Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 AC105252.1-201ENST00000503089 286 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 AK3P4-201ENST00000504283 583 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 AC099499.1-201ENST00000505040 558 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 CTD-2350J17.1-201ENST00000509228 362 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 PLAC8-205ENST00000509973 489 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 AC017037.2-201ENST00000513850 890 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 LINC02014-201ENST00000514010 713 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 AC012625.1-201ENST00000515153 625 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 SCARNA15.2-201ENST00000516409 127 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 SNORA31.9-201ENST00000516429 84 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 RNA5SP367-201ENST00000516557 118 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 ZFPM2-AS1-204ENST00000520433 748 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 TMEM68-214ENST00000523073 536 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 AC092745.2-201ENST00000537764 620 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 PRR4-206ENST00000540107 388 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 MRPL42-203ENST00000547098 701 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 LINC01481-201ENST00000552998 629 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 JKAMP-212ENST00000556985 592 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 AC020891.1-201ENST00000558785 174 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 AC087465.1-201ENST00000560574 245 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 AC025281.1-201ENST00000567026 265 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 AC138915.2-201ENST00000569776 97 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 AC106796.1-201ENST00000577173 615 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 AC006270.1-201ENST00000582889 478 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 MIR3670-2-201ENST00000582974 65 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 MIR3670-1-201ENST00000584160 65 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 MIR3670-3-201ENST00000584855 65 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 HMGN2P15-201ENST00000585707 270 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 AC083760.1-201ENST00000589621 670 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 AC011524.1-201ENST00000590167 240 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 SATB1-AS1-207ENST00000593741 955 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 AC022145.1-201ENST00000600673 383 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 AC068790.7-201ENST00000602347 528 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 AL356280.1-201ENST00000603614 379 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 SNORA62.6-201ENST00000606322 83 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 AL023583.1-201ENST00000607518 1143 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 MIR3670-4-201ENST00000612260 65 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 HMGB1P24-202ENST00000615653 685 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 MIR6826-201ENST00000617808 98 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 AC084824.4-201ENST00000620106 731 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 MIR8059-201ENST00000620427 81 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 OR8K3-202ENST00000623845 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.32□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 PPP2R5C-226ENST00000557095 1307 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 CCDC82-201ENST00000278520 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 HSPA4L-202ENST00000505726 2639 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 APC-201ENST00000257430 10701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 AL359693.1-201ENST00000614959 2407 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 NR3C1-212ENST00000504572 3389 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 BCLAF1P1-201ENST00000505813 2752 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 MAP3K7-202ENST00000369325 4633 ntTSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 ESD-201ENST00000378697 1079 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 MIR181B1-201ENST00000385240 110 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 SNX10-203ENST00000409367 746 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 LINC01829-201ENST00000414404 571 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 AC010745.2-201ENST00000420404 839 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 MTCO3P30-201ENST00000426425 670 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 BLOC1S2P1-201ENST00000428431 301 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 CST9LP2-201ENST00000437612 320 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 LINC00446-202ENST00000438327 357 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 AC092427.1-201ENST00000439177 601 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
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VAMP3Q15836 AC044781.1-201ENST00000446193 570 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
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VAMP3Q15836 MRPL42P4-201ENST00000453267 443 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 AL391704.1-202ENST00000453889 874 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 DCLRE1CP1-201ENST00000454630 470 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 AC233279.1-201ENST00000455300 423 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 RN7SL303P-201ENST00000469773 251 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
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VAMP3Q15836 AC126182.1-201ENST00000478134 357 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 AC004453.1-201ENST00000487895 408 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 AC008953.1-201ENST00000497334 318 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 AC108475.1-201ENST00000507880 950 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 AC021180.1-201ENST00000508581 558 ntTSL 4 BASIC2.31□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 FCF1P8-201ENST00000510322 597 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 RNU6-362P-201ENST00000516736 90 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 AC025524.2-206ENST00000517953 439 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 UTS2-201ENST00000054668 420 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 TIMM9-208ENST00000556007 746 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 FRMD6-AS2-202ENST00000557625 581 ntTSL 4 BASIC2.31□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 ARPP19-205ENST00000563566 568 ntTSL 4 BASIC2.31□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 AC091691.2-201ENST00000581940 567 ntTSL 4 BASIC2.31□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 AC015726.1-201ENST00000602353 681 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 DUXAP3-201ENST00000603616 594 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 AL049779.4-201ENST00000604500 156 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 AL161616.1-201ENST00000611867 286 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 AL138686.1-201ENST00000612699 315 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 AP003355.3-201ENST00000623465 114 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 OR2M2-202ENST00000641211 1229 ntAPPRIS P1 BASIC2.31□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 AP000553.6-201ENST00000641242 118 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 MTCO1P11-201ENST00000429111 1528 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 PABPC1P9-201ENST00000426076 1612 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 AC097714.1-201ENST00000511272 1647 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 SCOC-202ENST00000394201 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 OR2J3-203ENST00000641960 3342 ntAPPRIS P1 BASIC2.3□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 ZNF334-205ENST00000615481 3706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 TAB3-203ENST00000378930 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
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