Protein–RNA interactions for Protein: Q13133

NR1H3, Oxysterols receptor LXR-alpha, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H3Q13133 AC011604.2-201ENST00000381541 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
NR1H3Q13133 AC048341.2-201ENST00000550290 8693 ntTSL 4 BASIC6□□□□□ -1.45
NR1H3Q13133 ZNF93-201ENST00000343769 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
NR1H3Q13133 DYRK1A-202ENST00000339659 8654 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
NR1H3Q13133 ZNF271P-205ENST00000639248 4573 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
NR1H3Q13133 DPP8-203ENST00000341861 8699 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
NR1H3Q13133 GPR18-203ENST00000397473 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
NR1H3Q13133 SNORA64.1-201ENST00000362600 132 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
NR1H3Q13133 MIR517A-201ENST00000385001 87 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
NR1H3Q13133 PPP3R1-202ENST00000409377 684 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
NR1H3Q13133 LINC01203-201ENST00000419566 580 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
NR1H3Q13133 AL160275.3-201ENST00000423876 471 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
NR1H3Q13133 ELOCP18-201ENST00000434209 337 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
NR1H3Q13133 AL162384.1-201ENST00000437881 499 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
NR1H3Q13133 DYNLT3P2-201ENST00000442517 295 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
NR1H3Q13133 AL163193.1-201ENST00000444895 788 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
NR1H3Q13133 MIR4435-2HG-213ENST00000451884 423 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
NR1H3Q13133 AC104634.1-201ENST00000452720 462 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
NR1H3Q13133 AC004692.2-202ENST00000458680 478 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
NR1H3Q13133 RPL31P60-201ENST00000478450 367 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
NR1H3Q13133 AC010255.1-201ENST00000504829 731 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
NR1H3Q13133 RNU6-408P-201ENST00000515910 100 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
NR1H3Q13133 RNU2-53P-201ENST00000516257 147 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
NR1H3Q13133 AC026470.2-201ENST00000561492 181 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
NR1H3Q13133 SUB1P3-201ENST00000564581 315 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
NR1H3Q13133 PWRN1-204ENST00000565241 480 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
NR1H3Q13133 AC109446.1-201ENST00000566172 220 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
NR1H3Q13133 PINLYP-205ENST00000569031 557 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
NR1H3Q13133 MIR1273E-201ENST00000581165 102 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
NR1H3Q13133 MIR4443-201ENST00000585052 53 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
NR1H3Q13133 ZNF616-202ENST00000596290 568 ntTSL 4 BASIC5.99□□□□□ -1.45
NR1H3Q13133 AC002044.1-201ENST00000606707 158 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
NR1H3Q13133 RDM1-226ENST00000619828 687 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
NR1H3Q13133 LAMTOR5-AS1-244ENST00000629484 780 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
NR1H3Q13133 GOLT1B-210ENST00000631252 223 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
NR1H3Q13133 LINC00240-204ENST00000607607 5607 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
NR1H3Q13133 ACSL5-204ENST00000393081 3380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
NR1H3Q13133 AC090510.1-202ENST00000500850 2017 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
NR1H3Q13133 DLG1-210ENST00000422288 2854 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
NR1H3Q13133 RNF20-202ENST00000389120 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
NR1H3Q13133 ABCB5-201ENST00000258738 2906 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
NR1H3Q13133 HUWE1-214ENST00000612484 14311 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
NR1H3Q13133 KMT5B-215ENST00000615954 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
NR1H3Q13133 N4BP2L2-IT2-201ENST00000629393 4890 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
NR1H3Q13133 AGO2-201ENST00000220592 14581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
NR1H3Q13133 BACH1-201ENST00000286800 5669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
NR1H3Q13133 AC138393.1-203ENST00000327086 343 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
NR1H3Q13133 Y_RNA.106-201ENST00000363189 100 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
NR1H3Q13133 RN7SKP124-201ENST00000364730 341 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
NR1H3Q13133 SNORD14.1-201ENST00000365609 90 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
NR1H3Q13133 SNORA5.1-201ENST00000384275 131 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
NR1H3Q13133 Y_RNA.480-201ENST00000384364 102 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
NR1H3Q13133 MIR1252-201ENST00000408861 65 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
NR1H3Q13133 EEF1A1P29-201ENST00000416082 1096 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
NR1H3Q13133 U51244.1-201ENST00000423120 374 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
NR1H3Q13133 AC016712.1-201ENST00000431088 378 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
NR1H3Q13133 RPS15AP10-201ENST00000432472 382 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
NR1H3Q13133 SUMO1P3-201ENST00000439961 304 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
NR1H3Q13133 USP12-AS1-201ENST00000440657 268 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
NR1H3Q13133 AC018359.1-201ENST00000442567 574 ntTSL 4 BASIC5.98□□□□□ -1.45
NR1H3Q13133 IGHV5-78-201ENST00000450948 295 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
NR1H3Q13133 RPS24P6-201ENST00000452670 400 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
NR1H3Q13133 RNU7-187P-201ENST00000458985 68 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
NR1H3Q13133 RNU6-953P-201ENST00000459154 107 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
NR1H3Q13133 RPS23P6-201ENST00000466136 431 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
NR1H3Q13133 AC008571.1-201ENST00000467232 300 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
NR1H3Q13133 OARD1-211ENST00000480585 829 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
NR1H3Q13133 CREM-238ENST00000488741 651 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
NR1H3Q13133 AC034238.3-201ENST00000512349 591 ntTSL 4 BASIC5.98□□□□□ -1.45
NR1H3Q13133 AC021678.3-201ENST00000517893 476 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
NR1H3Q13133 LINC00644-201ENST00000555156 295 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
NR1H3Q13133 AC068397.1-201ENST00000560337 531 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
NR1H3Q13133 AP001011.1-202ENST00000581172 667 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
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NR1H3Q13133 HCG18-243ENST00000602498 327 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
NR1H3Q13133 AC016727.2-201ENST00000603988 621 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
NR1H3Q13133 HMGN2P28-201ENST00000606102 262 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
NR1H3Q13133 AL138825.1-201ENST00000618587 192 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
NR1H3Q13133 AL513314.2-201ENST00000621440 545 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
NR1H3Q13133 SNHG5-214ENST00000623001 598 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
NR1H3Q13133 SEMA6D-210ENST00000558816 4419 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
NR1H3Q13133 SERPINA7-202ENST00000372563 1600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
NR1H3Q13133 ADAMDEC1-201ENST00000256412 2348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
NR1H3Q13133 SOX2-OT-218ENST00000498731 3576 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
NR1H3Q13133 KYAT3-203ENST00000370491 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
NR1H3Q13133 MTND5P7-201ENST00000413558 1798 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
NR1H3Q13133 PPP1R9A-206ENST00000433360 5369 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
NR1H3Q13133 FLRT3-202ENST00000378053 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
NR1H3Q13133 KCNC4-201ENST00000369787 18750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
NR1H3Q13133 LRRC49-223ENST00000560369 2586 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
NR1H3Q13133 ASB14-201ENST00000389601 3175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
NR1H3Q13133 AP005435.3-201ENST00000531260 3198 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
NR1H3Q13133 SYNCRIP-204ENST00000616122 6764 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
NR1H3Q13133 ZNF615-201ENST00000376716 4048 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
NR1H3Q13133 ATXN2-215ENST00000542287 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
NR1H3Q13133 TET1-201ENST00000373644 9288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
NR1H3Q13133 CFAP126-201ENST00000367974 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
NR1H3Q13133 AC097374.1-203ENST00000400783 485 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
NR1H3Q13133 AL590704.1-201ENST00000402856 794 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
NR1H3Q13133 MTERF4-204ENST00000406593 802 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
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