Protein–RNA interactions for Protein: Q15021

NCAPD2, Condensin complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,401 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPD2Q15021 SNORD6-201ENST00000365444 73 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
NCAPD2Q15021 HTN3-201ENST00000381057 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
NCAPD2Q15021 AL445529.1-201ENST00000398713 389 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
NCAPD2Q15021 AL023807.1-201ENST00000407932 359 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
NCAPD2Q15021 RNA5SP56-201ENST00000410277 118 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
NCAPD2Q15021 Z93242.1-201ENST00000427102 353 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
NCAPD2Q15021 MTCYBP15-201ENST00000433123 1127 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
NCAPD2Q15021 CLEC5A-202ENST00000438351 743 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
NCAPD2Q15021 AL513328.1-201ENST00000446460 224 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
NCAPD2Q15021 MND1-203ENST00000504860 638 ntTSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
NCAPD2Q15021 AC091860.1-201ENST00000505723 432 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
NCAPD2Q15021 AC104304.1-201ENST00000505797 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
NCAPD2Q15021 AC113385.1-201ENST00000511468 563 ntTSL 4 BASIC3.61□□□□□ -1.83
NCAPD2Q15021 RNU4ATAC10P-201ENST00000516967 122 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
NCAPD2Q15021 RNU6-467P-201ENST00000517027 110 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
NCAPD2Q15021 RNU6-1073P-201ENST00000517182 106 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
NCAPD2Q15021 AF279873.4-202ENST00000521714 511 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
NCAPD2Q15021 AC109635.4-202ENST00000531666 412 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
NCAPD2Q15021 AL035078.2-201ENST00000533832 326 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
NCAPD2Q15021 AHI1-217ENST00000534469 680 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
NCAPD2Q15021 AC087894.1-201ENST00000538359 518 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
NCAPD2Q15021 AP002993.1-201ENST00000538624 210 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
NCAPD2Q15021 AC007493.1-202ENST00000567899 517 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
NCAPD2Q15021 RPL26-207ENST00000583011 524 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
NCAPD2Q15021 SNORD39.3-201ENST00000584451 71 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
NCAPD2Q15021 ZEB2-AS1-204ENST00000595109 855 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
NCAPD2Q15021 AC090115.4-201ENST00000609970 188 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
NCAPD2Q15021 AC090116.1-201ENST00000615679 446 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
NCAPD2Q15021 AC009039.2-201ENST00000624524 529 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
NCAPD2Q15021 AP001350.1-201ENST00000601906 1524 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
NCAPD2Q15021 PARPBP-201ENST00000327680 3014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
NCAPD2Q15021 SEMA3D-201ENST00000284136 6265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
NCAPD2Q15021 FAM69A-202ENST00000613047 2646 ntTSL 4 BASIC3.6□□□□□ -1.83
NCAPD2Q15021 JCHAIN-206ENST00000543780 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
NCAPD2Q15021 CLCA4-201ENST00000370563 3211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
NCAPD2Q15021 DDX60L-207ENST00000505890 4568 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
NCAPD2Q15021 ASNSP3-201ENST00000451989 1306 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
NCAPD2Q15021 RNU2-71P-201ENST00000411395 189 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
NCAPD2Q15021 AC009276.1-201ENST00000422042 253 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
NCAPD2Q15021 ABCC13-201ENST00000429114 611 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
NCAPD2Q15021 AL035407.1-201ENST00000429211 571 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
NCAPD2Q15021 LINC01004-201ENST00000445184 686 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
NCAPD2Q15021 AC004022.1-201ENST00000447766 1066 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
NCAPD2Q15021 CEACAMP4-201ENST00000457676 421 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
NCAPD2Q15021 RPL21P41-201ENST00000459863 264 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
NCAPD2Q15021 RPL21P18-201ENST00000469899 480 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
NCAPD2Q15021 RPL23AP55-201ENST00000498163 452 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
NCAPD2Q15021 PTK2-220ENST00000520151 573 ntTSL 4 BASIC3.6□□□□□ -1.83
NCAPD2Q15021 ZNF705CP-201ENST00000530515 889 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
NCAPD2Q15021 AC091544.4-201ENST00000555268 342 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
NCAPD2Q15021 AL157394.1-201ENST00000562983 1224 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
NCAPD2Q15021 MAFTRR-204ENST00000568389 506 ntTSL 4 BASIC3.6□□□□□ -1.83
NCAPD2Q15021 AL669831.4-202ENST00000590817 238 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
NCAPD2Q15021 AC008764.2-201ENST00000597226 376 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
NCAPD2Q15021 AC027045.1-201ENST00000609065 202 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
NCAPD2Q15021 ATXN3L-202ENST00000622204 837 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
NCAPD2Q15021 BTG3-AS1-201ENST00000626994 552 ntTSL 4 BASIC3.6□□□□□ -1.83
NCAPD2Q15021 AC006927.2-201ENST00000639256 389 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
NCAPD2Q15021 CCDC54-201ENST00000261058 1444 ntAPPRIS P1 BASIC3.59□□□□□ -1.83
NCAPD2Q15021 CFHR3-201ENST00000367425 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
NCAPD2Q15021 ECT2-204ENST00000392692 4158 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
NCAPD2Q15021 EXOC6-203ENST00000371552 3564 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
NCAPD2Q15021 CLOCK-201ENST00000309964 10304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
NCAPD2Q15021 KCNT2-202ENST00000367433 5883 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
NCAPD2Q15021 EVI5-208ENST00000540033 7436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
NCAPD2Q15021 PTPRC-202ENST00000367364 1017 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
NCAPD2Q15021 RNU6-629P-201ENST00000384061 103 ntBASIC3.59□□□□□ -1.84
NCAPD2Q15021 SNORA40.4-201ENST00000390971 128 ntBASIC3.59□□□□□ -1.84
NCAPD2Q15021 PGAP1-203ENST00000409188 1246 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.84
NCAPD2Q15021 OFD1P1Y-201ENST00000411756 1225 ntBASIC3.59□□□□□ -1.84
NCAPD2Q15021 AC092638.1-201ENST00000411966 1275 ntBASIC3.59□□□□□ -1.84
NCAPD2Q15021 AL133384.1-201ENST00000412744 351 ntBASIC3.59□□□□□ -1.84
NCAPD2Q15021 AC009963.1-201ENST00000417265 157 ntBASIC3.59□□□□□ -1.84
NCAPD2Q15021 AL078590.2-202ENST00000422736 568 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.84
NCAPD2Q15021 AP001599.1-201ENST00000426771 361 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.84
NCAPD2Q15021 RPL23AP16-201ENST00000441715 421 ntBASIC3.59□□□□□ -1.84
NCAPD2Q15021 AC104073.1-201ENST00000451988 151 ntBASIC3.59□□□□□ -1.84
NCAPD2Q15021 SNRPG-206ENST00000454893 527 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.84
NCAPD2Q15021 AL136164.1-201ENST00000456795 352 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.84
NCAPD2Q15021 snoU13.3-201ENST00000459441 104 ntBASIC3.59□□□□□ -1.84
NCAPD2Q15021 RPL21P104-201ENST00000464143 478 ntBASIC3.59□□□□□ -1.84
NCAPD2Q15021 ZNF131-215ENST00000509931 970 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.84
NCAPD2Q15021 PAIP2-205ENST00000510080 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
NCAPD2Q15021 RN7SKP244-201ENST00000516513 307 ntBASIC3.59□□□□□ -1.84
NCAPD2Q15021 RNA5SP135-201ENST00000517019 125 ntBASIC3.59□□□□□ -1.84
NCAPD2Q15021 ARL2BPP5-201ENST00000523141 481 ntBASIC3.59□□□□□ -1.84
NCAPD2Q15021 PDCL2P2-201ENST00000533651 189 ntBASIC3.59□□□□□ -1.84
NCAPD2Q15021 SMILR-201ENST00000533992 553 ntTSL 4 BASIC3.59□□□□□ -1.84
NCAPD2Q15021 ZNF192P1-203ENST00000565888 810 ntBASIC3.59□□□□□ -1.84
NCAPD2Q15021 AC093519.1-201ENST00000566109 298 ntBASIC3.59□□□□□ -1.84
NCAPD2Q15021 C16orf97-203ENST00000566314 281 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.84
NCAPD2Q15021 TMEM87A-212ENST00000568432 750 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.84
NCAPD2Q15021 AC022809.1-201ENST00000579247 428 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.84
NCAPD2Q15021 MIR3690-201ENST00000580266 75 ntBASIC3.59□□□□□ -1.84
NCAPD2Q15021 MIR6817-201ENST00000615588 66 ntBASIC3.59□□□□□ -1.84
NCAPD2Q15021 AC105265.4-201ENST00000618391 306 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.84
NCAPD2Q15021 AL512506.2-201ENST00000624472 458 ntBASIC3.59□□□□□ -1.84
NCAPD2Q15021 SLITRK6-201ENST00000400286 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
NCAPD2Q15021 GCNT4-201ENST00000322348 5554 ntAPPRIS P1 BASIC3.59□□□□□ -1.84
NCAPD2Q15021 DBF4P1-201ENST00000412976 1892 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.6 ms