Protein–RNA interactions for Protein: Q13061

TRDN, Triadin, humanhuman

Predictions only

Length 729 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDNQ13061 JCHAIN-206ENST00000543780 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
TRDNQ13061 COPS2-203ENST00000542928 1580 ntTSL 2 BASIC3.07□□□□□ -1.92
TRDNQ13061 TPTE2-202ENST00000382978 1677 ntTSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
TRDNQ13061 SACS-201ENST00000382292 15324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
TRDNQ13061 TSGA10-205ENST00000410001 3036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
TRDNQ13061 CDC27-207ENST00000531206 3177 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
TRDNQ13061 ZNF470-202ENST00000391709 6601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
TRDNQ13061 PCM1-222ENST00000524226 5955 ntTSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
TRDNQ13061 DNAH7-201ENST00000312428 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
TRDNQ13061 CFHR4-203ENST00000367418 1066 ntTSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
TRDNQ13061 CYLC2-201ENST00000374798 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
TRDNQ13061 SNORA51.12-201ENST00000384448 134 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TRDNQ13061 SNORA1.3-201ENST00000384676 136 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TRDNQ13061 ARF4P3-201ENST00000397387 509 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TRDNQ13061 EFCAB14-AS1-201ENST00000418985 491 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
TRDNQ13061 NUP35P1-201ENST00000422734 947 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TRDNQ13061 AL603910.1-201ENST00000423099 370 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
TRDNQ13061 MTND4LP7-201ENST00000431728 294 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TRDNQ13061 AL590867.3-201ENST00000436953 438 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
TRDNQ13061 AL590664.1-201ENST00000448065 339 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TRDNQ13061 LINC01625-201ENST00000454788 1690 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
TRDNQ13061 AL049873.1-201ENST00000480540 376 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TRDNQ13061 SRI-210ENST00000490437 570 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
TRDNQ13061 MTND4P8-201ENST00000514997 1362 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TRDNQ13061 SPINK7-205ENST00000523535 299 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
TRDNQ13061 AHI1-217ENST00000534469 680 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
TRDNQ13061 AP000462.3-201ENST00000545593 330 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
TRDNQ13061 AL139021.2-201ENST00000556390 399 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
TRDNQ13061 LINC02328-203ENST00000557195 682 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
TRDNQ13061 MIR5194-201ENST00000582634 120 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TRDNQ13061 BX664608.1-201ENST00000610519 487 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TRDNQ13061 AL355810.1-201ENST00000614629 552 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TRDNQ13061 Clostridiales-1.2-201ENST00000636724 160 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TRDNQ13061 AMY2B-208ENST00000610648 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
TRDNQ13061 RPS4XP3-201ENST00000398541 413 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
TRDNQ13061 AL139039.1-201ENST00000401900 692 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
TRDNQ13061 SSXP10-201ENST00000402595 565 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
TRDNQ13061 LINC00427-201ENST00000412722 430 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
TRDNQ13061 OFD1P11Y-201ENST00000418213 1177 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
TRDNQ13061 AC006548.1-201ENST00000427470 102 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
TRDNQ13061 SUMO1P4-201ENST00000429430 302 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
TRDNQ13061 AL118523.1-201ENST00000444436 480 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
TRDNQ13061 AC092685.1-201ENST00000447960 1243 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
TRDNQ13061 LINC01828-202ENST00000450294 955 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
TRDNQ13061 GRM7-AS3-208ENST00000455623 947 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
TRDNQ13061 AL031183.1-201ENST00000457667 207 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
TRDNQ13061 AC126182.1-201ENST00000478134 357 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
TRDNQ13061 RN7SL432P-201ENST00000484057 298 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
TRDNQ13061 LINC01326-201ENST00000495159 755 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
TRDNQ13061 RPL37P25-201ENST00000507308 276 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
TRDNQ13061 AC021491.3-201ENST00000513378 156 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
TRDNQ13061 OR10V3P-201ENST00000525712 725 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
TRDNQ13061 OR5V1-216ENST00000543825 1048 ntAPPRIS P1 BASIC3.05□□□□□ -1.92
TRDNQ13061 AL356575.1-201ENST00000603008 283 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
TRDNQ13061 AP003485.2-201ENST00000623636 610 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
TRDNQ13061 CR381572.1-201ENST00000625098 102 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
TRDNQ13061 CNOT1-223ENST00000628857 291 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
TRDNQ13061 AC245427.3-201ENST00000632041 51 ntAPPRIS P1 BASIC3.05□□□□□ -1.92
TRDNQ13061 NOC3L-201ENST00000371361 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
TRDNQ13061 ANKAR-209ENST00000520309 4410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
TRDNQ13061 Z82195.2-201ENST00000612348 18351 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
TRDNQ13061 ZNF626-204ENST00000612591 4404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
TRDNQ13061 PP2D1-202ENST00000389050 2151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
TRDNQ13061 DENND4A-202ENST00000443035 8665 ntTSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
TRDNQ13061 AL672167.1-206ENST00000356293 943 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
TRDNQ13061 RNA5SP258-201ENST00000362750 119 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
TRDNQ13061 OR6C4-201ENST00000394256 1046 ntAPPRIS P1 BASIC3.04□□□□□ -1.92
TRDNQ13061 EIF4EBP2P3-201ENST00000403144 334 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
TRDNQ13061 AC006150.1-201ENST00000412014 263 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
TRDNQ13061 AC010723.1-201ENST00000435111 540 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
TRDNQ13061 CR769767.1-201ENST00000436337 346 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
TRDNQ13061 YWHAZP8-201ENST00000436935 731 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
TRDNQ13061 LSM1P1-201ENST00000438629 273 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
TRDNQ13061 CACYBPP2-201ENST00000453625 678 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
TRDNQ13061 MRPL35P4-201ENST00000453682 566 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
TRDNQ13061 AC015908.1-201ENST00000478739 476 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
TRDNQ13061 AC008885.2-201ENST00000509506 930 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
TRDNQ13061 LINC02269-201ENST00000509968 511 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
TRDNQ13061 AC090833.1-201ENST00000513853 806 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
TRDNQ13061 SNORA31.8-201ENST00000516327 108 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
TRDNQ13061 SNORA48.9-201ENST00000516419 162 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
TRDNQ13061 PKIA-203ENST00000518467 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
TRDNQ13061 AP001804.3-201ENST00000525146 880 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
TRDNQ13061 C1DP5-201ENST00000525775 383 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
TRDNQ13061 ZDHHC20P3-201ENST00000531576 336 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
TRDNQ13061 AC243972.3-201ENST00000539655 198 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
TRDNQ13061 CKS1BP1-201ENST00000555221 240 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
TRDNQ13061 AL133279.2-201ENST00000556546 428 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
TRDNQ13061 MIR5092-201ENST00000583139 88 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
TRDNQ13061 AC018618.2-201ENST00000604770 446 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
TRDNQ13061 WARS-244ENST00000627608 123 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
TRDNQ13061 U6.107-201ENST00000637108 79 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
TRDNQ13061 HELLS-201ENST00000239026 2740 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
TRDNQ13061 CFHR3-201ENST00000367425 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
TRDNQ13061 TPTE2-203ENST00000390680 1558 ntTSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
TRDNQ13061 AC003984.1-201ENST00000450977 4104 ntTSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
TRDNQ13061 ZNF271P-202ENST00000465539 1970 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
TRDNQ13061 AL356057.2-201ENST00000403318 432 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
TRDNQ13061 LINC01967-202ENST00000437506 515 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
TRDNQ13061 AC069540.2-201ENST00000441776 351 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 239.3 ms