Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ4

TRIM35, Tripartite motif-containing protein 35, humanhuman

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Length 493 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM35Q9UPQ4 AC008164.1-201ENST00000423925 564 ntTSL 4 BASIC7.54□□□□□ -1.2
TRIM35Q9UPQ4 MS4A4E-203ENST00000425663 350 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
TRIM35Q9UPQ4 AL662874.1-201ENST00000426065 230 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
TRIM35Q9UPQ4 H3F3BP1-201ENST00000440551 403 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
TRIM35Q9UPQ4 ITGA9-AS1-207ENST00000445429 532 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
TRIM35Q9UPQ4 AC008264.1-201ENST00000447612 367 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
TRIM35Q9UPQ4 PLGLA-201ENST00000465668 449 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
TRIM35Q9UPQ4 RPL23AP65-201ENST00000475608 468 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
TRIM35Q9UPQ4 AC113155.1-201ENST00000511141 769 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
TRIM35Q9UPQ4 IGKV1OR2-1-201ENST00000514060 354 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
TRIM35Q9UPQ4 AC091544.7-201ENST00000554000 240 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
TRIM35Q9UPQ4 MIR5696-201ENST00000578474 85 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
TRIM35Q9UPQ4 AC011518.1-202ENST00000592668 407 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
TRIM35Q9UPQ4 IGKV1OR2-118-201ENST00000603238 347 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
TRIM35Q9UPQ4 AC007566.2-201ENST00000603642 413 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
TRIM35Q9UPQ4 AL022394.1-201ENST00000606979 292 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
TRIM35Q9UPQ4 RNA5SP440-201ENST00000612665 119 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
TRIM35Q9UPQ4 AL590099.1-201ENST00000615276 138 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
TRIM35Q9UPQ4 EDA2R-204ENST00000451436 3464 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
TRIM35Q9UPQ4 AP004607.3-201ENST00000530354 3915 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
TRIM35Q9UPQ4 ZFYVE9-202ENST00000357206 4567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
TRIM35Q9UPQ4 ZNF83-204ENST00000545872 2633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
TRIM35Q9UPQ4 NHS-205ENST00000617601 8163 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
TRIM35Q9UPQ4 PRKDC-201ENST00000314191 13509 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
TRIM35Q9UPQ4 OR2G6-202ENST00000641501 5840 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
TRIM35Q9UPQ4 NABP1-205ENST00000425611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
TRIM35Q9UPQ4 DTNA-227ENST00000597599 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
TRIM35Q9UPQ4 CACNA1E-209ENST00000621551 14886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
TRIM35Q9UPQ4 OR10G4-202ENST00000641521 3623 ntAPPRIS P1 BASIC7.53□□□□□ -1.2
TRIM35Q9UPQ4 FAM229B-201ENST00000368656 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
TRIM35Q9UPQ4 AC068389.1-202ENST00000526470 3564 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
TRIM35Q9UPQ4 GFPT1-202ENST00000361060 8632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
TRIM35Q9UPQ4 RNF13-202ENST00000361785 1939 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
TRIM35Q9UPQ4 MIR130A-201ENST00000385274 89 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
TRIM35Q9UPQ4 MIR1302-4-201ENST00000408701 150 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
TRIM35Q9UPQ4 AC074011.1-201ENST00000431376 581 ntTSL 4 BASIC7.53□□□□□ -1.2
TRIM35Q9UPQ4 AC073063.1-201ENST00000434352 607 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
TRIM35Q9UPQ4 AC064862.4-201ENST00000442180 334 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
TRIM35Q9UPQ4 AC092637.1-201ENST00000444745 510 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
TRIM35Q9UPQ4 AC022034.3-201ENST00000471393 478 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
TRIM35Q9UPQ4 PPIAP19-201ENST00000486414 492 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
TRIM35Q9UPQ4 AC109464.3-201ENST00000509456 204 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
TRIM35Q9UPQ4 AC109927.1-202ENST00000511951 282 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
TRIM35Q9UPQ4 AC097467.3-212ENST00000512269 568 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
TRIM35Q9UPQ4 ERHP1-201ENST00000523006 310 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
TRIM35Q9UPQ4 AC007458.1-201ENST00000542812 373 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
TRIM35Q9UPQ4 FRMD6-AS2-201ENST00000556617 548 ntTSL 4 BASIC7.53□□□□□ -1.2
TRIM35Q9UPQ4 AC091231.1-201ENST00000558443 391 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
TRIM35Q9UPQ4 AP005380.1-201ENST00000584896 547 ntTSL 4 BASIC7.53□□□□□ -1.2
TRIM35Q9UPQ4 AC240442.1-201ENST00000616055 283 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
TRIM35Q9UPQ4 TUG1_4.1-201ENST00000619464 181 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
TRIM35Q9UPQ4 Y_RNA.778-201ENST00000620203 90 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
TRIM35Q9UPQ4 LINC01002-236ENST00000634022 378 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
TRIM35Q9UPQ4 AC008568.2-201ENST00000623862 2313 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
TRIM35Q9UPQ4 CCDC178-209ENST00000579947 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
TRIM35Q9UPQ4 ANKRD49-208ENST00000544253 3002 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
TRIM35Q9UPQ4 CTNND1-212ENST00000525902 4984 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
TRIM35Q9UPQ4 CTNND1-214ENST00000526772 4966 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
TRIM35Q9UPQ4 CPED1-203ENST00000423795 2189 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
TRIM35Q9UPQ4 AC068870.1-201ENST00000563737 2455 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
TRIM35Q9UPQ4 DTNA-207ENST00000444659 6343 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
TRIM35Q9UPQ4 PGM3-211ENST00000512866 2013 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
TRIM35Q9UPQ4 AC007342.5-201ENST00000571340 2142 ntBASIC7.52□□□□□ -1.2
TRIM35Q9UPQ4 RAB3B-201ENST00000371655 12844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
TRIM35Q9UPQ4 ZNF436-201ENST00000314011 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
TRIM35Q9UPQ4 OR2J2-203ENST00000641417 2392 ntAPPRIS P1 BASIC7.52□□□□□ -1.21
TRIM35Q9UPQ4 IFIT1B-201ENST00000371809 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
TRIM35Q9UPQ4 LINC00862-202ENST00000367356 759 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
TRIM35Q9UPQ4 RNA5SP494-201ENST00000410653 129 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
TRIM35Q9UPQ4 RNU4-64P-201ENST00000410795 131 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
TRIM35Q9UPQ4 RPL36AP39-201ENST00000445859 318 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
TRIM35Q9UPQ4 RPL12P39-201ENST00000455456 496 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
TRIM35Q9UPQ4 AC092422.1-201ENST00000455576 584 ntTSL 4 BASIC7.52□□□□□ -1.21
TRIM35Q9UPQ4 RN7SL570P-201ENST00000484405 292 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
TRIM35Q9UPQ4 SAR1B-211ENST00000509937 455 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
TRIM35Q9UPQ4 RNU6-1234P-201ENST00000516877 103 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
TRIM35Q9UPQ4 AC090568.2-205ENST00000518631 576 ntTSL 4 BASIC7.52□□□□□ -1.21
TRIM35Q9UPQ4 WASHC5-AS1-201ENST00000519140 587 ntTSL 4 BASIC7.52□□□□□ -1.21
TRIM35Q9UPQ4 AC084365.1-201ENST00000552470 310 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
TRIM35Q9UPQ4 AL133279.1-202ENST00000556789 456 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
TRIM35Q9UPQ4 LINC02126-202ENST00000563754 750 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
TRIM35Q9UPQ4 uc_338.9-201ENST00000617424 182 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
TRIM35Q9UPQ4 AC127024.6-201ENST00000621598 424 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
TRIM35Q9UPQ4 MBNL2-201ENST00000343600 4596 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
TRIM35Q9UPQ4 DNAJC16-202ENST00000375847 6069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
TRIM35Q9UPQ4 HSPA13-201ENST00000285667 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
TRIM35Q9UPQ4 HSP90AA5P-201ENST00000438353 2192 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
TRIM35Q9UPQ4 PIGN-247ENST00000640540 4720 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
TRIM35Q9UPQ4 LZTFL1-215ENST00000536047 4342 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
TRIM35Q9UPQ4 NOX4-211ENST00000528341 1899 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
TRIM35Q9UPQ4 ZNF532-222ENST00000591083 5324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
TRIM35Q9UPQ4 MAGI2-205ENST00000519748 3316 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
TRIM35Q9UPQ4 SRRM1P3-201ENST00000426911 2678 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
TRIM35Q9UPQ4 HCG18-239ENST00000454129 4433 ntTSL 4 BASIC7.51□□□□□ -1.21
TRIM35Q9UPQ4 ZNF195-201ENST00000005082 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
TRIM35Q9UPQ4 CHD2-208ENST00000626874 7764 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
TRIM35Q9UPQ4 PAGE2-202ENST00000374968 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
TRIM35Q9UPQ4 TRAJ32-201ENST00000390505 66 ntAPPRIS P1 BASIC7.51□□□□□ -1.21
TRIM35Q9UPQ4 AC051618.1-201ENST00000414295 207 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
TRIM35Q9UPQ4 MTND4LP9-201ENST00000427694 174 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
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