Protein–RNA interactions for Protein: Q16143

SNCB, Beta-synuclein, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNCBQ16143 AC073346.2-201ENST00000624724 2058 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SNCBQ16143 AL049780.3-201ENST00000624612 1583 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SNCBQ16143 CEP57-213ENST00000541150 2911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
SNCBQ16143 MDM4-202ENST00000367180 547 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
SNCBQ16143 OR52E6-202ENST00000379946 954 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SNCBQ16143 SNORA54-201ENST00000384281 123 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SNCBQ16143 CTNNA2-204ENST00000409266 432 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
SNCBQ16143 MORF4L1P6-201ENST00000418771 268 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SNCBQ16143 AC112653.1-201ENST00000443851 386 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SNCBQ16143 AL513328.1-201ENST00000446460 224 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SNCBQ16143 C1DP3-201ENST00000455013 423 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SNCBQ16143 RNF138P1-201ENST00000502765 546 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SNCBQ16143 AC093523.1-201ENST00000503268 499 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
SNCBQ16143 AC114284.1-201ENST00000511422 1114 ntTSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
SNCBQ16143 AP003467.2-201ENST00000520175 319 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SNCBQ16143 AC079584.2-201ENST00000548756 515 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
SNCBQ16143 AC078814.3-201ENST00000553036 491 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SNCBQ16143 SERPINE4P-201ENST00000554978 281 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SNCBQ16143 AL136298.1-202ENST00000556520 518 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
SNCBQ16143 AC106900.2-201ENST00000604994 317 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SNCBQ16143 BNIP3P7-201ENST00000605641 516 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SNCBQ16143 NPPA-AS1_3.1-201ENST00000617059 108 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SNCBQ16143 CU459211.1-201ENST00000635667 749 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SNCBQ16143 CHD1-201ENST00000284049 6457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
SNCBQ16143 CKAP2P1-201ENST00000555477 2049 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SNCBQ16143 RGPD6-201ENST00000329516 7165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
SNCBQ16143 SNORD46.1-201ENST00000364139 104 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SNCBQ16143 RNU1-51P-201ENST00000365345 176 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SNCBQ16143 SNORA51.11-201ENST00000384442 131 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SNCBQ16143 MIR524-201ENST00000385242 87 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SNCBQ16143 RNA5SP171-201ENST00000391071 115 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SNCBQ16143 AC003092.1-201ENST00000415536 639 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
SNCBQ16143 Z75741.2-201ENST00000417272 1167 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SNCBQ16143 AL445989.1-202ENST00000418943 776 ntTSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
SNCBQ16143 LINC00400-201ENST00000425609 547 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
SNCBQ16143 MORF4L1P7-201ENST00000426038 703 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
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SNCBQ16143 NAP1L1P3-201ENST00000462291 880 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
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SNCBQ16143 AC012055.2-201ENST00000504167 335 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
SNCBQ16143 LINC02465-201ENST00000507099 532 ntTSL 4 BASIC2.47□□□□□ -2.01
SNCBQ16143 AC018752.1-201ENST00000507813 206 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
SNCBQ16143 MGAT4D-203ENST00000511113 1125 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
SNCBQ16143 AC112673.1-201ENST00000513168 575 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SNCBQ16143 LINC02460-201ENST00000543558 536 ntTSL 4 BASIC2.47□□□□□ -2.01
SNCBQ16143 AC007513.1-201ENST00000548740 379 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
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SNCBQ16143 AC023158.1-201ENST00000561632 1025 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SNCBQ16143 MIR4658-201ENST00000584344 65 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SNCBQ16143 NRBF2P5-201ENST00000603087 788 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SNCBQ16143 NTAN1P1-201ENST00000603150 646 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SNCBQ16143 AC024220.1-201ENST00000603675 484 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SNCBQ16143 Hammerhead_HH10.1-201ENST00000620658 125 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SNCBQ16143 MIR8057-201ENST00000620957 69 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SNCBQ16143 OR5H15-202ENST00000641450 1229 ntAPPRIS P1 BASIC2.47□□□□□ -2.01
SNCBQ16143 EVI2A-201ENST00000247270 1860 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
SNCBQ16143 JCHAIN-206ENST00000543780 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
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SNCBQ16143 RNU6-1249P-201ENST00000363237 111 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SNCBQ16143 RNU1-52P-201ENST00000384190 164 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SNCBQ16143 SNORA9-201ENST00000384215 133 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SNCBQ16143 RNU6-193P-201ENST00000410977 107 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SNCBQ16143 LINC01318-201ENST00000423593 597 ntTSL 4 BASIC2.46□□□□□ -2.02
SNCBQ16143 AC007403.1-201ENST00000427579 567 ntTSL 4 BASIC2.46□□□□□ -2.02
SNCBQ16143 RNF2P1-201ENST00000442955 1010 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SNCBQ16143 AC099677.4-201ENST00000446786 380 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
SNCBQ16143 LINC01766-201ENST00000453968 362 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
SNCBQ16143 APOA2-210ENST00000491350 263 ntTSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
SNCBQ16143 AC027031.1-201ENST00000517318 489 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
SNCBQ16143 AC090739.1-201ENST00000522190 708 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
SNCBQ16143 MIR4325-201ENST00000583049 90 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SNCBQ16143 OR1M4P-201ENST00000589199 287 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
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SNCBQ16143 AC105265.4-201ENST00000618391 306 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
SNCBQ16143 AC079597.1-201ENST00000624306 508 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SNCBQ16143 SATB1-AS1-266ENST00000630271 813 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
SNCBQ16143 EXTL2-201ENST00000370113 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
SNCBQ16143 AC008669.1-201ENST00000565823 2178 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SNCBQ16143 DNAH7-201ENST00000312428 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
SNCBQ16143 ZNF567-201ENST00000360729 2691 ntTSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
SNCBQ16143 DEFB112-201ENST00000322246 342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
SNCBQ16143 RNA5SP374-201ENST00000362939 125 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
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SNCBQ16143 TRAV24-201ENST00000390453 343 ntAPPRIS P1 BASIC2.45□□□□□ -2.02
SNCBQ16143 DSCR4-IT1-201ENST00000417138 424 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
SNCBQ16143 MTCO2P17-201ENST00000424336 677 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SNCBQ16143 AC006548.1-201ENST00000427470 102 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SNCBQ16143 AL451062.2-201ENST00000427515 271 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SNCBQ16143 AL513175.1-201ENST00000431492 780 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SNCBQ16143 OR4K11P-201ENST00000431829 904 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SNCBQ16143 AL358972.1-201ENST00000434356 466 ntTSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
SNCBQ16143 AC011816.1-201ENST00000441346 546 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
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