Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 ABI2-204ENST00000295851 22209 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
TRIM28Q13263 ACTR3BP5-201ENST00000448440 1479 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
TRIM28Q13263 MYO5A-201ENST00000356338 11971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
TRIM28Q13263 SLC10A7-203ENST00000432059 3747 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
TRIM28Q13263 XKR3-201ENST00000331428 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
TRIM28Q13263 EIF3H-209ENST00000521861 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
TRIM28Q13263 AL157938.3-201ENST00000502188 3084 ntTSL 4 BASIC5.88□□□□□ -1.47
TRIM28Q13263 PDE1A-202ENST00000358139 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
TRIM28Q13263 ADAMDEC1-204ENST00000522298 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
TRIM28Q13263 FP236241.1-201ENST00000623374 7632 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
TRIM28Q13263 CU633967.1-211ENST00000624444 7628 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
TRIM28Q13263 SPINK5-201ENST00000256084 3535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
TRIM28Q13263 CACNB4-273ENST00000638091 4061 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
TRIM28Q13263 A1CF-205ENST00000374001 9221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
TRIM28Q13263 PWRN2-202ENST00000567246 4295 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
TRIM28Q13263 ABCC9-204ENST00000538350 2672 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
TRIM28Q13263 RASA1-203ENST00000506290 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
TRIM28Q13263 ZBTB38-201ENST00000321464 3588 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
TRIM28Q13263 AC021146.4-201ENST00000309229 279 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
TRIM28Q13263 DEFB107A-201ENST00000335021 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
TRIM28Q13263 DEFB107B-201ENST00000355602 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
TRIM28Q13263 RNY4P16-201ENST00000364768 94 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
TRIM28Q13263 MEIG1-201ENST00000378240 507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
TRIM28Q13263 Y_RNA.396-201ENST00000383949 103 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
TRIM28Q13263 RNU4-6P-201ENST00000410804 122 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
TRIM28Q13263 RNU6-272P-201ENST00000411028 104 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
TRIM28Q13263 TPMTP2-201ENST00000414372 726 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
TRIM28Q13263 AL590783.1-201ENST00000424138 456 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
TRIM28Q13263 BX005214.1-201ENST00000427327 476 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
TRIM28Q13263 TBX18-AS1-202ENST00000441863 382 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
TRIM28Q13263 MTND6P5-201ENST00000448266 512 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
TRIM28Q13263 HNRNPDLP3-201ENST00000456745 380 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
TRIM28Q13263 AC245028.2-201ENST00000458673 253 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
TRIM28Q13263 RN7SL385P-201ENST00000468873 276 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
TRIM28Q13263 AC016746.1-201ENST00000489557 831 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
TRIM28Q13263 TRBVA-201ENST00000498804 316 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
TRIM28Q13263 SEMA6A-AS2-201ENST00000508766 482 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
TRIM28Q13263 RN7SKP219-201ENST00000516825 296 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
TRIM28Q13263 RNA5SP337-201ENST00000517007 109 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
TRIM28Q13263 RNA5SP230-201ENST00000517039 122 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
TRIM28Q13263 Y_RNA.721-201ENST00000517207 102 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
TRIM28Q13263 COX6CP8-201ENST00000522620 226 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
TRIM28Q13263 AC103843.2-201ENST00000530523 682 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
TRIM28Q13263 AC090092.1-201ENST00000530576 510 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
TRIM28Q13263 AP001781.1-201ENST00000530977 207 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
TRIM28Q13263 MIR5186-201ENST00000577504 120 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
TRIM28Q13263 AL590491.2-201ENST00000614608 499 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
TRIM28Q13263 PARP15-206ENST00000493645 1311 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
TRIM28Q13263 DUSP19-202ENST00000354221 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
TRIM28Q13263 TRIM69-201ENST00000329464 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
TRIM28Q13263 RASGRP1-209ENST00000559830 1910 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
TRIM28Q13263 PLSCR5-201ENST00000443512 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
TRIM28Q13263 ENKUR-205ENST00000615958 3294 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
TRIM28Q13263 OR8J3-204ENST00000642058 3806 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
TRIM28Q13263 LINC01902-203ENST00000637369 7356 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TRIM28Q13263 PPP1R9A-206ENST00000433360 5369 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
TRIM28Q13263 AC004656.1-201ENST00000568479 4951 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TRIM28Q13263 IBTK-206ENST00000503631 3560 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
TRIM28Q13263 LCA5L-218ENST00000485895 2551 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
TRIM28Q13263 LMOD2-202ENST00000458573 2346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TRIM28Q13263 RAD17P1-201ENST00000418130 2042 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TRIM28Q13263 TCN1-201ENST00000257264 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
TRIM28Q13263 IGKV7-3-201ENST00000357453 298 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TRIM28Q13263 Y_RNA.167-201ENST00000363735 109 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TRIM28Q13263 RNA5SP447-201ENST00000363749 119 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TRIM28Q13263 RNU4-48P-201ENST00000365559 182 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TRIM28Q13263 SPRR2E-202ENST00000368751 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
TRIM28Q13263 SAR1A-201ENST00000373236 437 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
TRIM28Q13263 Y_RNA.463-201ENST00000384271 102 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TRIM28Q13263 SOD2P1-201ENST00000396543 562 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TRIM28Q13263 AP000580.1-201ENST00000404439 358 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TRIM28Q13263 RNU6-954P-201ENST00000411355 107 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TRIM28Q13263 PRELID3BP11-201ENST00000414230 479 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TRIM28Q13263 AC092811.1-201ENST00000428642 397 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TRIM28Q13263 TPT1P12-201ENST00000448968 492 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TRIM28Q13263 TMEM212-AS1-201ENST00000449106 427 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TRIM28Q13263 LINC01729-201ENST00000450640 358 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TRIM28Q13263 AL035409.1-201ENST00000454305 497 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TRIM28Q13263 AP1S2P1-201ENST00000457344 379 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TRIM28Q13263 AC026979.1-201ENST00000492525 396 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TRIM28Q13263 RPL22P13-201ENST00000493291 347 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TRIM28Q13263 RPL39P5-202ENST00000512505 151 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TRIM28Q13263 AC109454.3-201ENST00000512748 669 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TRIM28Q13263 AC010280.1-201ENST00000515199 340 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TRIM28Q13263 RNU6-1038P-201ENST00000516516 104 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TRIM28Q13263 AC011586.1-201ENST00000521055 458 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TRIM28Q13263 THUMPD3-AS1-215ENST00000521609 793 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TRIM28Q13263 AC022882.1-201ENST00000532142 501 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TRIM28Q13263 AL355095.1-201ENST00000554451 539 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TRIM28Q13263 MIR4277-201ENST00000578298 84 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TRIM28Q13263 BNIP3P16-201ENST00000589779 534 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TRIM28Q13263 AC012409.4-201ENST00000612923 249 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TRIM28Q13263 AC130324.3-201ENST00000614165 542 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TRIM28Q13263 DARS-AS1-225ENST00000615163 824 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TRIM28Q13263 POLR2B-203ENST00000431623 3666 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TRIM28Q13263 LINC01538-201ENST00000588074 2408 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
TRIM28Q13263 ARHGAP28-205ENST00000531294 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TRIM28Q13263 AC093311.1-201ENST00000506586 2021 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TRIM28Q13263 AC092125.1-201ENST00000562568 1995 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TRIM28Q13263 PEX2-201ENST00000357039 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
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