AP003181.1-201ENST00000528811 445 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
SGCGQ13326 AP003461.1-201ENST00000528866 78 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SGCGQ13326 AC011611.4-201ENST00000547721 779 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
SGCGQ13326 AC087311.2-201ENST00000549660 320 ntTSL 4 BASIC3.51□□□□□ -1.85
SGCGQ13326 LINC00519-201ENST00000557518 682 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
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