Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 AC007493.1-202ENST00000567899 517 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CDO1Q16878 AC025272.1-201ENST00000569661 483 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CDO1Q16878 AC090615.1-201ENST00000577519 154 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CDO1Q16878 MYL12A-209ENST00000580887 899 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
CDO1Q16878 MIR4276-201ENST00000584832 70 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CDO1Q16878 MIR4760-201ENST00000585040 80 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CDO1Q16878 AC015911.6-201ENST00000588445 457 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CDO1Q16878 AC025946.2-201ENST00000603398 234 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CDO1Q16878 AC011468.4-201ENST00000603942 409 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CDO1Q16878 AC004853.1-201ENST00000604902 698 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CDO1Q16878 AL592295.2-201ENST00000612578 206 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CDO1Q16878 AL355365.1-201ENST00000616480 294 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CDO1Q16878 AL360181.4-201ENST00000621752 134 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CDO1Q16878 AC023510.2-201ENST00000622162 746 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CDO1Q16878 CGA-204ENST00000627148 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
CDO1Q16878 LINC01247-201ENST00000448901 4209 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
CDO1Q16878 ZNF639-206ENST00000484866 1730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CDO1Q16878 ARHGAP12-201ENST00000311380 4625 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
CDO1Q16878 PRKD3-202ENST00000379066 6111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CDO1Q16878 FAM111A-207ENST00000531147 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
CDO1Q16878 PPP1R12A-204ENST00000546369 2977 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CDO1Q16878 RBM39-201ENST00000253363 2488 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
CDO1Q16878 WRN-201ENST00000298139 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
CDO1Q16878 P2RY13-201ENST00000325602 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
CDO1Q16878 MME-211ENST00000492661 2854 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CDO1Q16878 RNU6-952P-201ENST00000391164 108 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CDO1Q16878 RN7SKP27-201ENST00000410684 333 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CDO1Q16878 AP000550.2-201ENST00000417463 774 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CDO1Q16878 ATP2B2-IT2-201ENST00000419591 507 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CDO1Q16878 DUTP6-201ENST00000425573 462 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CDO1Q16878 AL033504.1-201ENST00000427015 773 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CDO1Q16878 PCDH9-AS3-201ENST00000434073 479 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CDO1Q16878 AP000552.3-201ENST00000434730 775 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CDO1Q16878 EXTL2P1-201ENST00000446218 416 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CDO1Q16878 AC093422.2-201ENST00000452599 686 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CDO1Q16878 AC026355.2-201ENST00000456755 723 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CDO1Q16878 HMGN2P16-201ENST00000456802 261 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CDO1Q16878 CEACAMP4-201ENST00000457676 421 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CDO1Q16878 AC008155.2-201ENST00000464337 397 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CDO1Q16878 UBE2Q2P9-201ENST00000490086 202 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CDO1Q16878 KLHL6-AS1-201ENST00000491676 503 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CDO1Q16878 NAA50-206ENST00000493454 964 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CDO1Q16878 AC106872.2-201ENST00000494303 480 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CDO1Q16878 AC025465.2-201ENST00000502809 608 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CDO1Q16878 RN7SKP60-201ENST00000516985 239 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CDO1Q16878 LRRTM2-203ENST00000521094 1182 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
CDO1Q16878 AC090857.2-201ENST00000526362 723 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CDO1Q16878 AC013799.1-201ENST00000531157 348 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
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CDO1Q16878 AL672296.1-201ENST00000427780 2158 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
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CDO1Q16878 AC017071.1-201ENST00000564407 2204 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
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CDO1Q16878 RASSF8-210ENST00000541490 5505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
CDO1Q16878 OR13C4-201ENST00000277216 957 ntAPPRIS P1 BASIC3.48□□□□□ -1.85
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CDO1Q16878 MT-ND2-201ENST00000361453 1042 ntAPPRIS P1 BASIC3.48□□□□□ -1.85
CDO1Q16878 RNU1-70P-201ENST00000362618 164 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
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CDO1Q16878 SNORA4.1-201ENST00000364263 144 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CDO1Q16878 MIR449B-201ENST00000384995 97 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
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CDO1Q16878 OR1AA1P-201ENST00000419597 916 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CDO1Q16878 AL080248.1-201ENST00000428954 388 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
CDO1Q16878 ZYG11AP1-201ENST00000430329 837 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CDO1Q16878 AL590103.1-201ENST00000434488 307 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CDO1Q16878 MTCYBP31-201ENST00000438855 1122 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CDO1Q16878 IGKV3D-7-201ENST00000443397 384 ntAPPRIS P1 BASIC3.48□□□□□ -1.85
CDO1Q16878 AL121871.1-201ENST00000443413 436 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CDO1Q16878 AC135371.1-201ENST00000446964 453 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
CDO1Q16878 Z73417.1-201ENST00000447373 778 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CDO1Q16878 VN1R34P-201ENST00000447387 883 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
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CDO1Q16878 snoU13.8-201ENST00000458890 104 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
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CDO1Q16878 RNA5SP468-201ENST00000516782 93 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CDO1Q16878 AP001372.4-201ENST00000524889 472 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CDO1Q16878 FAM96A-206ENST00000559950 561 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
CDO1Q16878 CASC16-202ENST00000563844 610 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
CDO1Q16878 AC087463.3-201ENST00000570105 415 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
CDO1Q16878 AC234772.3-201ENST00000602277 528 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CDO1Q16878 RMST_8.1-201ENST00000610287 165 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
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