Protein–RNA interactions for Protein: Q15035

TRAM2, Translocating chain-associated membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2Q15035 AC080188.3-201ENST00000624842 748 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TRAM2Q15035 PCBP1-AS1-348ENST00000629506 667 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
TRAM2Q15035 MTCO1P23-201ENST00000415223 1526 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TRAM2Q15035 SYCP2-201ENST00000357552 5567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
TRAM2Q15035 MLF1-203ENST00000392822 2157 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
TRAM2Q15035 MACC1-202ENST00000400331 9159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
TRAM2Q15035 NXPE1-204ENST00000536271 2289 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
TRAM2Q15035 MTCO1P12-201ENST00000414273 1543 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TRAM2Q15035 KRTAP15-1-201ENST00000334067 671 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
TRAM2Q15035 RNU6-492P-201ENST00000363035 104 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TRAM2Q15035 KRTAP22-2-201ENST00000382830 293 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
TRAM2Q15035 CD24P4-201ENST00000382840 243 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TRAM2Q15035 SNORD51-201ENST00000384320 80 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TRAM2Q15035 U3.19-201ENST00000390893 196 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TRAM2Q15035 ARF4P3-201ENST00000397387 509 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TRAM2Q15035 FAT1P1-201ENST00000406588 507 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TRAM2Q15035 RPS15AP38-201ENST00000413110 372 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TRAM2Q15035 SSXP9-201ENST00000417503 292 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TRAM2Q15035 LINC01473-202ENST00000427108 695 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
TRAM2Q15035 AP001117.1-201ENST00000428205 609 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
TRAM2Q15035 BLOC1S2P1-201ENST00000428431 301 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TRAM2Q15035 LINC00457-201ENST00000428706 413 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
TRAM2Q15035 CLEC5A-202ENST00000438351 743 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
TRAM2Q15035 RNA5SP310-201ENST00000459084 116 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TRAM2Q15035 RPL21P41-201ENST00000459863 264 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TRAM2Q15035 AC013828.1-201ENST00000481845 158 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TRAM2Q15035 DYNLL1P6-201ENST00000503440 264 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TRAM2Q15035 PRELID3BP6-201ENST00000503839 571 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TRAM2Q15035 HSPD1P15-201ENST00000505573 1122 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TRAM2Q15035 AC005699.1-201ENST00000510095 555 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
TRAM2Q15035 AC093535.1-201ENST00000515808 747 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
TRAM2Q15035 snoZ278.1-201ENST00000517059 112 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TRAM2Q15035 AC022390.1-201ENST00000517854 434 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
TRAM2Q15035 AC025524.2-211ENST00000519990 1173 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
TRAM2Q15035 LINC02267-202ENST00000522173 799 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
TRAM2Q15035 AC044913.1-201ENST00000557200 430 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TRAM2Q15035 C15orf65-201ENST00000569691 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
TRAM2Q15035 AC016493.1-201ENST00000586106 688 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
TRAM2Q15035 AC245036.5-201ENST00000596330 847 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TRAM2Q15035 ADARB1-213ENST00000611195 159 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
TRAM2Q15035 AC007318.2-201ENST00000620999 243 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TRAM2Q15035 SATB1-AS1-266ENST00000630271 813 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
TRAM2Q15035 AL035425.3-201ENST00000564206 4996 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TRAM2Q15035 POMP-202ENST00000460403 1428 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
TRAM2Q15035 ISPD-AS1-202ENST00000438573 2252 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
TRAM2Q15035 SUCLA2P2-201ENST00000417269 1309 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TRAM2Q15035 ATF2-204ENST00000409437 3697 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
TRAM2Q15035 LINC01625-201ENST00000454788 1690 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
TRAM2Q15035 HMGB1P5-201ENST00000255320 642 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TRAM2Q15035 LINC00301-201ENST00000320202 852 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
TRAM2Q15035 MIR22-201ENST00000362190 85 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TRAM2Q15035 Y_RNA.110-201ENST00000363220 99 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TRAM2Q15035 RNU6-1066P-201ENST00000363573 105 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TRAM2Q15035 SNORA1.3-201ENST00000384676 136 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TRAM2Q15035 MCTS2P-201ENST00000394552 546 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TRAM2Q15035 RNU2-28P-201ENST00000410457 189 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TRAM2Q15035 RNU2-15P-201ENST00000410692 191 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TRAM2Q15035 AC005104.1-201ENST00000414896 442 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
TRAM2Q15035 AL353678.1-201ENST00000422735 741 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TRAM2Q15035 AL021026.1-201ENST00000422841 658 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
TRAM2Q15035 ZFY-AS1-202ENST00000431145 419 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
TRAM2Q15035 AP002512.3-201ENST00000440231 985 ntAPPRIS P1 BASIC2.74□□□□□ -1.97
TRAM2Q15035 AL391704.1-202ENST00000453889 874 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
TRAM2Q15035 SIDT1-AS1-201ENST00000462180 465 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
TRAM2Q15035 RPS29P2-201ENST00000479278 136 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TRAM2Q15035 AC092059.1-201ENST00000485347 429 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
TRAM2Q15035 CBX3P3-201ENST00000508108 532 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TRAM2Q15035 LINC02113-201ENST00000510302 336 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
TRAM2Q15035 RNU5A-7P-201ENST00000515979 116 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TRAM2Q15035 AP001804.3-201ENST00000525146 880 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TRAM2Q15035 ATF7IP2-206ENST00000543967 998 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
TRAM2Q15035 MAPK1-204ENST00000544786 951 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
TRAM2Q15035 AL359233.1-201ENST00000554029 364 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
TRAM2Q15035 AC090985.1-201ENST00000554440 480 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
TRAM2Q15035 AL136520.1-202ENST00000555494 763 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TRAM2Q15035 MED28P6-201ENST00000558776 231 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TRAM2Q15035 AP005205.1-201ENST00000563503 508 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TRAM2Q15035 AC127024.3-201ENST00000582841 460 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
TRAM2Q15035 AC118755.2-201ENST00000584676 212 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
TRAM2Q15035 AC008543.4-201ENST00000585694 442 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
TRAM2Q15035 AC083760.1-201ENST00000589621 670 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TRAM2Q15035 AC104534.1-201ENST00000594558 566 ntTSL 4 BASIC2.74□□□□□ -1.97
TRAM2Q15035 AC100781.1-202ENST00000597906 463 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
TRAM2Q15035 ACYP2-208ENST00000606865 674 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
TRAM2Q15035 MIR663AHG-231ENST00000609044 590 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
TRAM2Q15035 AC107871.2-201ENST00000612894 502 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TRAM2Q15035 Z99129.2-201ENST00000619967 314 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TRAM2Q15035 AC068880.4-201ENST00000623082 495 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TRAM2Q15035 SATB1-AS1-237ENST00000626982 735 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
TRAM2Q15035 LINC00836-203ENST00000628620 1179 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
TRAM2Q15035 PROX1-AS1-244ENST00000630355 599 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
TRAM2Q15035 FAM35A-202ENST00000298786 3614 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
TRAM2Q15035 AP003122.5-201ENST00000527668 3766 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TRAM2Q15035 CHD9-218ENST00000566029 13110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
TRAM2Q15035 LIG4-203ENST00000442234 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
TRAM2Q15035 AL445259.1-201ENST00000587106 2984 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
TRAM2Q15035 OR5BR1P-201ENST00000524992 1330 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TRAM2Q15035 IKZF2-213ENST00000457361 9350 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
TRAM2Q15035 PRKG1-205ENST00000401604 5922 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
TRAM2Q15035 AC233263.6-201ENST00000631132 1963 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.8 ms