Protein–RNA interactions for Protein: Q12774

ARHGEF5, Rho guanine nucleotide exchange factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,597 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF5Q12774 HMGB1P1-201ENST00000522557 636 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
ARHGEF5Q12774 MS4A4E-204ENST00000526086 460 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
ARHGEF5Q12774 AC087623.1-201ENST00000533301 377 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
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ARHGEF5Q12774 VN1R80P-201ENST00000597126 338 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
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ARHGEF5Q12774 AC090023.1-201ENST00000545750 443 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
ARHGEF5Q12774 XIST_intron.1-201ENST00000619444 68 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ARHGEF5Q12774 DENND4A-209ENST00000635620 5887 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
ARHGEF5Q12774 N4BP2L2-205ENST00000446957 2071 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
ARHGEF5Q12774 DEFB106A-201ENST00000335186 303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
ARHGEF5Q12774 RNA5SP37-201ENST00000365420 130 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ARHGEF5Q12774 LINC00368-201ENST00000422994 650 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
ARHGEF5Q12774 LINC01941-201ENST00000455174 624 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
ARHGEF5Q12774 AC089999.1-201ENST00000460336 374 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ARHGEF5Q12774 C1orf112-206ENST00000472795 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
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