Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 RNU2-25P-201ENST00000411041 191 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SS18Q15532 RAD23BP2-201ENST00000416003 1207 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SS18Q15532 AL078590.2-202ENST00000422736 568 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
SS18Q15532 AL021026.1-201ENST00000422841 658 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
SS18Q15532 AL512658.1-202ENST00000433486 400 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
SS18Q15532 AC022537.1-201ENST00000435271 446 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
SS18Q15532 AL359706.1-201ENST00000437748 315 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
SS18Q15532 Z75741.1-201ENST00000446793 314 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SS18Q15532 AC004022.1-201ENST00000447766 1066 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SS18Q15532 AC112492.1-201ENST00000449607 712 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SS18Q15532 AL589935.1-212ENST00000450998 525 ntTSL 2 BASIC1.98□□□□□ -2.09
SS18Q15532 PLCB1-IT1-202ENST00000451443 251 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
SS18Q15532 AC104073.1-201ENST00000451988 151 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SS18Q15532 CDC42P1-201ENST00000456658 548 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SS18Q15532 AC006148.2-201ENST00000467017 650 ntTSL 2 BASIC1.98□□□□□ -2.09
SS18Q15532 MIR1302-2HG-201ENST00000469289 535 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
SS18Q15532 CRISP1-203ENST00000505118 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
SS18Q15532 LINC02198-202ENST00000505371 526 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
SS18Q15532 INPP4B-206ENST00000506217 673 ntTSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
SS18Q15532 SCGB1D5P-201ENST00000515134 247 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SS18Q15532 CDKL3-207ENST00000521755 586 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
SS18Q15532 OR8K2P-201ENST00000524645 927 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SS18Q15532 CTAGE1-202ENST00000525417 1267 ntAPPRIS ALT2 BASIC1.98□□□□□ -2.09
SS18Q15532 AP002004.1-202ENST00000528437 586 ntTSL 2 BASIC1.98□□□□□ -2.09
SS18Q15532 TSPAN19-204ENST00000532498 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
SS18Q15532 LSM6P2-201ENST00000552208 177 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SS18Q15532 AC011611.5-201ENST00000552477 578 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SS18Q15532 H3F3AP1-201ENST00000559984 334 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SS18Q15532 MAFTRR-204ENST00000568389 506 ntTSL 4 BASIC1.98□□□□□ -2.09
SS18Q15532 AC138761.3-201ENST00000579993 334 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SS18Q15532 COX6CP3-201ENST00000580869 223 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SS18Q15532 AC124283.4-201ENST00000581815 456 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SS18Q15532 AC023043.3-201ENST00000593113 385 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SS18Q15532 AC020895.1-201ENST00000595362 272 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SS18Q15532 AC097467.3-205ENST00000597955 594 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
SS18Q15532 RPL23AP78-201ENST00000599928 470 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SS18Q15532 AC133794.1-201ENST00000602731 914 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SS18Q15532 AL160281.1-201ENST00000605307 311 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SS18Q15532 CEP164P1-207ENST00000608660 504 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
SS18Q15532 AL162574.2-201ENST00000614618 657 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SS18Q15532 AC090116.1-201ENST00000615679 446 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SS18Q15532 MIR7975-201ENST00000619350 68 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SS18Q15532 AC018755.4-201ENST00000619715 454 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SS18Q15532 CNOT1-223ENST00000628857 291 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
SS18Q15532 FO624990.1-201ENST00000636373 85 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SS18Q15532 OR51A4-202ENST00000641898 4393 ntAPPRIS P1 BASIC1.98□□□□□ -2.09
SS18Q15532 IL33-203ENST00000456383 2501 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
SS18Q15532 ATF2-204ENST00000409437 3697 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
SS18Q15532 NT5C3A-202ENST00000381626 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
SS18Q15532 MTRNR2L10-201ENST00000545075 1530 ntAPPRIS P1 BASIC1.97□□□□□ -2.09
SS18Q15532 UGT2A2-201ENST00000604021 1544 ntTSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
SS18Q15532 GCNT4-201ENST00000322348 5554 ntAPPRIS P1 BASIC1.97□□□□□ -2.09
SS18Q15532 SIRT1-202ENST00000403579 3333 ntTSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
SS18Q15532 AC073325.2-201ENST00000339545 159 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SS18Q15532 SNORA38.1-201ENST00000364172 131 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SS18Q15532 AL121978.1-201ENST00000402778 359 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SS18Q15532 MTCO3P12-201ENST00000416718 547 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SS18Q15532 LHFPL3-AS1-203ENST00000417290 950 ntTSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
SS18Q15532 RPL21P32-201ENST00000419877 477 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SS18Q15532 AC246680.2-201ENST00000422106 389 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SS18Q15532 AC005300.1-201ENST00000428401 373 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SS18Q15532 AL591503.2-201ENST00000442314 1005 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SS18Q15532 LINC00393-201ENST00000443621 282 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
SS18Q15532 PRDX3P3-201ENST00000447765 522 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SS18Q15532 AC009961.3-201ENST00000449832 765 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SS18Q15532 ITCH-AS1-201ENST00000454205 299 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
SS18Q15532 NAP1L1P3-201ENST00000462291 880 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SS18Q15532 RPS4XP10-201ENST00000465034 731 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SS18Q15532 AC078857.1-201ENST00000469870 667 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SS18Q15532 RN7SL807P-201ENST00000470923 297 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SS18Q15532 LINC02325-201ENST00000499910 1115 ntTSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
SS18Q15532 CAB39P1-201ENST00000502277 460 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SS18Q15532 MTND3P24-201ENST00000506306 329 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SS18Q15532 AC112518.2-201ENST00000508565 425 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SS18Q15532 AC074250.1-201ENST00000511117 192 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SS18Q15532 LINC01088-208ENST00000511895 795 ntTSL 2 BASIC1.97□□□□□ -2.09
SS18Q15532 AC097467.3-212ENST00000512269 568 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
SS18Q15532 MTND5P4-201ENST00000514978 288 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SS18Q15532 SNORA31.15-201ENST00000516771 132 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SS18Q15532 RNU4ATAC10P-201ENST00000516967 122 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SS18Q15532 AC087373.1-201ENST00000524920 491 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SS18Q15532 OOSP2-203ENST00000532905 496 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
SS18Q15532 AL121603.1-201ENST00000553815 142 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SS18Q15532 TIMM9-209ENST00000556367 572 ntTSL 2 BASIC1.97□□□□□ -2.09
SS18Q15532 AL157402.2-201ENST00000566394 416 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
SS18Q15532 AC007906.1-201ENST00000568648 510 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
SS18Q15532 RN7SL622P-201ENST00000585292 275 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SS18Q15532 AC010127.1-205ENST00000595268 567 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
SS18Q15532 AC092474.3-201ENST00000603022 568 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SS18Q15532 RPL12P50-201ENST00000603116 116 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SS18Q15532 AC015871.2-201ENST00000603605 948 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SS18Q15532 BNIP3P11-201ENST00000603878 563 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SS18Q15532 MIR8084-201ENST00000614105 89 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SS18Q15532 AC092650.2-201ENST00000619984 902 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SS18Q15532 C8orf89-202ENST00000624510 658 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
SS18Q15532 AC097372.4-201ENST00000625025 466 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SS18Q15532 AC012594.1-272ENST00000625790 710 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
SS18Q15532 SATB1-AS1-243ENST00000627546 589 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
SS18Q15532 AC091948.2-201ENST00000636510 279 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SS18Q15532 ZNF804A-202ENST00000613975 3986 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.4 ms