Protein–RNA interactions for Protein: Q16288

NTRK3, NT-3 growth factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 839 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK3Q16288 NPFFR2-203ENST00000358749 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
NTRK3Q16288 AC010132.3-201ENST00000442788 2430 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
NTRK3Q16288 ZNF510-201ENST00000223428 5154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
NTRK3Q16288 SLC44A5-202ENST00000370859 3896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
NTRK3Q16288 C1orf112-202ENST00000359326 4002 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
NTRK3Q16288 KCTD16-201ENST00000507359 13950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
NTRK3Q16288 KIF15-203ENST00000425755 3460 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
NTRK3Q16288 KCNJ13-201ENST00000233826 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
NTRK3Q16288 THOC2-202ENST00000355725 4930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
NTRK3Q16288 SLC10A2-201ENST00000245312 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
NTRK3Q16288 ENOX2-202ENST00000370927 3788 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
NTRK3Q16288 AC009951.1-201ENST00000623674 2614 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
NTRK3Q16288 Y_RNA.279-201ENST00000364763 95 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
NTRK3Q16288 DPRX-201ENST00000376650 648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
NTRK3Q16288 SNORD51-201ENST00000384320 80 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
NTRK3Q16288 RNU6-278P-201ENST00000390945 109 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
NTRK3Q16288 AC009505.1-201ENST00000413151 424 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
NTRK3Q16288 AL807761.1-201ENST00000417622 171 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
NTRK3Q16288 RPS12P5-201ENST00000423449 371 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
NTRK3Q16288 PSMA2P3-201ENST00000429685 675 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
NTRK3Q16288 AC068287.1-201ENST00000430283 295 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
NTRK3Q16288 GTF2IP20-201ENST00000431663 360 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
NTRK3Q16288 AC239803.1-202ENST00000432038 590 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
NTRK3Q16288 AC007879.4-201ENST00000440545 361 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
NTRK3Q16288 BNIP3P2-201ENST00000441221 577 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
NTRK3Q16288 AC093019.1-201ENST00000443135 252 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
NTRK3Q16288 AL136972.1-201ENST00000443471 351 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
NTRK3Q16288 GEMIN8P3-201ENST00000445417 720 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
NTRK3Q16288 AL442647.1-201ENST00000449485 481 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
NTRK3Q16288 PMCHL2-203ENST00000457791 237 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
NTRK3Q16288 RPL23AP24-201ENST00000458203 385 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
NTRK3Q16288 RPL5P22-201ENST00000480199 884 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
NTRK3Q16288 RN7SL810P-201ENST00000493031 276 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
NTRK3Q16288 AC104164.2-201ENST00000496953 495 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
NTRK3Q16288 HMGN1P12-201ENST00000499125 195 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
NTRK3Q16288 LINC02469-201ENST00000506460 741 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
NTRK3Q16288 AC008728.1-201ENST00000512730 691 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
NTRK3Q16288 SNORD116-26-201ENST00000516006 96 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
NTRK3Q16288 SNORA40.12-201ENST00000516329 111 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
NTRK3Q16288 AC091564.3-201ENST00000527398 429 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
NTRK3Q16288 HIF1AP1-201ENST00000553642 175 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
NTRK3Q16288 LINC00519-201ENST00000557518 682 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
NTRK3Q16288 AC034105.3-201ENST00000565294 442 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
NTRK3Q16288 AC055876.1-202ENST00000567053 138 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
NTRK3Q16288 AC015917.1-201ENST00000579654 510 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
NTRK3Q16288 LINC01533-202ENST00000588694 632 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
NTRK3Q16288 AC005261.5-201ENST00000596280 355 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
NTRK3Q16288 AL356218.2-201ENST00000605264 187 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
NTRK3Q16288 AL136363.1-201ENST00000605349 337 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
NTRK3Q16288 AC113194.1-201ENST00000606037 500 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
NTRK3Q16288 AC007038.2-201ENST00000608095 740 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
NTRK3Q16288 MIR6820-201ENST00000611508 62 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
NTRK3Q16288 AC006504.8-201ENST00000621046 635 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
NTRK3Q16288 AC002550.2-201ENST00000621246 394 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
NTRK3Q16288 AL445363.3-201ENST00000623080 671 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
NTRK3Q16288 AC093648.1-201ENST00000623546 606 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
NTRK3Q16288 AC138649.5-201ENST00000637456 137 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
NTRK3Q16288 ZNF254-202ENST00000357002 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
NTRK3Q16288 LRRC3B-205ENST00000456208 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
NTRK3Q16288 ZKSCAN8-201ENST00000330236 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
NTRK3Q16288 POU2F1-202ENST00000367862 14038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
NTRK3Q16288 RNF180-202ENST00000389100 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
NTRK3Q16288 APAF1-209ENST00000550527 6581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
NTRK3Q16288 AC090971.4-201ENST00000560291 1800 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
NTRK3Q16288 ELAVL4-206ENST00000371827 3775 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
NTRK3Q16288 SLC4A10-203ENST00000415876 5578 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
NTRK3Q16288 RACGAP1-202ENST00000427314 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
NTRK3Q16288 DLG1-217ENST00000452595 3053 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
NTRK3Q16288 C6orf10-207ENST00000533191 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
NTRK3Q16288 FGF13-202ENST00000315930 19519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
NTRK3Q16288 LINC00862-201ENST00000367355 1417 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
NTRK3Q16288 TSHB-201ENST00000256592 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
NTRK3Q16288 Y_RNA.157-201ENST00000363638 102 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
NTRK3Q16288 SNORA69-201ENST00000383895 132 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
NTRK3Q16288 U3.29-201ENST00000391296 212 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
NTRK3Q16288 MYCBP2-AS1-201ENST00000422231 519 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
NTRK3Q16288 AC092832.1-201ENST00000422934 400 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
NTRK3Q16288 PDSS1P1-201ENST00000422953 1114 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
NTRK3Q16288 AL606489.2-201ENST00000433886 234 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
NTRK3Q16288 DDX3P2-201ENST00000446138 111 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
NTRK3Q16288 LINC00395-202ENST00000451570 415 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
NTRK3Q16288 ST13P14-201ENST00000474095 734 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
NTRK3Q16288 FTH1P21-201ENST00000512179 511 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
NTRK3Q16288 AC092542.1-201ENST00000513155 355 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
NTRK3Q16288 RNU6-835P-201ENST00000516974 104 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
NTRK3Q16288 AP001207.3-201ENST00000520268 491 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
NTRK3Q16288 RERG-IT1-201ENST00000539734 301 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
NTRK3Q16288 SNHG1-218ENST00000541615 748 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
NTRK3Q16288 RAB11AP2-201ENST00000545905 639 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
NTRK3Q16288 AL163932.1-201ENST00000555776 542 ntTSL 4 BASIC5.01□□□□□ -1.61
NTRK3Q16288 RPL21P12-201ENST00000559810 515 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
NTRK3Q16288 LINC02562-201ENST00000561705 785 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
NTRK3Q16288 AC007495.2-202ENST00000564102 535 ntTSL 4 BASIC5.01□□□□□ -1.61
NTRK3Q16288 AC022960.1-201ENST00000582269 348 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
NTRK3Q16288 AC105224.1-201ENST00000587055 421 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
NTRK3Q16288 AC087045.1-201ENST00000605856 382 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
NTRK3Q16288 ACYP2-208ENST00000606865 674 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
NTRK3Q16288 AC008781.3-201ENST00000622826 335 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
NTRK3Q16288 AL356585.4-201ENST00000623078 1229 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
NTRK3Q16288 AC112204.3-201ENST00000623822 332 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
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