Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 AC090506.1-201ENST00000583089 572 ntTSL 4 BASIC2.44□□□□□ -2.02
SSX1Q16384 AC018371.1-201ENST00000584560 640 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
SSX1Q16384 GAS5-AS1-201ENST00000602767 694 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SSX1Q16384 AL606834.2-201ENST00000602954 668 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SSX1Q16384 DUXAP4-201ENST00000603046 613 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SSX1Q16384 AC012669.1-201ENST00000603209 283 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SSX1Q16384 ELOCP35-201ENST00000604289 336 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SSX1Q16384 AP001330.4-201ENST00000604350 154 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SSX1Q16384 MIR7975-201ENST00000619350 68 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SSX1Q16384 AC006111.3-201ENST00000622137 383 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SSX1Q16384 OR51F1-202ENST00000624103 939 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.44□□□□□ -2.02
SSX1Q16384 SATB1-AS1-243ENST00000627546 589 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
SSX1Q16384 FLG-AS1-207ENST00000628475 497 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
SSX1Q16384 AL121594.5-201ENST00000631724 573 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SSX1Q16384 ARHGAP11A-207ENST00000565905 3318 ntTSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
SSX1Q16384 NEDD4-208ENST00000508342 7235 ntTSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
SSX1Q16384 AC024341.1-201ENST00000526444 1552 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SSX1Q16384 TCF12-203ENST00000343827 3956 ntTSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
SSX1Q16384 N4BP2L2-211ENST00000504114 2513 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
SSX1Q16384 AC233263.6-201ENST00000631132 1963 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SSX1Q16384 DCUN1D1-208ENST00000632685 3147 ntTSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
SSX1Q16384 MCF2-208ENST00000519895 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
SSX1Q16384 CCDC169-201ENST00000239859 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
SSX1Q16384 ATP6V1G3-202ENST00000309309 678 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
SSX1Q16384 MIR6073-201ENST00000352083 89 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SSX1Q16384 RNU6-251P-201ENST00000363235 104 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SSX1Q16384 RNU6-353P-201ENST00000364266 108 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SSX1Q16384 CXorf65-201ENST00000374251 601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
SSX1Q16384 RNU6-1074P-201ENST00000383995 104 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SSX1Q16384 MIR183-201ENST00000384958 110 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SSX1Q16384 TAS2R19-201ENST00000390673 1002 ntAPPRIS P1 BASIC2.43□□□□□ -2.02
SSX1Q16384 SNORA48.5-201ENST00000391143 135 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SSX1Q16384 SLC9B1P2-201ENST00000398120 1184 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SSX1Q16384 MTCO2P31-201ENST00000402702 684 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SSX1Q16384 AL139095.1-201ENST00000404326 391 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SSX1Q16384 AL365184.1-201ENST00000413801 572 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
SSX1Q16384 BX664727.1-201ENST00000416024 466 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SSX1Q16384 FNDC1-IT1-201ENST00000419703 516 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
SSX1Q16384 RPL21P32-201ENST00000419877 477 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SSX1Q16384 B3GALNT1P1-201ENST00000420569 975 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SSX1Q16384 UBE2V1P6-201ENST00000430840 422 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SSX1Q16384 AC005345.1-201ENST00000431868 217 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SSX1Q16384 TCF7L1-IT1-201ENST00000433581 458 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
SSX1Q16384 AC005208.1-201ENST00000435112 599 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
SSX1Q16384 AC068533.3-201ENST00000435524 404 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
SSX1Q16384 AC234064.1-201ENST00000436312 247 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SSX1Q16384 MTND4P15-201ENST00000437913 1033 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SSX1Q16384 AL645638.1-201ENST00000440519 361 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SSX1Q16384 MTND2P19-201ENST00000449129 1012 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SSX1Q16384 OR51B8P-201ENST00000449892 769 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SSX1Q16384 NIPA2P5-201ENST00000452282 464 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SSX1Q16384 NDUFA5P7-201ENST00000452914 242 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SSX1Q16384 AL445488.1-201ENST00000457272 706 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
SSX1Q16384 RPS4XP10-201ENST00000465034 731 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SSX1Q16384 AC020898.1-201ENST00000474167 787 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SSX1Q16384 AC093767.1-201ENST00000504523 156 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SSX1Q16384 AC138956.1-201ENST00000508187 504 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
SSX1Q16384 AC118282.2-201ENST00000508739 374 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SSX1Q16384 AC121161.1-201ENST00000510606 652 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SSX1Q16384 SAP18P1-201ENST00000512058 390 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SSX1Q16384 AC008885.1-201ENST00000514930 301 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SSX1Q16384 MTND5P4-201ENST00000514978 288 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SSX1Q16384 AC108515.1-201ENST00000517407 525 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
SSX1Q16384 TATDN1-206ENST00000519548 889 ntTSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
SSX1Q16384 AC022690.1-201ENST00000526681 550 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SSX1Q16384 AP002004.1-202ENST00000528437 586 ntTSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
SSX1Q16384 AP002370.2-203ENST00000533101 576 ntTSL 4 BASIC2.43□□□□□ -2.02
SSX1Q16384 AC018630.1-201ENST00000541376 925 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SSX1Q16384 REXO2-218ENST00000544827 880 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
SSX1Q16384 GLIPR1L1-204ENST00000548623 484 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
SSX1Q16384 H3F3AP1-201ENST00000559984 334 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SSX1Q16384 AC124283.4-201ENST00000581815 456 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SSX1Q16384 AC007001.1-201ENST00000590912 670 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
SSX1Q16384 AP002906.1-201ENST00000603405 233 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SSX1Q16384 AC008962.1-201ENST00000605729 304 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SSX1Q16384 AC092636.1-201ENST00000608609 415 ntTSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
SSX1Q16384 RASSF8-215ENST00000611440 852 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
SSX1Q16384 AC004696.1-201ENST00000614345 607 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SSX1Q16384 AL162274.2-201ENST00000614406 332 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SSX1Q16384 AL354696.2-202ENST00000620300 613 ntTSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
SSX1Q16384 AC026422.1-201ENST00000623961 452 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SSX1Q16384 FAR1-204ENST00000532502 5820 ntTSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
SSX1Q16384 CNBD1-202ENST00000518476 1594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
SSX1Q16384 ADAM18-206ENST00000520772 1429 ntTSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
SSX1Q16384 MTCO1P12-201ENST00000414273 1543 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SSX1Q16384 NUP58P1-201ENST00000502546 1738 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SSX1Q16384 SLC6A15-202ENST00000309283 3108 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
SSX1Q16384 IL6ST-205ENST00000381294 2574 ntTSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
SSX1Q16384 PKIB-202ENST00000354275 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
SSX1Q16384 ZBTB8OS-202ENST00000373501 598 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
SSX1Q16384 AC092447.6-201ENST00000414578 210 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SSX1Q16384 FCF1P2-201ENST00000415284 583 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SSX1Q16384 AL158156.1-201ENST00000422509 473 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SSX1Q16384 NIPA2P1-201ENST00000426223 976 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SSX1Q16384 AL353680.1-201ENST00000433788 337 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
SSX1Q16384 SNRPEP4-201ENST00000435815 279 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SSX1Q16384 AC091862.1-201ENST00000438016 1100 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SSX1Q16384 Z93403.1-202ENST00000440002 713 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
SSX1Q16384 AC019330.1-202ENST00000440609 504 ntTSL 4 BASIC2.42□□□□□ -2.02
SSX1Q16384 AC095032.1-201ENST00000444810 527 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 146.7 ms