Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 MYO3A-203ENST00000376302 2723 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 ZC3H14-205ENST00000393514 2195 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 CDC27P3-201ENST00000635418 1910 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 LINC02516-201ENST00000563724 1771 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 Y_RNA.188-201ENST00000363952 111 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 SNORD115-7-201ENST00000365306 82 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 RNU6-1040P-201ENST00000383974 107 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 RNU6-1032P-201ENST00000384100 107 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 Y_RNA.482-201ENST00000384377 111 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 IGLV7-43-201ENST00000390298 385 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 AL139397.2-201ENST00000404529 772 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 RNU6-954P-201ENST00000411355 107 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 POLHP1-201ENST00000411806 470 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 AC104333.2-201ENST00000422630 192 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 TRAPPC2P5-201ENST00000426293 308 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 AL031736.2-201ENST00000426573 787 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 AC093106.2-201ENST00000428212 385 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 LINC00844-201ENST00000432535 477 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 AL451139.1-201ENST00000434718 346 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 AL161722.2-201ENST00000434731 981 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 AC007879.4-201ENST00000440545 361 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 AL354949.1-201ENST00000446438 170 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 MTND1P17-201ENST00000448961 204 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 AL592431.1-201ENST00000451090 317 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 OR2AO1P-201ENST00000476497 403 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 RPL21P93-201ENST00000480465 489 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 RN7SL214P-201ENST00000487317 265 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 RNU2-10P-201ENST00000516375 211 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 AP005357.1-201ENST00000520749 476 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 OR5M1-201ENST00000526538 948 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 DEFB109D-201ENST00000529497 240 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 EIF4A2P5-201ENST00000529914 499 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 AC055878.1-201ENST00000531858 281 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 AL137161.1-201ENST00000532231 390 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 AC140847.1-201ENST00000538025 534 ntTSL 4 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 AL133271.1-201ENST00000538229 291 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 AL161670.1-201ENST00000554348 137 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 AC018904.1-201ENST00000560594 542 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 MIR4675-201ENST00000577898 77 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 AC090398.1-202ENST00000580403 457 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 AC114684.1-201ENST00000587659 352 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 AC098848.1-201ENST00000588466 567 ntTSL 4 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 AC003973.1-201ENST00000600071 546 ntTSL 4 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 AC080078.1-201ENST00000603643 410 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 AL513314.2-204ENST00000619187 459 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 AL162373.1-201ENST00000620433 407 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 AC074140.1-201ENST00000621617 208 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 SLC8A1-AS1-239ENST00000631142 623 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 DNAH14-208ENST00000430092 13763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 CSPP1-203ENST00000519668 3715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 VPS13D-214ENST00000620676 16320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 FAM184A-212ENST00000522284 2721 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 AL592148.3-201ENST00000608771 2646 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 KIAA1456-203ENST00000524591 9587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 TDRD3-204ENST00000377894 2484 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 SLC38A9-201ENST00000318672 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 C1D-201ENST00000355848 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 AC027228.2-201ENST00000567141 2154 ntBASIC4.84□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 AC009313.2-201ENST00000417893 1941 ntBASIC4.84□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 KLF12-201ENST00000377669 10637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 CTAGE5-210ENST00000553728 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 AC092747.4-201ENST00000620519 1861 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 ZNF845-201ENST00000458035 4311 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 LINC01109-201ENST00000603837 3081 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 LMNTD1-201ENST00000282881 1718 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 LINC01902-203ENST00000637369 7356 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 RPGRIP1L-201ENST00000262135 8195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 C11orf65-208ENST00000615746 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 OR10A3-202ENST00000642047 2650 ntAPPRIS P1 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 MS4A1-207ENST00000532073 2560 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 SLC2A3P1-201ENST00000519666 1451 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 ANK2-202ENST00000357077 14196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 GABRG2-217ENST00000639384 5360 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 DCX-202ENST00000358070 9405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 HTR1F-201ENST00000319595 3140 ntAPPRIS P1 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 RN7SKP162-201ENST00000363605 345 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 Y_RNA.212-201ENST00000364177 102 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 RNA5SP90-201ENST00000364801 99 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 SNORA63.7-201ENST00000365579 123 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 C1orf54-202ENST00000369099 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 RNU1-74P-201ENST00000384108 171 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 SNORA24.1-201ENST00000384401 135 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 Y_RNA.576-201ENST00000384781 102 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 AC009804.1-201ENST00000400949 179 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 AL136372.1-201ENST00000403060 228 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 Y_RNA.618-201ENST00000410949 107 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 AL117381.1-201ENST00000412972 374 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 LINC01507-201ENST00000417801 446 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 RPL9P9-201ENST00000418824 636 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 GYPB-201ENST00000429670 239 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 AP001434.1-201ENST00000444977 287 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 SFTA1P-203ENST00000446372 693 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 RPL21P23-201ENST00000446654 460 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 AC009987.1-201ENST00000446888 806 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 snoU13.7-201ENST00000459220 104 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 RN7SL629P-201ENST00000489622 285 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 LINC00492-201ENST00000504436 593 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 Y_RNA.661-201ENST00000516003 99 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 AC134698.5-201ENST00000519444 336 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CHRNEQ04844 TBCA-207ENST00000520039 157 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.3 ms