Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 LINC01487-202ENST00000490497 423 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 AL024509.2-201ENST00000493462 493 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 OR2A20P-203ENST00000498397 1268 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 LINC01327-201ENST00000498413 535 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 SAR1B-204ENST00000502539 708 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 OR5BM1P-201ENST00000512021 366 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 AC098868.1-201ENST00000512628 624 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 GYPA-209ENST00000512789 258 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 AC034159.1-201ENST00000513885 583 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 RNA5SP216-201ENST00000516111 123 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 RNU4-60P-201ENST00000517239 135 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 AC107909.2-201ENST00000520844 493 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 AC103952.1-201ENST00000521872 590 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 AC090857.2-201ENST00000526362 723 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 OR4P1P-201ENST00000530808 1136 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 AL133166.1-201ENST00000551040 1034 ntTSL 4 BASIC3.8□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 AC123905.1-201ENST00000552098 541 ntTSL 4 BASIC3.8□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 AC090877.1-201ENST00000561418 344 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 AC016597.1-201ENST00000564893 528 ntTSL 4 BASIC3.8□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 AC037471.2-201ENST00000564941 598 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 AC107954.1-201ENST00000565906 727 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 MIR5187-201ENST00000583479 76 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 SATB1-AS1-207ENST00000593741 955 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 AL590229.1-201ENST00000603497 542 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 AL390208.1-201ENST00000605885 644 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 AC073114.1-201ENST00000612027 490 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 AL442067.2-201ENST00000614033 363 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 MIR7975-201ENST00000619350 68 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 AC091925.2-201ENST00000625059 256 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 CRISPLD1-205ENST00000523524 2100 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 C12orf4-201ENST00000261250 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 GALNT1-201ENST00000269195 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 LINC02510-201ENST00000509798 1576 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 MTCO1P24-201ENST00000515438 1558 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 RGS13-201ENST00000391995 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 CR383658.2-201ENST00000547576 1525 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 EVI5-208ENST00000540033 7436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 DOCK7-202ENST00000340370 6731 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 XKR3-201ENST00000331428 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 RNU6-28P-201ENST00000362378 107 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 RNU6-343P-201ENST00000364709 104 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 U3.15-201ENST00000365398 212 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 ESD-201ENST00000378697 1079 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 RNVU1-14-201ENST00000384770 164 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 SNORA26.8-201ENST00000391306 124 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 Z98941.1-201ENST00000407764 100 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 NPM1P11-201ENST00000417106 855 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 OFD1P13Y-201ENST00000431179 1232 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 TTTY20-201ENST00000434487 259 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 MTCYBP45-201ENST00000435243 565 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 Z74696.2-201ENST00000436514 498 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 AL590399.3-201ENST00000438072 543 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 AL353613.1-201ENST00000443163 530 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 PAXBP1P1-201ENST00000449315 447 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 AL365318.1-201ENST00000453128 705 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 SUMO2P2-201ENST00000456482 255 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 AC087312.1-201ENST00000471411 480 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 LEKR1-206ENST00000483177 546 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 AC068724.1-201ENST00000487100 792 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 AC080014.1-201ENST00000496877 1201 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 LINC02379-201ENST00000505741 300 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 MRPL36-203ENST00000505818 595 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 LINC02496-201ENST00000509559 584 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 TMEM248P1-201ENST00000510579 951 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 MTND5P13-201ENST00000513046 1079 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 RN7SKP116-201ENST00000516902 319 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 SUMO2P20-201ENST00000520803 283 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 AC022695.1-201ENST00000522089 237 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 OR6C7P-201ENST00000547875 934 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 AL160191.1-202ENST00000554008 576 ntTSL 4 BASIC3.79□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 LINC01491-201ENST00000558434 505 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 ZNF415P1-201ENST00000582279 1166 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 MIR5195-201ENST00000583555 115 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 AC006116.8-203ENST00000587448 465 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 BNIP3P23-201ENST00000599655 511 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 AC244505.7-201ENST00000599675 272 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 AL590235.2-201ENST00000602641 632 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 AL355812.1-201ENST00000603215 216 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 MIR7844-201ENST00000616161 122 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 AL357080.1-201ENST00000617394 239 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 Z69908.1-201ENST00000622603 247 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 AC040168.1-201ENST00000623594 991 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 AC098617.1-218ENST00000628836 624 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 R3HDM1-220ENST00000628915 4325 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 GABRG2-213ENST00000639046 3058 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 STEAP4-202ENST00000380079 9988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 PRB2-201ENST00000389362 1429 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 TCP11X1-203ENST00000623912 1715 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 ZNF117-203ENST00000610793 1374 ntTSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 LMNTD1-204ENST00000458174 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 AC097714.1-201ENST00000511272 1647 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 MMS22L-202ENST00000369251 3949 ntTSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 FMNL2-202ENST00000475377 3648 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 SETDB2-202ENST00000317257 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 SLITRK5-201ENST00000325089 21103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 Y_RNA.436-201ENST00000384097 102 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 RNA5SP56-201ENST00000410277 118 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 FGF12-AS1-201ENST00000414920 580 ntTSL 4 BASIC3.78□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 AC127526.1-201ENST00000417526 366 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 AC107081.2-201ENST00000425779 802 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.3 ms