Protein–RNA interactions for Protein: Q14258

TRIM25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 630 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM25Q14258 TMEM71-201ENST00000356838 1993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
TRIM25Q14258 TMEM71-210ENST00000523829 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
TRIM25Q14258 NFIB-203ENST00000380934 2142 ntTSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
TRIM25Q14258 MTRR-202ENST00000440940 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
TRIM25Q14258 CFL2-202ENST00000341223 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
TRIM25Q14258 XPO4-201ENST00000255305 9921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
TRIM25Q14258 NT5C3A-202ENST00000381626 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
TRIM25Q14258 EMCN-201ENST00000296420 4037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
TRIM25Q14258 AC073343.1-201ENST00000328239 651 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
TRIM25Q14258 U3.2-201ENST00000362981 210 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
TRIM25Q14258 RNU6-263P-201ENST00000363811 107 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
TRIM25Q14258 RNU6-996P-201ENST00000365438 107 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
TRIM25Q14258 CRP-202ENST00000368110 667 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
TRIM25Q14258 TSHB-202ENST00000369517 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
TRIM25Q14258 RNU4-65P-201ENST00000410473 140 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
TRIM25Q14258 AL020994.2-201ENST00000413244 571 ntTSL 4 BASIC4.45□□□□□ -1.7
TRIM25Q14258 MTCO3P12-201ENST00000416718 547 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
TRIM25Q14258 AL139819.1-201ENST00000429420 471 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
TRIM25Q14258 AL627308.1-201ENST00000435693 821 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
TRIM25Q14258 RPL36AP6-201ENST00000435770 321 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
TRIM25Q14258 AC005094.1-201ENST00000440420 368 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
TRIM25Q14258 AL121871.1-201ENST00000443413 436 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
TRIM25Q14258 AC011753.3-201ENST00000443436 406 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
TRIM25Q14258 UBE2V1P7-201ENST00000446395 340 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
TRIM25Q14258 AC006480.1-201ENST00000449887 378 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
TRIM25Q14258 SNORD97-201ENST00000459187 142 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
TRIM25Q14258 RPS27AP17-201ENST00000463344 455 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
TRIM25Q14258 AC006967.1-201ENST00000467608 589 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
TRIM25Q14258 GMFBP1-201ENST00000467831 427 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
TRIM25Q14258 AC007537.2-201ENST00000472093 511 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
TRIM25Q14258 RN7SL222P-201ENST00000476452 299 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
TRIM25Q14258 AC068633.1-201ENST00000482142 787 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
TRIM25Q14258 AL163973.1-201ENST00000484753 577 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
TRIM25Q14258 RPS3AP50-201ENST00000487064 803 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
TRIM25Q14258 AC108693.1-201ENST00000496068 432 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
TRIM25Q14258 HMGN1P12-201ENST00000499125 195 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
TRIM25Q14258 AC083829.1-201ENST00000503756 657 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
TRIM25Q14258 AC025741.1-201ENST00000506100 544 ntTSL 4 BASIC4.45□□□□□ -1.7
TRIM25Q14258 RNA5SP401-201ENST00000515920 127 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
TRIM25Q14258 AC008694.2-201ENST00000517591 306 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
TRIM25Q14258 AC008663.1-201ENST00000519821 455 ntTSL 4 BASIC4.45□□□□□ -1.7
TRIM25Q14258 IGLV3-26-201ENST00000520756 302 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
TRIM25Q14258 AC091564.3-201ENST00000527398 429 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
TRIM25Q14258 DEFB108D-201ENST00000527787 222 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
TRIM25Q14258 AP002833.1-201ENST00000530572 566 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
TRIM25Q14258 AC022081.1-201ENST00000537327 433 ntTSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
TRIM25Q14258 AC138360.1-201ENST00000552332 386 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
TRIM25Q14258 AL110505.1-201ENST00000557062 522 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
TRIM25Q14258 AC026771.1-201ENST00000564672 415 ntTSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
TRIM25Q14258 LINC01290-201ENST00000566787 502 ntTSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
TRIM25Q14258 RN7SL753P-201ENST00000581238 290 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
TRIM25Q14258 AC007952.9-201ENST00000584365 191 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
TRIM25Q14258 AC010591.1-201ENST00000603941 649 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
TRIM25Q14258 AC015813.4-201ENST00000610469 179 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
TRIM25Q14258 LDHA-225ENST00000625635 141 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
TRIM25Q14258 AKT3-201ENST00000263826 7081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
TRIM25Q14258 TMEM255A-202ENST00000371352 2879 ntTSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
TRIM25Q14258 MTRNR2L6-201ENST00000604952 1447 ntAPPRIS P1 BASIC4.45□□□□□ -1.7
TRIM25Q14258 ADGRL2-205ENST00000370717 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
TRIM25Q14258 TLR3-201ENST00000296795 6015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
TRIM25Q14258 PRLR-220ENST00000620785 11063 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
TRIM25Q14258 KRTAP24-1-201ENST00000340345 1650 ntAPPRIS P1 BASIC4.45□□□□□ -1.7
TRIM25Q14258 LINC01102-204ENST00000451400 3778 ntTSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
TRIM25Q14258 C2orf73-202ENST00000398634 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
TRIM25Q14258 ANK3-202ENST00000355288 3811 ntTSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
TRIM25Q14258 SOCS5-201ENST00000306503 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
TRIM25Q14258 OTOGL-204ENST00000547103 8032 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
TRIM25Q14258 STON1-GTF2A1L-203ENST00000402114 3790 ntTSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
TRIM25Q14258 DDX60L-209ENST00000511577 6781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
TRIM25Q14258 TPRG1-201ENST00000345063 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
TRIM25Q14258 MTND5P17-201ENST00000418405 1603 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
TRIM25Q14258 AC090229.1-201ENST00000590983 1609 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
TRIM25Q14258 POSTN-201ENST00000379742 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
TRIM25Q14258 ZEB1-202ENST00000361642 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
TRIM25Q14258 ETV1-205ENST00000405192 4402 ntTSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
TRIM25Q14258 Y_RNA.22-201ENST00000362492 102 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
TRIM25Q14258 Y_RNA.86-201ENST00000363020 111 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
TRIM25Q14258 SNORA70-201ENST00000384436 135 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
TRIM25Q14258 Z97832.1-201ENST00000402490 328 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
TRIM25Q14258 AL136372.1-201ENST00000403060 228 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
TRIM25Q14258 AL121834.1-202ENST00000404494 277 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
TRIM25Q14258 DUTP5-201ENST00000406790 469 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
TRIM25Q14258 RNU2-39P-201ENST00000410604 198 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
TRIM25Q14258 RNU4-78P-201ENST00000410940 126 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
TRIM25Q14258 RSU1P3-201ENST00000412878 835 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
TRIM25Q14258 AC093159.1-201ENST00000416845 424 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
TRIM25Q14258 AL158835.2-201ENST00000430970 300 ntTSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
TRIM25Q14258 AC076966.1-201ENST00000435560 351 ntTSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
TRIM25Q14258 KCND3-IT1-201ENST00000439736 376 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
TRIM25Q14258 ELOCP23-201ENST00000452014 332 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
TRIM25Q14258 AL359095.1-201ENST00000457383 635 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
TRIM25Q14258 AC005062.1-201ENST00000457921 566 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
TRIM25Q14258 RPL23AP56-201ENST00000460778 453 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
TRIM25Q14258 RPS27AP1-201ENST00000475545 471 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
TRIM25Q14258 AC010273.2-201ENST00000479830 438 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
TRIM25Q14258 MORC1-AS1-201ENST00000480826 564 ntTSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
TRIM25Q14258 RN7SL184P-201ENST00000488308 297 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
TRIM25Q14258 RPL39P36-201ENST00000490784 156 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
TRIM25Q14258 AC093278.1-201ENST00000494700 600 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
TRIM25Q14258 RPL38P4-201ENST00000502376 214 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.1 ms