Protein–RNA interactions for Protein: Q12980

NPRL3, GATOR complex protein NPRL3, humanhuman

Predictions only

Length 569 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPRL3Q12980 AL450472.3-201ENST00000615578 367 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
NPRL3Q12980 OR8H2-202ENST00000618136 1038 ntAPPRIS ALT1 BASIC3.3□□□□□ -1.88
NPRL3Q12980 AL357559.1-201ENST00000622228 274 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
NPRL3Q12980 TTN-AS1-263ENST00000627527 784 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
NPRL3Q12980 ESCO1-201ENST00000269214 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
NPRL3Q12980 C5orf51-201ENST00000381647 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
NPRL3Q12980 AL513302.2-201ENST00000562313 1842 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
NPRL3Q12980 OR52E2-201ENST00000321522 978 ntAPPRIS P1 BASIC3.29□□□□□ -1.88
NPRL3Q12980 AL161781.1-201ENST00000354277 403 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
NPRL3Q12980 SNORA14A-201ENST00000364773 135 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
NPRL3Q12980 SKINT1L-201ENST00000401057 817 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
NPRL3Q12980 RNA5SP31-201ENST00000411144 127 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
NPRL3Q12980 RPS7P13-201ENST00000413955 498 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
NPRL3Q12980 BX842559.1-201ENST00000419615 532 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
NPRL3Q12980 GRM7-AS1-201ENST00000420230 430 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
NPRL3Q12980 AL590783.1-201ENST00000424138 456 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
NPRL3Q12980 AC096558.1-202ENST00000442794 561 ntTSL 4 BASIC3.29□□□□□ -1.88
NPRL3Q12980 LINC00302-201ENST00000444515 302 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
NPRL3Q12980 AC002381.1-201ENST00000447049 280 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
NPRL3Q12980 MTUS2-AS2-203ENST00000452602 651 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
NPRL3Q12980 UBDP1-202ENST00000457888 382 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
NPRL3Q12980 RPL21P8-201ENST00000465083 535 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
NPRL3Q12980 RN7SL442P-201ENST00000473804 320 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
NPRL3Q12980 RPL31P60-201ENST00000478450 367 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
NPRL3Q12980 GTF2IP9-201ENST00000502460 301 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
NPRL3Q12980 AC016933.1-201ENST00000504735 539 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
NPRL3Q12980 HMGN1P11-201ENST00000508668 303 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
NPRL3Q12980 AC008957.1-201ENST00000510740 478 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
NPRL3Q12980 SCARNA14-201ENST00000516903 136 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
NPRL3Q12980 AC027701.1-201ENST00000520155 823 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
NPRL3Q12980 COX6CP8-201ENST00000522620 226 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
NPRL3Q12980 MTCO1P49-201ENST00000523429 802 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
NPRL3Q12980 AC015771.1-201ENST00000527283 554 ntTSL 4 BASIC3.29□□□□□ -1.88
NPRL3Q12980 AC022240.1-201ENST00000532065 684 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
NPRL3Q12980 AF111169.4-202ENST00000553507 262 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
NPRL3Q12980 DUXAP6-201ENST00000553858 601 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
NPRL3Q12980 AL132857.1-201ENST00000555180 708 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
NPRL3Q12980 AC118755.1-201ENST00000572923 195 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
NPRL3Q12980 MTCO2P2-201ENST00000591258 225 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
NPRL3Q12980 AL031985.2-201ENST00000600955 480 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
NPRL3Q12980 ACTR3BP1-201ENST00000605584 1247 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
NPRL3Q12980 AC006270.3-201ENST00000605967 1036 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
NPRL3Q12980 OR5H6-201ENST00000615035 1113 ntAPPRIS P1 BASIC3.29□□□□□ -1.88
NPRL3Q12980 AC110801.1-201ENST00000623590 212 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
NPRL3Q12980 SNORA50A-202ENST00000629536 136 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
NPRL3Q12980 LINC01002-215ENST00000632203 314 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
NPRL3Q12980 AP003171.2-202ENST00000634657 355 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
NPRL3Q12980 AC103988.1-201ENST00000566382 2177 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
NPRL3Q12980 MAPK10-322ENST00000641485 4530 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
NPRL3Q12980 NEB-218ENST00000603639 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
NPRL3Q12980 NEB-219ENST00000604864 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
NPRL3Q12980 CPXCR1-202ENST00000373111 1577 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
NPRL3Q12980 RNMT-206ENST00000589866 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
NPRL3Q12980 DICER1-203ENST00000526495 10331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
NPRL3Q12980 CCSER2-201ENST00000224756 7664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
NPRL3Q12980 RNU5A-1-201ENST00000362698 116 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
NPRL3Q12980 RNU4-92P-201ENST00000363783 136 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
NPRL3Q12980 RNU6-343P-201ENST00000364709 104 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
NPRL3Q12980 C1orf189-201ENST00000368525 387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
NPRL3Q12980 LGI1-201ENST00000371413 1247 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
NPRL3Q12980 RNU6-76P-201ENST00000384060 104 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
NPRL3Q12980 MIR134-201ENST00000385258 73 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
NPRL3Q12980 TRAJ32-201ENST00000390505 66 ntAPPRIS P1 BASIC3.28□□□□□ -1.88
NPRL3Q12980 EI24P2-201ENST00000397776 1076 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
NPRL3Q12980 RPL36AP36-201ENST00000418616 301 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
NPRL3Q12980 AL953862.1-201ENST00000423016 168 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
NPRL3Q12980 AL139118.1-201ENST00000432707 446 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
NPRL3Q12980 AL035246.1-201ENST00000433554 1255 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
NPRL3Q12980 MTND5P14-201ENST00000441481 1267 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
NPRL3Q12980 AL357552.1-201ENST00000445254 415 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
NPRL3Q12980 AL023581.2-201ENST00000454588 552 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
NPRL3Q12980 AL390783.1-203ENST00000457058 248 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
NPRL3Q12980 AC021205.2-201ENST00000480069 347 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
NPRL3Q12980 AP000563.1-201ENST00000490865 758 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
NPRL3Q12980 AC111000.2-201ENST00000507775 550 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
NPRL3Q12980 LINC02484-201ENST00000513843 546 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
NPRL3Q12980 AC026801.2-201ENST00000515352 425 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
NPRL3Q12980 FABP5P12-201ENST00000515543 389 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
NPRL3Q12980 RNU4ATAC3P-201ENST00000516699 126 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
NPRL3Q12980 RNU6-714P-201ENST00000516963 103 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
NPRL3Q12980 ZFAND1-217ENST00000521895 885 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
NPRL3Q12980 AP002768.1-201ENST00000526741 320 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
NPRL3Q12980 PLCZ1-203ENST00000534932 525 ntTSL 4 BASIC3.28□□□□□ -1.88
NPRL3Q12980 LINC02410-201ENST00000553095 393 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
NPRL3Q12980 PSMA4-206ENST00000558341 719 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
NPRL3Q12980 LINC02164-201ENST00000566684 272 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
NPRL3Q12980 FOPNL-208ENST00000575744 565 ntTSL 4 BASIC3.28□□□□□ -1.88
NPRL3Q12980 AC044873.1-201ENST00000580487 399 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
NPRL3Q12980 AL353997.4-201ENST00000586196 166 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
NPRL3Q12980 AC008507.1-201ENST00000587506 734 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
NPRL3Q12980 AL133393.1-201ENST00000603277 287 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
NPRL3Q12980 AL158211.4-201ENST00000606988 584 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
NPRL3Q12980 AC245297.2-201ENST00000610119 565 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
NPRL3Q12980 AC092442.1-201ENST00000636216 138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
NPRL3Q12980 SLC5A3-201ENST00000381151 11576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
NPRL3Q12980 GEN1-201ENST00000317402 9854 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
NPRL3Q12980 ADGRG2-206ENST00000360279 4702 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.89
NPRL3Q12980 DCUN1D1-201ENST00000292782 7954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
NPRL3Q12980 SLC39A10-202ENST00000409086 5432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
NPRL3Q12980 SYNE2-212ENST00000554584 20508 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.4 ms