Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 AL357514.1-201ENST00000446322 488 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
PRDM2Q13029 AC092162.2-204ENST00000451851 566 ntTSL 4 BASIC3.41□□□□□ -1.86
PRDM2Q13029 AF117829.1-209ENST00000523995 767 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
PRDM2Q13029 AL353708.2-201ENST00000567486 447 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
PRDM2Q13029 XIRP2-201ENST00000295237 5246 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
PRDM2Q13029 CADM2-AS1-201ENST00000476021 2656 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
PRDM2Q13029 OR8K5-201ENST00000313447 924 ntAPPRIS P1 BASIC3.41□□□□□ -1.86
PRDM2Q13029 AL136322.1-201ENST00000422250 548 ntTSL 4 BASIC3.41□□□□□ -1.86
PRDM2Q13029 AL445669.2-201ENST00000454425 421 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
PRDM2Q13029 AC017007.3-201ENST00000479865 435 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
PRDM2Q13029 OR52A4P-203ENST00000498233 1014 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
PRDM2Q13029 TRAV11-201ENST00000539512 339 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
PRDM2Q13029 G2E3-AS1-204ENST00000552511 402 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
PRDM2Q13029 MIR3683-201ENST00000580847 82 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
PRDM2Q13029 AC027514.2-201ENST00000591014 637 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
PRDM2Q13029 AC068790.3-201ENST00000602988 553 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
PRDM2Q13029 RPAP2P1-201ENST00000603626 1168 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
PRDM2Q13029 AC131902.3-201ENST00000611767 581 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
PRDM2Q13029 CAPZA2-215ENST00000639546 129 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
PRDM2Q13029 LPP-221ENST00000618621 18277 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
PRDM2Q13029 LPP-222ENST00000640853 18277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
PRDM2Q13029 AC010329.2-201ENST00000595195 2737 ntBASIC3.4□□□□□ -1.86
PRDM2Q13029 LINC01510-201ENST00000441991 468 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
PRDM2Q13029 IKZF2-209ENST00000442445 551 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
PRDM2Q13029 SNORD108-201ENST00000459332 71 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
PRDM2Q13029 LNX1-AS2-201ENST00000502410 347 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
PRDM2Q13029 LINC01333-201ENST00000508083 724 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
PRDM2Q13029 LINC02300-201ENST00000549742 665 ntTSL 4 BASIC3.4□□□□□ -1.87
PRDM2Q13029 AC010735.1-201ENST00000567305 1026 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
PRDM2Q13029 AL137847.3-201ENST00000611521 109 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
PRDM2Q13029 AC002064.3-201ENST00000623448 346 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
PRDM2Q13029 LIPI-204ENST00000614229 1439 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
PRDM2Q13029 RNU4-62P-201ENST00000410125 130 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
PRDM2Q13029 AF241725.1-201ENST00000416182 480 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
PRDM2Q13029 AC129850.1-201ENST00000436203 508 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
PRDM2Q13029 AC002386.1-201ENST00000436714 398 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
PRDM2Q13029 AC005539.1-201ENST00000443768 1479 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
PRDM2Q13029 AC092155.1-201ENST00000444672 573 ntTSL 4 BASIC3.39□□□□□ -1.87
PRDM2Q13029 AC093392.2-201ENST00000450682 337 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
PRDM2Q13029 AL353811.1-201ENST00000602851 736 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
PRDM2Q13029 AL160237.3-201ENST00000604114 1013 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
PRDM2Q13029 MFSD8-245ENST00000641743 948 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
PRDM2Q13029 AL358453.1-201ENST00000422522 250 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
PRDM2Q13029 FABP5P13-201ENST00000452144 328 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
PRDM2Q13029 AC007182.2-201ENST00000489251 402 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
PRDM2Q13029 AC004053.1-201ENST00000515127 575 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
PRDM2Q13029 AL133393.1-201ENST00000603277 287 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
PRDM2Q13029 AL139811.1-201ENST00000424779 2299 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
PRDM2Q13029 AC011978.2-201ENST00000569835 2054 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
PRDM2Q13029 SNORA40.18-201ENST00000391200 128 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
PRDM2Q13029 AL627390.1-201ENST00000396055 340 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
PRDM2Q13029 AC069257.1-202ENST00000425275 422 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
PRDM2Q13029 AC012181.1-201ENST00000479895 423 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
PRDM2Q13029 NAMPTP2-201ENST00000505629 1115 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
PRDM2Q13029 LNX1-AS1-202ENST00000510785 550 ntTSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
PRDM2Q13029 AC009120.5-201ENST00000561669 475 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
PRDM2Q13029 AC044873.1-201ENST00000580487 399 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
PRDM2Q13029 AL359821.1-201ENST00000605519 182 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
PRDM2Q13029 AC009570.1-201ENST00000609599 745 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
PRDM2Q13029 RBM12B-AS1-201ENST00000623283 653 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
PRDM2Q13029 AC104332.2-201ENST00000429959 156 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
PRDM2Q13029 RPS26P30-201ENST00000443431 335 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
PRDM2Q13029 LRRC37A5P-203ENST00000580181 585 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
PRDM2Q13029 AC023043.3-201ENST00000593113 385 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
PRDM2Q13029 RNA5SP190-201ENST00000365222 118 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
PRDM2Q13029 SPANXN3-201ENST00000370503 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
PRDM2Q13029 SDR42E1P3-201ENST00000438345 502 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
PRDM2Q13029 RPL23AP76-201ENST00000441860 458 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
PRDM2Q13029 AC078980.1-201ENST00000485384 262 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
PRDM2Q13029 AC025881.1-201ENST00000518851 512 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
PRDM2Q13029 AC007686.2-201ENST00000554043 469 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
PRDM2Q13029 MIR4716-201ENST00000579628 84 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
PRDM2Q13029 AC084768.2-201ENST00000622736 221 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
PRDM2Q13029 CCDC30-203ENST00000428554 3063 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
PRDM2Q13029 GLIPR1-201ENST00000266659 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
PRDM2Q13029 ANKRD36-208ENST00000639751 3090 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
PRDM2Q13029 PGAP1-203ENST00000409188 1246 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
PRDM2Q13029 RPL23AP39-201ENST00000415533 405 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
PRDM2Q13029 RPL7P46-201ENST00000425129 740 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
PRDM2Q13029 AC073342.1-202ENST00000446192 457 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
PRDM2Q13029 ARPC3P2-201ENST00000457786 533 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
PRDM2Q13029 HMGB3P15-201ENST00000507326 574 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
PRDM2Q13029 AC090023.1-201ENST00000545750 443 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
PRDM2Q13029 ZNF788-206ENST00000596883 692 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
PRDM2Q13029 AC090425.2-201ENST00000608818 501 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
PRDM2Q13029 AL354810.1-201ENST00000618134 635 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
PRDM2Q13029 AL512643.1-201ENST00000635735 524 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
PRDM2Q13029 MBNL3-205ENST00000370857 8760 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
PRDM2Q13029 AL138785.1-201ENST00000425821 331 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
PRDM2Q13029 AC020978.4-201ENST00000569088 460 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
PRDM2Q13029 MIR4303-201ENST00000581299 66 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
PRDM2Q13029 VN1R84P-201ENST00000593697 235 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
PRDM2Q13029 AGTR1-204ENST00000418473 2071 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
PRDM2Q13029 TDRD15-202ENST00000622654 5805 ntAPPRIS P1 BASIC3.34□□□□□ -1.87
PRDM2Q13029 CEP57-213ENST00000541150 2911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
PRDM2Q13029 SNORA67.5-201ENST00000391036 107 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
PRDM2Q13029 AL590867.3-201ENST00000436953 438 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
PRDM2Q13029 AC140059.1-201ENST00000489238 361 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
PRDM2Q13029 RNU6-826P-201ENST00000516827 104 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
PRDM2Q13029 AC021698.1-201ENST00000524858 716 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.6 ms