Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

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Length 212 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 RPL39P6-201ENST00000448289 150 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CDKN3Q16667 RFC5P1-201ENST00000454419 874 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CDKN3Q16667 HMGN2P16-201ENST00000456802 261 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CDKN3Q16667 AF129075.1-201ENST00000457162 794 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
CDKN3Q16667 HMGN1P18-201ENST00000457642 277 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CDKN3Q16667 RPL23AP62-201ENST00000463396 453 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CDKN3Q16667 S100A11P2-201ENST00000467589 312 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CDKN3Q16667 RPL27AP5-201ENST00000469428 449 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CDKN3Q16667 AC109925.1-201ENST00000478069 331 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CDKN3Q16667 AC010451.3-201ENST00000511721 444 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
CDKN3Q16667 FABP5P12-201ENST00000515543 389 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CDKN3Q16667 APAF1-207ENST00000547743 651 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
CDKN3Q16667 AC091515.1-201ENST00000548110 679 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CDKN3Q16667 AL133166.1-202ENST00000550975 565 ntTSL 4 BASIC3.2□□□□□ -1.9
CDKN3Q16667 EIF4BP1-201ENST00000554881 351 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CDKN3Q16667 AC009101.2-201ENST00000564293 456 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
CDKN3Q16667 LARP7P2-201ENST00000575306 125 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CDKN3Q16667 LINC01899-203ENST00000584810 337 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
CDKN3Q16667 LINC01470-205ENST00000584829 681 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
CDKN3Q16667 BNIP3P11-201ENST00000603878 563 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CDKN3Q16667 Hammerhead_HH10.1-201ENST00000620658 125 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CDKN3Q16667 THOC1-220ENST00000621904 1083 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
CDKN3Q16667 AC073348.1-201ENST00000623002 331 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CDKN3Q16667 RBM12B-AS1-201ENST00000623283 653 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CDKN3Q16667 SEC23A-215ENST00000625395 261 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
CDKN3Q16667 HSP90AA4P-202ENST00000506915 2228 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CDKN3Q16667 TDRD15-201ENST00000405799 6135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
CDKN3Q16667 OR9G4-204ENST00000641668 2608 ntAPPRIS P1 BASIC3.2□□□□□ -1.9
CDKN3Q16667 FAP-201ENST00000188790 2780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
CDKN3Q16667 SAGE1-203ENST00000537770 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
CDKN3Q16667 ADAMTS9-AS1-207ENST00000594810 3609 ntTSL 4 BASIC3.19□□□□□ -1.9
CDKN3Q16667 MIR422A-201ENST00000362286 90 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CDKN3Q16667 CD84-204ENST00000368048 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
CDKN3Q16667 SNORD51-201ENST00000384320 80 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CDKN3Q16667 RNU6-925P-201ENST00000384629 104 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CDKN3Q16667 SKINT1L-201ENST00000401057 817 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CDKN3Q16667 RPS7P13-201ENST00000413955 498 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CDKN3Q16667 COTL1P1-201ENST00000422309 375 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CDKN3Q16667 TXNDC8-204ENST00000423740 356 ntTSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
CDKN3Q16667 MTND4LP10-201ENST00000435146 291 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CDKN3Q16667 AC022537.1-201ENST00000435271 446 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
CDKN3Q16667 AC007557.1-201ENST00000451711 541 ntTSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
CDKN3Q16667 OFD1P3Y-201ENST00000453312 783 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CDKN3Q16667 TMEM212-IT1-201ENST00000456146 470 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
CDKN3Q16667 RN7SL863P-201ENST00000462370 296 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CDKN3Q16667 HMGB1P25-201ENST00000468402 607 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CDKN3Q16667 TIPARP-AS1-202ENST00000478005 554 ntTSL 4 BASIC3.19□□□□□ -1.9
CDKN3Q16667 RPL23AP44-201ENST00000482216 473 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CDKN3Q16667 RPS3AP14-201ENST00000483907 780 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CDKN3Q16667 SCOC-205ENST00000502535 679 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
CDKN3Q16667 AC093752.2-201ENST00000506942 573 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
CDKN3Q16667 HMGB3P15-201ENST00000507326 574 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CDKN3Q16667 AC119751.4-201ENST00000507498 357 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CDKN3Q16667 ERAP2-205ENST00000510309 1275 ntTSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
CDKN3Q16667 AC090833.1-201ENST00000513853 806 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
CDKN3Q16667 RNU1-143P-201ENST00000516296 146 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CDKN3Q16667 RNA5SP468-201ENST00000516782 93 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CDKN3Q16667 AC018437.2-201ENST00000517369 389 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
CDKN3Q16667 AC022240.1-201ENST00000532065 684 ntTSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
CDKN3Q16667 OR56A5-202ENST00000532411 942 ntAPPRIS P1 BASIC3.19□□□□□ -1.9
CDKN3Q16667 AC006518.1-201ENST00000541449 943 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CDKN3Q16667 ZKSCAN7P1-201ENST00000543668 673 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
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CDKN3Q16667 MTCYBP23-201ENST00000558717 1102 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CDKN3Q16667 LARP7P3-201ENST00000579888 337 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CDKN3Q16667 AC010127.1-205ENST00000595268 567 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
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CDKN3Q16667 AL365400.2-201ENST00000605604 902 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
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CDKN3Q16667 U1.23-201ENST00000610293 146 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CDKN3Q16667 AL138478.1-201ENST00000612252 832 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CDKN3Q16667 uc_338.25-201ENST00000613756 156 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
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CDKN3Q16667 AC138393.3-201ENST00000618397 573 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
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CDKN3Q16667 U1.39-201ENST00000621562 146 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CDKN3Q16667 AC120349.2-201ENST00000625002 298 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CDKN3Q16667 BAZ2B-204ENST00000392783 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
CDKN3Q16667 LMNTD1-204ENST00000458174 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
CDKN3Q16667 TAS2R14-202ENST00000537503 1858 ntAPPRIS P1 BASIC3.19□□□□□ -1.9
CDKN3Q16667 BAZ2B-202ENST00000343439 2364 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
CDKN3Q16667 PAPPA-AS1-201ENST00000445861 2450 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CDKN3Q16667 MBNL1-218ENST00000485910 4257 ntTSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
CDKN3Q16667 SYNE2-212ENST00000554584 20508 ntTSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
CDKN3Q16667 C5orf42-205ENST00000508244 11062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
CDKN3Q16667 FIGNL1-202ENST00000395556 3485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.18□□□□□ -1.9
CDKN3Q16667 SNRPEP3-201ENST00000338402 276 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
CDKN3Q16667 DEFB109C-201ENST00000382575 264 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
CDKN3Q16667 DEFB109B-201ENST00000382656 264 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
CDKN3Q16667 RNU6-1074P-201ENST00000383995 104 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
CDKN3Q16667 SNORA7.4-201ENST00000384249 137 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
CDKN3Q16667 MOB4-205ENST00000409916 829 ntTSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
CDKN3Q16667 AC092447.6-201ENST00000414578 210 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
CDKN3Q16667 LINC01389-201ENST00000420876 483 ntTSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
CDKN3Q16667 PSMA6P3-201ENST00000428242 164 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
CDKN3Q16667 AC004485.1-201ENST00000439839 527 ntTSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
CDKN3Q16667 IGKV1OR-3-201ENST00000446944 348 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
CDKN3Q16667 RSL24D1P3-201ENST00000449255 495 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
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