Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 HPVC1-201ENST00000629899 1198 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CENPEQ02224 OR4A15-202ENST00000641526 945 ntAPPRIS P1 BASIC1.61□□□□□ -2.15
CENPEQ02224 KTN1-206ENST00000413890 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.61□□□□□ -2.15
CENPEQ02224 SAMD9-201ENST00000379958 6852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.61□□□□□ -2.15
CENPEQ02224 JMJD1C-210ENST00000542921 8149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.61□□□□□ -2.15
CENPEQ02224 RPL7P37-201ENST00000425095 738 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CENPEQ02224 LINC01611-201ENST00000428896 477 ntTSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
CENPEQ02224 AC010890.1-201ENST00000454699 469 ntTSL 4 BASIC1.6□□□□□ -2.15
CENPEQ02224 AC027458.1-201ENST00000563639 613 ntTSL 1 (best) BASIC1.6□□□□□ -2.15
CENPEQ02224 AC006116.7-201ENST00000590141 756 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CENPEQ02224 C16orf97-206ENST00000622950 415 ntTSL 2 BASIC1.6□□□□□ -2.15
CENPEQ02224 EIF2A-201ENST00000273435 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.6□□□□□ -2.15
CENPEQ02224 DENND4A-202ENST00000443035 8665 ntTSL 1 (best) BASIC1.6□□□□□ -2.15
CENPEQ02224 PYGO1-201ENST00000302000 8488 ntTSL 1 (best) BASIC1.6□□□□□ -2.15
CENPEQ02224 RAD1P1-201ENST00000231383 813 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CENPEQ02224 SET-203ENST00000372688 801 ntTSL 2 BASIC1.6□□□□□ -2.15
CENPEQ02224 IGLV5-37-201ENST00000390300 374 ntAPPRIS P1 BASIC1.6□□□□□ -2.15
CENPEQ02224 AC073136.2-201ENST00000417282 849 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CENPEQ02224 YWHAZP7-201ENST00000436906 631 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CENPEQ02224 RPL36AP33-201ENST00000450395 310 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CENPEQ02224 RPS27P27-201ENST00000498779 255 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CENPEQ02224 AC112695.1-201ENST00000504213 592 ntTSL 2 BASIC1.6□□□□□ -2.15
CENPEQ02224 OR4H12P-201ENST00000556269 907 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CENPEQ02224 IL6ST-201ENST00000336909 8776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.6□□□□□ -2.15
CENPEQ02224 TBL1XR1-208ENST00000430069 7948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.6□□□□□ -2.15
CENPEQ02224 FBXO11-201ENST00000402508 3844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.6□□□□□ -2.15
CENPEQ02224 PSG8-202ENST00000401467 1686 ntTSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
CENPEQ02224 MAGI2-AS2-201ENST00000411616 476 ntTSL 2 BASIC1.6□□□□□ -2.15
CENPEQ02224 AIMP1P1-201ENST00000418670 937 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CENPEQ02224 AL078590.2-202ENST00000422736 568 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
CENPEQ02224 LINC01828-201ENST00000445514 531 ntTSL 4 BASIC1.6□□□□□ -2.15
CENPEQ02224 MTND3P6-201ENST00000485242 339 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CENPEQ02224 AC020651.1-201ENST00000490324 360 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
CENPEQ02224 LINC01359-207ENST00000634799 487 ntTSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
CENPEQ02224 MDM2-203ENST00000299252 966 ntTSL 1 (best) BASIC1.59□□□□□ -2.15
CENPEQ02224 MDM2-207ENST00000360430 891 ntTSL 1 (best) BASIC1.59□□□□□ -2.15
CENPEQ02224 CCDC169-203ENST00000379862 624 ntTSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
CENPEQ02224 RNU1-138P-201ENST00000384093 164 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CENPEQ02224 AC093157.1-203ENST00000416329 713 ntTSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
CENPEQ02224 AC006076.1-201ENST00000423233 345 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
CENPEQ02224 RN7SL297P-201ENST00000483161 293 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CENPEQ02224 AC093331.1-201ENST00000521474 169 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CENPEQ02224 MTERF3-205ENST00000524341 776 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
CENPEQ02224 OR4G1P-201ENST00000588632 938 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CENPEQ02224 AL035411.2-201ENST00000604022 421 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CENPEQ02224 PCDH11Y-203ENST00000362095 4220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.59□□□□□ -2.15
CENPEQ02224 ZNF644-212ENST00000621077 2056 ntTSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
CENPEQ02224 MGAT4C-207ENST00000552808 1937 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.59□□□□□ -2.15
CENPEQ02224 ANKRD18EP-201ENST00000405487 2632 ntBASIC1.59□□□□□ -2.16
CENPEQ02224 AP000852.1-201ENST00000472460 573 ntBASIC1.59□□□□□ -2.16
CENPEQ02224 GZMAP1-201ENST00000503054 631 ntBASIC1.59□□□□□ -2.16
CENPEQ02224 AL359233.1-201ENST00000554029 364 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.16
CENPEQ02224 AC099654.11-201ENST00000638857 294 ntBASIC1.59□□□□□ -2.16
CENPEQ02224 PALMD-205ENST00000615664 1844 ntTSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.16
CENPEQ02224 OR2L2-202ENST00000641771 4300 ntAPPRIS P1 BASIC1.58□□□□□ -2.16
CENPEQ02224 RPL39L-202ENST00000433055 749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.58□□□□□ -2.16
CENPEQ02224 AC007557.1-201ENST00000451711 541 ntTSL 2 BASIC1.58□□□□□ -2.16
CENPEQ02224 LEKR1-205ENST00000477399 621 ntTSL 2 BASIC1.58□□□□□ -2.16
CENPEQ02224 MIR5002-201ENST00000584713 97 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CENPEQ02224 GNAS-AS1_4.1-201ENST00000616546 112 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CENPEQ02224 AC005858.1-201ENST00000620193 677 ntTSL 2 BASIC1.58□□□□□ -2.16
CENPEQ02224 UGP2-203ENST00000445915 1955 ntTSL 2 BASIC1.58□□□□□ -2.16
CENPEQ02224 PNPT1P2-201ENST00000456768 2050 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CENPEQ02224 RNA5SP37-201ENST00000365420 130 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CENPEQ02224 RNU6-1027P-201ENST00000383998 107 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CENPEQ02224 AL627390.1-201ENST00000396055 340 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CENPEQ02224 MIR1294-201ENST00000408503 142 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CENPEQ02224 AC068295.1-201ENST00000413056 153 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
CENPEQ02224 AC005005.2-201ENST00000420779 380 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CENPEQ02224 KRR1-202ENST00000438169 975 ntTSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
CENPEQ02224 AL589765.3-201ENST00000446084 462 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CENPEQ02224 AGBL4-IT1-201ENST00000457061 514 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
CENPEQ02224 AMD1P1-201ENST00000457220 922 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CENPEQ02224 AC069439.2-201ENST00000496403 789 ntTSL 2 BASIC1.58□□□□□ -2.16
CENPEQ02224 ATP5EP1-201ENST00000510257 156 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CENPEQ02224 AP001207.1-201ENST00000524051 481 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CENPEQ02224 AC007513.1-201ENST00000548740 379 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
CENPEQ02224 AC008015.1-201ENST00000555505 465 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CENPEQ02224 AGGF1P8-201ENST00000562979 1000 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CENPEQ02224 AC019159.1-201ENST00000605094 187 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CENPEQ02224 AL596220.1-201ENST00000622121 542 ntTSL 4 BASIC1.58□□□□□ -2.16
CENPEQ02224 FOXP2-211ENST00000408937 6443 ntTSL 1 (best) BASIC1.57□□□□□ -2.16
CENPEQ02224 NEDD4-205ENST00000506154 6751 ntTSL 1 (best) BASIC1.57□□□□□ -2.16
CENPEQ02224 AL023807.1-201ENST00000407932 359 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CENPEQ02224 RNU6ATAC40P-201ENST00000408580 137 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CENPEQ02224 HMGB1P11-201ENST00000413899 637 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CENPEQ02224 LINC00353-201ENST00000435401 685 ntTSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
CENPEQ02224 ARPC3P1-201ENST00000437218 533 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CENPEQ02224 POU5F1P7-201ENST00000508759 541 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CENPEQ02224 ZDHHC20P3-201ENST00000531576 336 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CENPEQ02224 LINC02463-201ENST00000546414 497 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
CENPEQ02224 AC104581.2-201ENST00000572227 430 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CENPEQ02224 LRRC77P-213ENST00000637727 880 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CENPEQ02224 PTPRQ-209ENST00000616559 8165 ntTSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
CENPEQ02224 AC008264.2-201ENST00000610193 3731 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CENPEQ02224 DEFA7P-201ENST00000382676 285 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CENPEQ02224 AL513331.1-201ENST00000411908 397 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CENPEQ02224 SMG7-AS1-202ENST00000432837 466 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
CENPEQ02224 RPL36AP6-201ENST00000435770 321 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CENPEQ02224 AL513321.1-201ENST00000441175 761 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 140.5 ms