Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 PCAT4-202ENST00000514836 373 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CTF1Q16619 RN7SKP209-201ENST00000516888 304 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CTF1Q16619 AC107934.1-201ENST00000522215 217 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CTF1Q16619 AC008489.1-201ENST00000524271 483 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CTF1Q16619 AP000907.2-201ENST00000530827 353 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CTF1Q16619 AC103798.1-201ENST00000532562 376 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CTF1Q16619 AC073655.2-202ENST00000547927 401 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CTF1Q16619 CBX3P5-201ENST00000552017 521 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CTF1Q16619 OR4K8P-201ENST00000578842 1048 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CTF1Q16619 TTN-AS1-232ENST00000589487 1077 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CTF1Q16619 XIAPP1-201ENST00000603162 600 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CTF1Q16619 AL161729.4-201ENST00000604650 476 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CTF1Q16619 AC113403.1-201ENST00000604910 193 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CTF1Q16619 FAM27D1-201ENST00000612308 341 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CTF1Q16619 NAA60-237ENST00000615865 326 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CTF1Q16619 AC006338.2-201ENST00000616864 791 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CTF1Q16619 AC095031.1-201ENST00000623685 672 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CTF1Q16619 AC112204.3-201ENST00000623822 332 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CTF1Q16619 AC091953.2-201ENST00000623979 160 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CTF1Q16619 PCBP1-AS1-348ENST00000629506 667 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CTF1Q16619 SNORA17.5-201ENST00000630429 132 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CTF1Q16619 AC110994.2-201ENST00000635481 492 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CTF1Q16619 AC010149.2-201ENST00000637608 315 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CTF1Q16619 CEP170P1-201ENST00000502249 4587 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CTF1Q16619 ADAM28-201ENST00000265769 7052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
CTF1Q16619 OR1C1-202ENST00000641256 3719 ntAPPRIS P1 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CTF1Q16619 DAZ4-202ENST00000382314 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CTF1Q16619 PHC3-215ENST00000495893 12666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
CTF1Q16619 PIGW-206ENST00000620233 2264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CTF1Q16619 RGS13-204ENST00000543215 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
CTF1Q16619 GNG5P1-201ENST00000255500 204 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CTF1Q16619 OR5J1P-201ENST00000313544 939 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CTF1Q16619 EEF1E1-201ENST00000379715 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
CTF1Q16619 RNU6-629P-201ENST00000384061 103 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CTF1Q16619 Y_RNA.582-201ENST00000391023 95 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CTF1Q16619 COX6B1P1-201ENST00000415962 213 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CTF1Q16619 TTTY3-201ENST00000417334 344 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
CTF1Q16619 IGKV1OR9-2-201ENST00000431378 277 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CTF1Q16619 OR4K11P-201ENST00000431829 904 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CTF1Q16619 Z83839.2-201ENST00000436294 274 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CTF1Q16619 RPL23AP46-201ENST00000438548 490 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CTF1Q16619 AC073614.1-201ENST00000438690 650 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CTF1Q16619 DNAJC19P4-201ENST00000440115 345 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CTF1Q16619 AC079354.3-201ENST00000447111 311 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CTF1Q16619 TPT1P14-201ENST00000448018 505 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CTF1Q16619 AL392046.1-203ENST00000450106 651 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CTF1Q16619 AC005871.1-201ENST00000450247 475 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CTF1Q16619 AF213884.1-201ENST00000488102 463 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CTF1Q16619 AC082650.1-201ENST00000503542 575 ntTSL 4 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CTF1Q16619 LINC02508-201ENST00000504165 426 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CTF1Q16619 AC027343.1-201ENST00000504765 407 ntTSL 4 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CTF1Q16619 AC108210.1-201ENST00000510772 825 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CTF1Q16619 Y_RNA.672-201ENST00000516289 104 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CTF1Q16619 RN7SKP60-201ENST00000516985 239 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CTF1Q16619 AC091819.1-201ENST00000518330 630 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
CTF1Q16619 SUMO2P20-201ENST00000520803 283 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CTF1Q16619 AP002833.1-201ENST00000530572 566 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CTF1Q16619 AL354920.1-202ENST00000531661 1017 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
CTF1Q16619 AC091047.1-201ENST00000533344 552 ntTSL 4 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CTF1Q16619 SMILR-201ENST00000533992 553 ntTSL 4 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CTF1Q16619 LINC02313-201ENST00000553330 550 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CTF1Q16619 AC005225.1-201ENST00000553394 937 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CTF1Q16619 AC007424.1-203ENST00000554613 687 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CTF1Q16619 AC010601.1-202ENST00000567304 547 ntTSL 4 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CTF1Q16619 AC010546.1-201ENST00000569391 485 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CTF1Q16619 AC005154.1-222ENST00000579024 341 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CTF1Q16619 MIR3118-1-201ENST00000581787 76 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CTF1Q16619 LINC01791-201ENST00000589511 677 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CTF1Q16619 AC011990.1-201ENST00000592809 734 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CTF1Q16619 PPP3CB-AS1-206ENST00000595935 675 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CTF1Q16619 RNU6-87P-201ENST00000607561 108 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CTF1Q16619 LINC00310-206ENST00000609947 892 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CTF1Q16619 BX664608.1-201ENST00000610519 487 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CTF1Q16619 MIR6778-201ENST00000617912 73 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CTF1Q16619 AL732618.1-201ENST00000623251 301 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CTF1Q16619 SOX2-OT-255ENST00000630150 649 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CTF1Q16619 TTTY3B-201ENST00000631331 344 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
CTF1Q16619 CCDC110-202ENST00000393540 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
CTF1Q16619 CHORDC1-206ENST00000529987 1698 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CTF1Q16619 AL645937.1-201ENST00000641739 1652 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CTF1Q16619 AC106871.1-201ENST00000568324 3102 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CTF1Q16619 Z82217.1-201ENST00000625157 8149 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CTF1Q16619 OPRM1-206ENST00000419506 1402 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
CTF1Q16619 PHEX-201ENST00000379374 6172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
CTF1Q16619 CCDC178-202ENST00000383096 3391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CTF1Q16619 MTND5P26-201ENST00000426018 1752 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CTF1Q16619 FAM71D-211ENST00000612183 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CTF1Q16619 CAPS2-206ENST00000409799 1859 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
CTF1Q16619 LINC01111-201ENST00000518732 1663 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
CTF1Q16619 AC073073.2-201ENST00000609827 2578 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CTF1Q16619 MDM2-207ENST00000360430 891 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
CTF1Q16619 MIR323A-201ENST00000362199 86 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CTF1Q16619 RNU6-1155P-201ENST00000363554 107 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CTF1Q16619 RNU4-1-201ENST00000363925 141 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CTF1Q16619 RNU6-259P-201ENST00000383999 107 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CTF1Q16619 RNU6-1042P-201ENST00000384204 107 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CTF1Q16619 SNORA51.8-201ENST00000384234 132 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CTF1Q16619 MIR135A2-201ENST00000384854 100 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CTF1Q16619 MIR19A-201ENST00000384878 82 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CTF1Q16619 AL049693.1-201ENST00000402760 611 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.7 ms