Protein–RNA interactions for Protein: O00273

DFFA, DNA fragmentation factor subunit alpha, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DFFAO00273 AC091046.2-201ENST00000620775 665 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
DFFAO00273 MAPK10-266ENST00000641066 6555 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
DFFAO00273 APC-201ENST00000257430 10701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
DFFAO00273 FAM46D-201ENST00000308293 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
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DFFAO00273 CNBD1-202ENST00000518476 1594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
DFFAO00273 LIG4-203ENST00000442234 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
DFFAO00273 FGF14-201ENST00000376131 12882 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
DFFAO00273 DYNC2H1-202ENST00000375735 13678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
DFFAO00273 PEX3-201ENST00000367591 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
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DFFAO00273 SNORA80A-201ENST00000363922 136 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
DFFAO00273 RNU6-619P-201ENST00000365146 108 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
DFFAO00273 CUBN-201ENST00000377823 705 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
DFFAO00273 RNU6-481P-201ENST00000384194 107 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
DFFAO00273 MIR16-1-201ENST00000385271 89 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
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DFFAO00273 RNU6-712P-201ENST00000410558 100 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
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DFFAO00273 LINC02258-201ENST00000551280 777 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
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DFFAO00273 AP002907.1-201ENST00000606361 1430 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
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DFFAO00273 HOMER1-201ENST00000282260 774 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
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DFFAO00273 LINC01090-203ENST00000632331 466 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
DFFAO00273 AC090897.3-201ENST00000636973 1157 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
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DFFAO00273 Z82195.2-201ENST00000612348 18351 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
DFFAO00273 C1D-201ENST00000355848 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
DFFAO00273 TAB3P1-202ENST00000452645 1634 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
DFFAO00273 BCL2A1-202ENST00000335661 809 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
DFFAO00273 CRP-202ENST00000368110 667 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
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