Protein–RNA interactions for Protein: Q14990

ODF1, Outer dense fiber protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF1Q14990 AC018442.2-201ENST00000523658 648 ntTSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
ODF1Q14990 CYCSP25-201ENST00000525280 316 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
ODF1Q14990 AC010768.4-201ENST00000528183 520 ntTSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
ODF1Q14990 AC008149.1-201ENST00000551844 525 ntTSL 4 BASIC4.01□□□□□ -1.77
ODF1Q14990 AL355102.1-201ENST00000555383 460 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
ODF1Q14990 MIR4502-201ENST00000580432 81 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
ODF1Q14990 AC011712.1-201ENST00000588959 234 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
ODF1Q14990 AL589765.7-201ENST00000601684 629 ntTSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
ODF1Q14990 AC008280.3-201ENST00000606436 732 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
ODF1Q14990 LINC00310-206ENST00000609947 892 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
ODF1Q14990 MUCL1-205ENST00000619042 243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
ODF1Q14990 AC092794.2-201ENST00000620933 563 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
ODF1Q14990 AC046195.1-201ENST00000518973 4171 ntTSL 2 BASIC4.01□□□□□ -1.77
ODF1Q14990 C6orf10-207ENST00000533191 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
ODF1Q14990 METTL18-201ENST00000303469 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
ODF1Q14990 SDHC-202ENST00000367975 13566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
ODF1Q14990 EEF1A1-211ENST00000615060 3508 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
ODF1Q14990 LRRC8B-201ENST00000330947 7593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
ODF1Q14990 CEP120-203ENST00000328236 4710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
ODF1Q14990 SPAG5-AS1-202ENST00000424210 1551 ntTSL 2 BASIC4.01□□□□□ -1.77
ODF1Q14990 AL731566.1-201ENST00000620490 1937 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
ODF1Q14990 SULF1-204ENST00000458141 5551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
ODF1Q14990 PNPLA8-204ENST00000426128 4268 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
ODF1Q14990 SLC10A7-203ENST00000432059 3747 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
ODF1Q14990 LRRC49-224ENST00000560691 2531 ntTSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
ODF1Q14990 DTWD2-201ENST00000304058 4365 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
ODF1Q14990 AL033397.1-201ENST00000502390 3653 ntTSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
ODF1Q14990 ANK2-202ENST00000357077 14196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
ODF1Q14990 PCDH15-201ENST00000320301 6845 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
ODF1Q14990 GRID2-208ENST00000611049 4844 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
ODF1Q14990 FAM196B-201ENST00000377365 2999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
ODF1Q14990 ZNF573-208ENST00000536220 2257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
ODF1Q14990 C5orf46-201ENST00000318315 506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
ODF1Q14990 RNA5SP485-201ENST00000365053 119 ntBASIC4□□□□□ -1.77
ODF1Q14990 CRP-204ENST00000368112 787 ntTSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
ODF1Q14990 SNORA48.4-201ENST00000391089 134 ntBASIC4□□□□□ -1.77
ODF1Q14990 GCNT1P4-201ENST00000404096 329 ntBASIC4□□□□□ -1.77
ODF1Q14990 U3.42-201ENST00000408746 214 ntBASIC4□□□□□ -1.77
ODF1Q14990 RSU1P3-201ENST00000412878 835 ntBASIC4□□□□□ -1.77
ODF1Q14990 AC092809.3-201ENST00000415453 231 ntBASIC4□□□□□ -1.77
ODF1Q14990 ATP5A1P8-201ENST00000423669 1291 ntBASIC4□□□□□ -1.77
ODF1Q14990 AL591438.1-201ENST00000433508 581 ntBASIC4□□□□□ -1.77
ODF1Q14990 AL356535.1-201ENST00000440335 398 ntBASIC4□□□□□ -1.77
ODF1Q14990 PIGFP3-201ENST00000441918 722 ntBASIC4□□□□□ -1.77
ODF1Q14990 RPS24P13-201ENST00000442520 397 ntBASIC4□□□□□ -1.77
ODF1Q14990 AL163193.1-201ENST00000444895 788 ntBASIC4□□□□□ -1.77
ODF1Q14990 CCDC17-203ENST00000445048 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
ODF1Q14990 AC011225.1-201ENST00000457751 369 ntBASIC4□□□□□ -1.77
ODF1Q14990 SCARNA18-201ENST00000459004 134 ntBASIC4□□□□□ -1.77
ODF1Q14990 DNAJC12-205ENST00000483798 769 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
ODF1Q14990 MGC32805-203ENST00000506053 652 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
ODF1Q14990 LINC02220-201ENST00000510065 270 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
ODF1Q14990 AC004054.1-201ENST00000515111 270 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
ODF1Q14990 WASHC5-AS1-201ENST00000519140 587 ntTSL 4 BASIC4□□□□□ -1.77
ODF1Q14990 AC021242.2-203ENST00000521842 687 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
ODF1Q14990 AC134775.1-201ENST00000531268 464 ntTSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
ODF1Q14990 SNHG1-219ENST00000542112 780 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
ODF1Q14990 AC090607.4-201ENST00000558192 369 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
ODF1Q14990 MIR1273C-201ENST00000578669 77 ntBASIC4□□□□□ -1.77
ODF1Q14990 AC243756.1-201ENST00000584068 660 ntAPPRIS P1 BASIC4□□□□□ -1.77
ODF1Q14990 AL035413.2-201ENST00000604801 525 ntBASIC4□□□□□ -1.77
ODF1Q14990 AC079610.3-201ENST00000606960 147 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
ODF1Q14990 Metazoa_SRP.94-201ENST00000612609 250 ntBASIC4□□□□□ -1.77
ODF1Q14990 CCT7-217ENST00000626868 249 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
ODF1Q14990 AC073488.3-201ENST00000631611 778 ntBASIC4□□□□□ -1.77
ODF1Q14990 SLC30A6-203ENST00000379343 2354 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
ODF1Q14990 CASC1-203ENST00000395987 2363 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
ODF1Q14990 RAB18-209ENST00000621805 4894 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
ODF1Q14990 KERA-201ENST00000266719 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
ODF1Q14990 AF117829.1-206ENST00000621883 3802 ntBASIC4□□□□□ -1.77
ODF1Q14990 VPS13D-214ENST00000620676 16320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
ODF1Q14990 ITGB1-201ENST00000302278 3640 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
ODF1Q14990 GABRG2-202ENST00000361925 3767 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
ODF1Q14990 OR6C4-203ENST00000641851 4989 ntAPPRIS P1 BASIC4□□□□□ -1.77
ODF1Q14990 TENM1-201ENST00000371130 12875 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
ODF1Q14990 OR56A3-203ENST00000641160 4438 ntAPPRIS P1 BASIC3.99□□□□□ -1.77
ODF1Q14990 OTOGL-204ENST00000547103 8032 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
ODF1Q14990 AC006148.1-201ENST00000484322 4310 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
ODF1Q14990 AC121333.1-201ENST00000567488 2709 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
ODF1Q14990 AC103993.1-201ENST00000521500 1584 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
ODF1Q14990 AC011266.1-201ENST00000624119 3569 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
ODF1Q14990 BCLAF1-201ENST00000353331 7110 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
ODF1Q14990 AC008079.2-201ENST00000623543 20396 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
ODF1Q14990 CYLD-212ENST00000568704 3292 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
ODF1Q14990 MGC4859-201ENST00000634803 3118 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
ODF1Q14990 Y_RNA.86-201ENST00000363020 111 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
ODF1Q14990 RNU6-512P-201ENST00000364438 103 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
ODF1Q14990 CD52-201ENST00000374213 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
ODF1Q14990 BTLA-202ENST00000383680 726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
ODF1Q14990 RNU6-393P-201ENST00000384475 107 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
ODF1Q14990 RNU6-332P-201ENST00000391193 108 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
ODF1Q14990 RNU6-510P-201ENST00000391239 108 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
ODF1Q14990 RPS4XP9-201ENST00000405151 780 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
ODF1Q14990 AL035079.1-201ENST00000405210 287 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
ODF1Q14990 AC007919.1-201ENST00000429380 217 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
ODF1Q14990 AL049745.1-201ENST00000433953 286 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
ODF1Q14990 SNRPEP4-201ENST00000435815 279 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
ODF1Q14990 AL096678.1-201ENST00000438877 472 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
ODF1Q14990 AF064858.2-201ENST00000440714 292 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
ODF1Q14990 LINC00366-201ENST00000441430 435 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
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