Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXH8

CCBE1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1Q6UXH8 POSTN-203ENST00000379747 3373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
CCBE1Q6UXH8 AC110597.3-202ENST00000583493 3289 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CCBE1Q6UXH8 NF1-214ENST00000490416 1329 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CCBE1Q6UXH8 OR8D1-201ENST00000357821 1026 ntAPPRIS P1 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CCBE1Q6UXH8 CRP-202ENST00000368110 667 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CCBE1Q6UXH8 RNY3P9-201ENST00000384727 106 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CCBE1Q6UXH8 SKINT1L-201ENST00000401057 817 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CCBE1Q6UXH8 RPL21P65-201ENST00000406094 466 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CCBE1Q6UXH8 LINC01201-201ENST00000412420 294 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CCBE1Q6UXH8 TPT1P2-201ENST00000413105 503 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CCBE1Q6UXH8 AC004543.1-201ENST00000418764 369 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CCBE1Q6UXH8 MRPS36P1-201ENST00000421291 307 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CCBE1Q6UXH8 AL589946.1-201ENST00000421465 420 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CCBE1Q6UXH8 AL445584.1-201ENST00000431451 330 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CCBE1Q6UXH8 AC007389.2-201ENST00000434630 306 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CCBE1Q6UXH8 LINC01680-201ENST00000434983 299 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CCBE1Q6UXH8 AC241584.1-201ENST00000438469 1241 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CCBE1Q6UXH8 MAP3K13-207ENST00000438798 388 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CCBE1Q6UXH8 RPL21P2-201ENST00000440049 481 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CCBE1Q6UXH8 AC093155.1-201ENST00000440164 826 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CCBE1Q6UXH8 RANP8-201ENST00000444720 713 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CCBE1Q6UXH8 Z96811.1-201ENST00000445880 108 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CCBE1Q6UXH8 AF127577.1-201ENST00000446301 562 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CCBE1Q6UXH8 COX6CP18-201ENST00000448769 222 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CCBE1Q6UXH8 LINC01810-201ENST00000450397 411 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CCBE1Q6UXH8 AL583803.1-201ENST00000454262 334 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CCBE1Q6UXH8 RPS20P24-201ENST00000457473 361 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CCBE1Q6UXH8 AC121764.1-201ENST00000472238 563 ntTSL 4 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CCBE1Q6UXH8 AC011979.1-201ENST00000472300 483 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CCBE1Q6UXH8 ADGRL3-AS1-203ENST00000506704 606 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CCBE1Q6UXH8 TET2-AS1-201ENST00000515414 537 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CCBE1Q6UXH8 NRG1-IT1-202ENST00000521463 742 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
CCBE1Q6UXH8 AP001189.2-201ENST00000527320 189 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CCBE1Q6UXH8 MS4A13-204ENST00000527948 790 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
CCBE1Q6UXH8 AC022240.1-201ENST00000532065 684 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
CCBE1Q6UXH8 ZNF321P-202ENST00000550843 495 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CCBE1Q6UXH8 MRPS36P5-201ENST00000551909 298 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CCBE1Q6UXH8 TIMM9-209ENST00000556367 572 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CCBE1Q6UXH8 GTF2IP8-201ENST00000560687 584 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CCBE1Q6UXH8 AC145350.1-201ENST00000567426 208 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CCBE1Q6UXH8 AC090616.5-201ENST00000581225 299 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CCBE1Q6UXH8 MIR4506-201ENST00000584693 77 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CCBE1Q6UXH8 SOX2-OT-224ENST00000595313 716 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CCBE1Q6UXH8 IGKV1OR2-6-201ENST00000603485 277 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CCBE1Q6UXH8 NUTF2P8-201ENST00000604593 363 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CCBE1Q6UXH8 AL137849.1-201ENST00000604767 169 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CCBE1Q6UXH8 AL139344.1-201ENST00000605228 195 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CCBE1Q6UXH8 AC007349.4-201ENST00000608114 532 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CCBE1Q6UXH8 STARD13-AS-239ENST00000609588 982 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CCBE1Q6UXH8 AP003485.2-201ENST00000623636 610 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CCBE1Q6UXH8 TEX41-300ENST00000631048 69 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CCBE1Q6UXH8 DST-204ENST00000361203 22431 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CCBE1Q6UXH8 ATM-203ENST00000452508 12954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
CCBE1Q6UXH8 TTC21B-AS1-201ENST00000440322 2260 ntTSL 4 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CCBE1Q6UXH8 MAP3K7-202ENST00000369325 4633 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
CCBE1Q6UXH8 AL021368.2-201ENST00000606125 5352 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CCBE1Q6UXH8 FNDC3A-202ENST00000398316 5714 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
CCBE1Q6UXH8 DEFB112-201ENST00000322246 342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
CCBE1Q6UXH8 OR5H2-201ENST00000355273 945 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CCBE1Q6UXH8 OR5H2-202ENST00000356526 930 ntAPPRIS P1 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CCBE1Q6UXH8 RNU6-560P-201ENST00000364007 108 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CCBE1Q6UXH8 SNORD56.5-201ENST00000364281 72 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CCBE1Q6UXH8 SNORD116.1-201ENST00000365628 92 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CCBE1Q6UXH8 RNU6ATAC-201ENST00000408749 126 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CCBE1Q6UXH8 UBE2Q2P5Y-201ENST00000413867 207 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CCBE1Q6UXH8 AL008987.1-201ENST00000415528 237 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CCBE1Q6UXH8 CR769775.2-201ENST00000417850 891 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CCBE1Q6UXH8 EDNRB-AS1-201ENST00000422405 601 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CCBE1Q6UXH8 UBE2Q2P4Y-201ENST00000433767 207 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CCBE1Q6UXH8 PCDH9-AS3-201ENST00000434073 479 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CCBE1Q6UXH8 ARHGEF7-AS1-201ENST00000435037 321 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CCBE1Q6UXH8 AL360089.1-201ENST00000442260 436 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CCBE1Q6UXH8 RPL21P89-201ENST00000444021 467 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CCBE1Q6UXH8 AL512658.1-201ENST00000449072 533 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CCBE1Q6UXH8 AL031183.1-201ENST00000457667 207 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CCBE1Q6UXH8 LINC01510-203ENST00000458082 626 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CCBE1Q6UXH8 SNORA59A-201ENST00000459326 152 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CCBE1Q6UXH8 AC020893.1-201ENST00000502452 580 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CCBE1Q6UXH8 MTCYBP16-201ENST00000509187 1129 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CCBE1Q6UXH8 AC011586.1-201ENST00000521055 458 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CCBE1Q6UXH8 RAP1B-224ENST00000541216 701 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
CCBE1Q6UXH8 LINC02410-201ENST00000553095 393 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CCBE1Q6UXH8 AC008056.1-201ENST00000553322 394 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CCBE1Q6UXH8 AC091117.2-201ENST00000560324 542 ntTSL 4 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CCBE1Q6UXH8 AC133065.1-201ENST00000572017 575 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CCBE1Q6UXH8 AC022662.1-201ENST00000580252 331 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CCBE1Q6UXH8 MIR3200-201ENST00000580767 85 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CCBE1Q6UXH8 LINC01899-203ENST00000584810 337 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CCBE1Q6UXH8 RPS4XP16-203ENST00000596904 698 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CCBE1Q6UXH8 BNIP3P26-201ENST00000600827 554 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CCBE1Q6UXH8 AL031985.2-201ENST00000600955 480 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CCBE1Q6UXH8 DUXAP3-201ENST00000603616 594 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CCBE1Q6UXH8 AC055876.5-201ENST00000605667 259 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CCBE1Q6UXH8 AL662844.3-201ENST00000606909 517 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CCBE1Q6UXH8 AL356515.1-201ENST00000611081 415 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CCBE1Q6UXH8 C9orf153-205ENST00000617985 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CCBE1Q6UXH8 AC026634.1-201ENST00000634369 198 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CCBE1Q6UXH8 RASSF8-210ENST00000541490 5505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CCBE1Q6UXH8 AL049780.3-201ENST00000624612 1583 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CCBE1Q6UXH8 ZNF99-201ENST00000397104 3114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
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