Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT2

C9orf135, Protein C9orf135, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135Q5VTT2 PSMA6P3-201ENST00000428242 164 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
C9orf135Q5VTT2 AL691515.1-201ENST00000432976 733 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
C9orf135Q5VTT2 AC016644.1-201ENST00000438553 434 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
C9orf135Q5VTT2 RPL21P2-201ENST00000440049 481 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
C9orf135Q5VTT2 AC092625.1-201ENST00000442706 393 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
C9orf135Q5VTT2 OR6K5P-201ENST00000447050 945 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
C9orf135Q5VTT2 VN1R10P-201ENST00000447106 875 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
C9orf135Q5VTT2 Z99127.3-201ENST00000448158 395 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
C9orf135Q5VTT2 AC017099.1-201ENST00000448261 1028 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
C9orf135Q5VTT2 AL359385.1-201ENST00000456509 365 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
C9orf135Q5VTT2 AC010401.1-201ENST00000463867 348 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
C9orf135Q5VTT2 AC104472.2-201ENST00000469035 601 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
C9orf135Q5VTT2 AC121764.2-201ENST00000469806 587 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
C9orf135Q5VTT2 RN7SL283P-201ENST00000489055 303 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
C9orf135Q5VTT2 APOA2-210ENST00000491350 263 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
C9orf135Q5VTT2 CAB39P1-201ENST00000502277 460 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
C9orf135Q5VTT2 KLRA1P-201ENST00000503499 986 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
C9orf135Q5VTT2 AC131956.2-201ENST00000510922 512 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
C9orf135Q5VTT2 RNU6-56P-201ENST00000516986 93 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
C9orf135Q5VTT2 AC087439.2-201ENST00000519498 552 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
C9orf135Q5VTT2 AC104316.1-201ENST00000521258 625 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
C9orf135Q5VTT2 FAM60DP-201ENST00000524174 632 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
C9orf135Q5VTT2 CACNA1C-AS4-201ENST00000544415 735 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
C9orf135Q5VTT2 AC021979.1-201ENST00000553822 336 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
C9orf135Q5VTT2 LINC00871-202ENST00000556071 554 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
C9orf135Q5VTT2 UBL5P2-201ENST00000583788 219 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
C9orf135Q5VTT2 RPL23AP92-201ENST00000603609 255 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
C9orf135Q5VTT2 AL356585.4-201ENST00000623078 1229 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
C9orf135Q5VTT2 BAZ2B-202ENST00000343439 2364 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
C9orf135Q5VTT2 AC103988.1-201ENST00000566382 2177 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
C9orf135Q5VTT2 CYYR1-AS1-201ENST00000357401 3412 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
C9orf135Q5VTT2 POSTN-209ENST00000541179 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
C9orf135Q5VTT2 AC058791.1-201ENST00000608412 3198 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
C9orf135Q5VTT2 C9orf72-202ENST00000379997 1873 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
C9orf135Q5VTT2 RAPGEF6-202ENST00000308008 4176 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
C9orf135Q5VTT2 XKR3-201ENST00000331428 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
C9orf135Q5VTT2 CHD9-218ENST00000566029 13110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
C9orf135Q5VTT2 OR1S2-201ENST00000302592 978 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
C9orf135Q5VTT2 DIRC1-201ENST00000308100 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
C9orf135Q5VTT2 OR52E6-201ENST00000329322 970 ntAPPRIS P1 BASIC2.79□□□□□ -1.96
C9orf135Q5VTT2 RNU1-75P-201ENST00000347264 129 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
C9orf135Q5VTT2 SPHAR-201ENST00000366688 648 ntAPPRIS P1 BASIC2.79□□□□□ -1.96
C9orf135Q5VTT2 CUBN-201ENST00000377823 705 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
C9orf135Q5VTT2 CD24P4-201ENST00000382840 243 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
C9orf135Q5VTT2 RNU6-1300P-201ENST00000391046 108 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
C9orf135Q5VTT2 MYO16-AS2-201ENST00000412809 436 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
C9orf135Q5VTT2 AC010731.3-201ENST00000415029 566 ntTSL 4 BASIC2.79□□□□□ -1.96
C9orf135Q5VTT2 LINC00845-201ENST00000417931 696 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
C9orf135Q5VTT2 AL137014.1-201ENST00000420490 1226 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
C9orf135Q5VTT2 AC044781.1-201ENST00000446193 570 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
C9orf135Q5VTT2 AL671855.1-201ENST00000446875 1203 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
C9orf135Q5VTT2 AL590664.1-201ENST00000448065 339 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
C9orf135Q5VTT2 AC244505.3-201ENST00000454598 187 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
C9orf135Q5VTT2 AC092757.1-201ENST00000467293 467 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
C9orf135Q5VTT2 AC109925.1-201ENST00000478069 331 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
C9orf135Q5VTT2 AC093523.1-201ENST00000503268 499 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
C9orf135Q5VTT2 AC111000.2-201ENST00000507775 550 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
C9orf135Q5VTT2 LYRM2-203ENST00000520318 677 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
C9orf135Q5VTT2 LRRTM2-203ENST00000521094 1182 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
C9orf135Q5VTT2 OR5AK1P-201ENST00000524837 922 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
C9orf135Q5VTT2 AC104237.1-201ENST00000527443 539 ntTSL 4 BASIC2.79□□□□□ -1.96
C9orf135Q5VTT2 AC022240.1-201ENST00000532065 684 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
C9orf135Q5VTT2 KLRF1-203ENST00000537723 598 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
C9orf135Q5VTT2 AC004024.1-201ENST00000549244 247 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
C9orf135Q5VTT2 G2E3-AS1-204ENST00000552511 402 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
C9orf135Q5VTT2 AC023394.1-201ENST00000578673 312 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
C9orf135Q5VTT2 AC007001.1-201ENST00000590912 670 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
C9orf135Q5VTT2 VN1R87P-201ENST00000596706 487 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
C9orf135Q5VTT2 AP000873.2-201ENST00000602381 406 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
C9orf135Q5VTT2 AC106791.2-201ENST00000604680 391 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
C9orf135Q5VTT2 AL590426.2-201ENST00000607287 786 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
C9orf135Q5VTT2 AP001521.1-201ENST00000609150 300 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
C9orf135Q5VTT2 AC091046.2-201ENST00000620775 665 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
C9orf135Q5VTT2 DLG2-AS1_1.1-201ENST00000622319 213 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
C9orf135Q5VTT2 AC007218.2-201ENST00000636913 179 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
C9orf135Q5VTT2 ZBBX-202ENST00000392764 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
C9orf135Q5VTT2 EVI2A-202ENST00000461237 1540 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC2.78□□□□□ -1.96
C9orf135Q5VTT2 FRS2-201ENST00000397997 6550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
C9orf135Q5VTT2 ATP2B1-201ENST00000261173 6777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
C9orf135Q5VTT2 PPP2R5C-226ENST00000557095 1307 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
C9orf135Q5VTT2 AC093274.1-201ENST00000503488 5454 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
C9orf135Q5VTT2 RNU5B-4P-201ENST00000363508 111 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
C9orf135Q5VTT2 SKINT1L-201ENST00000401057 817 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
C9orf135Q5VTT2 RNA5SP107-201ENST00000411358 122 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
C9orf135Q5VTT2 AL024507.1-201ENST00000412741 274 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
C9orf135Q5VTT2 AC092634.2-201ENST00000428146 1010 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
C9orf135Q5VTT2 AL512649.1-201ENST00000428997 581 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
C9orf135Q5VTT2 AC005160.1-201ENST00000432405 381 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
C9orf135Q5VTT2 RPL23AP22-201ENST00000437556 453 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
C9orf135Q5VTT2 AC108734.1-201ENST00000439549 399 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
C9orf135Q5VTT2 AL513422.1-201ENST00000449531 383 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
C9orf135Q5VTT2 RN7SL442P-201ENST00000473804 320 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
C9orf135Q5VTT2 MDM2-217ENST00000478070 692 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
C9orf135Q5VTT2 AC021205.2-201ENST00000480069 347 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
C9orf135Q5VTT2 AC026414.1-201ENST00000504046 698 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
C9orf135Q5VTT2 AC008871.1-201ENST00000510935 398 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
C9orf135Q5VTT2 MTCO3P27-201ENST00000514397 196 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
C9orf135Q5VTT2 SNORA70.16-201ENST00000516390 95 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
C9orf135Q5VTT2 AP003355.1-201ENST00000518956 587 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
C9orf135Q5VTT2 AC022679.1-202ENST00000520251 376 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.4 ms