Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 LINC00557-201ENST00000563184 1279 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
FOXF1Q12946 AC106734.1-201ENST00000568646 663 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
FOXF1Q12946 RPL23AP84-201ENST00000571193 464 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
FOXF1Q12946 MTCO3P24-201ENST00000572729 782 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
FOXF1Q12946 LINC01899-201ENST00000580323 312 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
FOXF1Q12946 NRBF2P5-201ENST00000603087 788 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
FOXF1Q12946 RPL12P50-201ENST00000603116 116 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
FOXF1Q12946 VIS1.1-201ENST00000610517 203 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
FOXF1Q12946 AC003001.2-201ENST00000616294 831 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
FOXF1Q12946 U4.3-201ENST00000621047 82 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
FOXF1Q12946 AC020923.1-201ENST00000624021 917 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
FOXF1Q12946 SATB1-AS1-258ENST00000629405 664 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
FOXF1Q12946 AL121594.5-201ENST00000631724 573 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
FOXF1Q12946 CRYM-AS1-204ENST00000637983 556 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
FOXF1Q12946 OR10AG1-202ENST00000641071 2807 ntAPPRIS P1 BASIC2.25□□□□□ -2.05
FOXF1Q12946 ZNF280D-204ENST00000558320 3666 ntTSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
FOXF1Q12946 CACNB4-238ENST00000636901 7706 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
FOXF1Q12946 ELF1-201ENST00000239882 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
FOXF1Q12946 GPR34-201ENST00000378138 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
FOXF1Q12946 AL049780.3-201ENST00000624612 1583 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
FOXF1Q12946 OFD1P6Y-202ENST00000451061 2724 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
FOXF1Q12946 OR52E2-201ENST00000321522 978 ntAPPRIS P1 BASIC2.24□□□□□ -2.05
FOXF1Q12946 RNU6-1339P-201ENST00000363574 91 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
FOXF1Q12946 U3.12-201ENST00000364498 214 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
FOXF1Q12946 CRP-202ENST00000368110 667 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
FOXF1Q12946 AL356057.1-202ENST00000402263 756 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
FOXF1Q12946 TANK-206ENST00000406287 875 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
FOXF1Q12946 LINC01040-201ENST00000425048 666 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
FOXF1Q12946 MAGEA8-AS1-201ENST00000427671 476 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
FOXF1Q12946 AC005160.1-201ENST00000432405 381 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
FOXF1Q12946 AC005208.1-201ENST00000435112 599 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
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FOXF1Q12946 GAS5-221ENST00000450589 632 ntTSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
FOXF1Q12946 NPM1P13-201ENST00000452663 865 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
FOXF1Q12946 RPS24P6-201ENST00000452670 400 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
FOXF1Q12946 NHS-AS1-201ENST00000452788 366 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
FOXF1Q12946 PCCA-AS1-203ENST00000455958 356 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
FOXF1Q12946 AL592161.1-201ENST00000456389 861 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
FOXF1Q12946 snoU13.3-201ENST00000459441 104 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
FOXF1Q12946 AL024509.2-201ENST00000493462 493 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
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FOXF1Q12946 AC107463.1-203ENST00000509713 284 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
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FOXF1Q12946 PANCR-202ENST00000513690 448 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
FOXF1Q12946 AC107463.1-202ENST00000514526 689 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
FOXF1Q12946 AC079917.1-201ENST00000527828 584 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
FOXF1Q12946 AC079917.1-202ENST00000534059 625 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
FOXF1Q12946 AL133279.2-201ENST00000556546 428 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
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FOXF1Q12946 PRKG2-206ENST00000545647 3852 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
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FOXF1Q12946 LINC02270-201ENST00000505386 610 ntTSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
FOXF1Q12946 AC119751.5-201ENST00000514077 770 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
FOXF1Q12946 RNU1-61P-201ENST00000516107 151 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
FOXF1Q12946 RNA5SP468-201ENST00000516782 93 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
FOXF1Q12946 AC023442.2-201ENST00000526455 270 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
FOXF1Q12946 AC107954.1-201ENST00000565906 727 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
FOXF1Q12946 MIR4504-201ENST00000577413 92 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
FOXF1Q12946 RPL26-207ENST00000583011 524 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
FOXF1Q12946 OR4G1P-201ENST00000588632 938 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
FOXF1Q12946 VN1R88P-201ENST00000596787 292 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
FOXF1Q12946 AC092070.1-201ENST00000600257 359 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
FOXF1Q12946 AC104237.2-201ENST00000612456 443 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
FOXF1Q12946 STATH-208ENST00000615994 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
FOXF1Q12946 DNAH7-201ENST00000312428 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
FOXF1Q12946 NEBL-202ENST00000377122 9216 ntTSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
FOXF1Q12946 SKIL-203ENST00000426052 2757 ntTSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
FOXF1Q12946 AL359893.1-201ENST00000447628 1580 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
FOXF1Q12946 MTCO1P6-201ENST00000481192 1384 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
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