Protein–RNA interactions for Protein: Q14956

GPNMB, Transmembrane glycoprotein NMB, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPNMBQ14956 AC099785.1-201ENST00000605697 437 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
GPNMBQ14956 AC104763.3-201ENST00000613765 618 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
GPNMBQ14956 ZFAT-AS1_1.1-201ENST00000620907 79 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
GPNMBQ14956 AC022509.4-201ENST00000621404 572 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
GPNMBQ14956 AC009269.6-201ENST00000621778 588 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
GPNMBQ14956 DLG2-AS1_1.1-201ENST00000622319 213 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
GPNMBQ14956 SNORA50A-202ENST00000629536 136 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
GPNMBQ14956 AC245427.9-201ENST00000633713 53 ntAPPRIS P1 BASIC3.1□□□□□ -1.91
GPNMBQ14956 AC092813.1-201ENST00000635455 969 ntTSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
GPNMBQ14956 SLC5A3-201ENST00000381151 11576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
GPNMBQ14956 CADM2-AS1-201ENST00000476021 2656 ntTSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
GPNMBQ14956 CCDC168-201ENST00000322527 21466 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
GPNMBQ14956 SYNE2-212ENST00000554584 20508 ntTSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
GPNMBQ14956 MYOT-202ENST00000421631 1474 ntTSL 2 BASIC3.09□□□□□ -1.91
GPNMBQ14956 ARPP19-211ENST00000568196 1489 ntTSL 2 BASIC3.09□□□□□ -1.91
GPNMBQ14956 EIF2A-201ENST00000273435 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
GPNMBQ14956 OR2M2-201ENST00000359682 1044 ntAPPRIS P1 BASIC3.09□□□□□ -1.91
GPNMBQ14956 LINC00587-201ENST00000374801 590 ntTSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
GPNMBQ14956 SKINT1L-201ENST00000401057 817 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
GPNMBQ14956 AL138827.1-201ENST00000402666 306 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
GPNMBQ14956 RPL7P27-201ENST00000403775 720 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
GPNMBQ14956 RPL23AP47-201ENST00000408017 460 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
GPNMBQ14956 AC092638.1-201ENST00000411966 1275 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
GPNMBQ14956 FNDC1-IT1-201ENST00000419703 516 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
GPNMBQ14956 AC006960.1-201ENST00000419980 153 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
GPNMBQ14956 RPL36P19-201ENST00000430744 301 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
GPNMBQ14956 TRBV26OR9-2-201ENST00000432077 293 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
GPNMBQ14956 AL365295.1-201ENST00000454942 514 ntTSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
GPNMBQ14956 AL138787.2-202ENST00000479395 385 ntTSL 2 BASIC3.09□□□□□ -1.91
GPNMBQ14956 SCOC-205ENST00000502535 679 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
GPNMBQ14956 AC119751.1-201ENST00000513357 765 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
GPNMBQ14956 AC084706.1-201ENST00000521879 558 ntTSL 2 BASIC3.09□□□□□ -1.91
GPNMBQ14956 MIR100HG-213ENST00000531470 560 ntTSL 4 BASIC3.09□□□□□ -1.91
GPNMBQ14956 AC004217.3-201ENST00000551552 878 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
GPNMBQ14956 AL356804.1-201ENST00000553791 448 ntTSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
GPNMBQ14956 MIR4474-201ENST00000579189 78 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
GPNMBQ14956 AC008507.2-201ENST00000588402 1176 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
GPNMBQ14956 AC097717.1-211ENST00000600604 687 ntTSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
GPNMBQ14956 AC079089.3-201ENST00000603094 673 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
GPNMBQ14956 AC080078.1-201ENST00000603643 410 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
GPNMBQ14956 STAU2-207ENST00000519961 3928 ntTSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
GPNMBQ14956 POLK-217ENST00000515295 1438 ntTSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.92
GPNMBQ14956 CCPG1-203ENST00000442196 3453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.09□□□□□ -1.92
GPNMBQ14956 AC110774.1-201ENST00000623567 2018 ntBASIC3.09□□□□□ -1.92
GPNMBQ14956 AL365440.2-201ENST00000419738 2597 ntTSL 2 BASIC3.08□□□□□ -1.92
GPNMBQ14956 GYPA-202ENST00000360771 2659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
GPNMBQ14956 GCNT4-201ENST00000322348 5554 ntAPPRIS P1 BASIC3.08□□□□□ -1.92
GPNMBQ14956 XRN1-202ENST00000392981 5383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
GPNMBQ14956 FRS2-201ENST00000397997 6550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
GPNMBQ14956 ZNF679-201ENST00000255746 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
GPNMBQ14956 MIR196B-201ENST00000384852 84 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
GPNMBQ14956 MIR9-1-201ENST00000385198 89 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
GPNMBQ14956 STAT4-203ENST00000409995 709 ntTSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
GPNMBQ14956 AC006150.1-201ENST00000412014 263 ntTSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
GPNMBQ14956 MTCYBP24-201ENST00000420387 1106 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
GPNMBQ14956 GTF2IP23-201ENST00000423746 351 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
GPNMBQ14956 MTCYBP15-201ENST00000433123 1127 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
GPNMBQ14956 CLEC5A-202ENST00000438351 743 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
GPNMBQ14956 ARF4P4-201ENST00000439608 520 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
GPNMBQ14956 Z77249.1-201ENST00000444622 1175 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
GPNMBQ14956 AL136164.1-201ENST00000456795 352 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
GPNMBQ14956 HMGN2P16-201ENST00000456802 261 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
GPNMBQ14956 NF1P3-201ENST00000457709 450 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
GPNMBQ14956 HMGB1P38-201ENST00000490557 577 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
GPNMBQ14956 AC026414.1-201ENST00000504046 698 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
GPNMBQ14956 AC091860.1-201ENST00000505723 432 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
GPNMBQ14956 AC118282.2-201ENST00000508739 374 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
GPNMBQ14956 RNA5SP217-201ENST00000515959 91 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
GPNMBQ14956 TIMM9-203ENST00000555061 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
GPNMBQ14956 CMC2-208ENST00000564249 890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
GPNMBQ14956 AC023825.1-201ENST00000566704 1030 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
GPNMBQ14956 PWRN1-209ENST00000568019 359 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
GPNMBQ14956 AC105094.2-203ENST00000590357 555 ntTSL 4 BASIC3.08□□□□□ -1.92
GPNMBQ14956 AC008764.2-201ENST00000597226 376 ntTSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
GPNMBQ14956 HMGN2P28-201ENST00000606102 262 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
GPNMBQ14956 AC097504.2-201ENST00000608088 454 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
GPNMBQ14956 RNU6-1192P-201ENST00000612197 107 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
GPNMBQ14956 RNU6-489P-201ENST00000618289 107 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
GPNMBQ14956 AC007405.1-203ENST00000623667 932 ntTSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
GPNMBQ14956 LINC00976-201ENST00000625513 783 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
GPNMBQ14956 AC004808.1-201ENST00000627671 721 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
GPNMBQ14956 LINC01002-202ENST00000631412 459 ntTSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
GPNMBQ14956 DTHD1-205ENST00000507598 2606 ntTSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
GPNMBQ14956 AC100800.1-201ENST00000524252 2054 ntTSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
GPNMBQ14956 SKIL-203ENST00000426052 2757 ntTSL 2 BASIC3.08□□□□□ -1.92
GPNMBQ14956 TTN-204ENST00000360870 18218 ntTSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
GPNMBQ14956 POLK-204ENST00000504026 1484 ntTSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
GPNMBQ14956 CENPE-201ENST00000265148 8612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.08□□□□□ -1.92
GPNMBQ14956 CFHR3-201ENST00000367425 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
GPNMBQ14956 NEB-201ENST00000172853 20634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
GPNMBQ14956 FAM214A-201ENST00000261844 4217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
GPNMBQ14956 SLC38A9-203ENST00000416547 2236 ntTSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
GPNMBQ14956 PKHD1L1-201ENST00000378402 13076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
GPNMBQ14956 RNA5SP68-201ENST00000363885 119 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
GPNMBQ14956 RNU6-1243P-201ENST00000364028 107 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
GPNMBQ14956 SNAPC3-201ENST00000380799 753 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
GPNMBQ14956 MIR122-201ENST00000385044 85 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
GPNMBQ14956 RNU6-1000P-201ENST00000391066 106 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
GPNMBQ14956 AL603865.2-201ENST00000401679 213 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
GPNMBQ14956 AL121972.1-201ENST00000402023 252 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.5 ms