Protein–RNA interactions for Protein: Q14139

UBE4A, Ubiquitin conjugation factor E4 A, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE4AQ14139 SCOC-203ENST00000394203 1999 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
UBE4AQ14139 PLAG1-201ENST00000316981 7322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
UBE4AQ14139 CLUL1-208ENST00000581619 2449 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
UBE4AQ14139 FZD3-201ENST00000240093 13736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
UBE4AQ14139 OR5B3-201ENST00000309403 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.6□□□□□ -1.67
UBE4AQ14139 RNA5SP52-201ENST00000362448 134 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
UBE4AQ14139 SNORA63.1-201ENST00000362493 131 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
UBE4AQ14139 RNU6-433P-201ENST00000363216 104 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
UBE4AQ14139 ATP5A1P2-201ENST00000412323 255 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
UBE4AQ14139 LINC01048-201ENST00000414480 511 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
UBE4AQ14139 AC079780.1-201ENST00000428259 207 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
UBE4AQ14139 AC007003.1-202ENST00000439318 349 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
UBE4AQ14139 AP000542.1-201ENST00000448473 371 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
UBE4AQ14139 AC010655.1-201ENST00000449336 292 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
UBE4AQ14139 AC091770.1-201ENST00000456513 373 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
UBE4AQ14139 RPL30P9-201ENST00000465586 330 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
UBE4AQ14139 HMGB1P36-201ENST00000487709 576 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
UBE4AQ14139 AC093864.1-201ENST00000504555 745 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
UBE4AQ14139 RPF2P2-201ENST00000504693 896 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
UBE4AQ14139 NREP-AS1-202ENST00000507222 610 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
UBE4AQ14139 AC104619.4-201ENST00000510773 249 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
UBE4AQ14139 VWA8P1-201ENST00000510889 176 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
UBE4AQ14139 AC098868.1-201ENST00000512628 624 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
UBE4AQ14139 AC022483.1-201ENST00000514020 567 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
UBE4AQ14139 RN7SKP18-201ENST00000516005 275 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
UBE4AQ14139 IGKV2D-23-201ENST00000518179 286 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
UBE4AQ14139 NDST1-AS1-201ENST00000519040 368 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
UBE4AQ14139 AC087439.2-201ENST00000519498 552 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
UBE4AQ14139 HMGN1P28-201ENST00000521340 364 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
UBE4AQ14139 LINC02131-201ENST00000563289 419 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
UBE4AQ14139 AP001004.1-201ENST00000582468 324 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
UBE4AQ14139 AC008277.1-203ENST00000594921 1149 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
UBE4AQ14139 AL137849.1-201ENST00000604767 169 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
UBE4AQ14139 AC012443.1-201ENST00000605605 231 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
UBE4AQ14139 AC106028.5-201ENST00000610332 395 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
UBE4AQ14139 OR5B3-202ENST00000641865 1046 ntAPPRIS P1 BASIC4.6□□□□□ -1.67
UBE4AQ14139 AC072062.1-210ENST00000628464 1315 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
UBE4AQ14139 CLIC2-202ENST00000369449 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
UBE4AQ14139 MS4A14-201ENST00000300187 2997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
UBE4AQ14139 RHOT1-204ENST00000394692 2960 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
UBE4AQ14139 FBXO8-205ENST00000615392 1591 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
UBE4AQ14139 ELAVL4-203ENST00000371821 3349 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
UBE4AQ14139 AC096751.1-201ENST00000515178 2202 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
UBE4AQ14139 TRIM36-201ENST00000282369 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
UBE4AQ14139 PREPL-207ENST00000409957 4703 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
UBE4AQ14139 DAOA-201ENST00000329625 1433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
UBE4AQ14139 KLRF1-202ENST00000354855 838 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
UBE4AQ14139 COX7B2-201ENST00000355591 542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
UBE4AQ14139 OR2M2-201ENST00000359682 1044 ntAPPRIS P1 BASIC4.59□□□□□ -1.67
UBE4AQ14139 RNU6-1078P-201ENST00000364522 103 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
UBE4AQ14139 RAD17-208ENST00000380774 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
UBE4AQ14139 DEFB109C-201ENST00000382575 264 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
UBE4AQ14139 DEFB109B-201ENST00000382656 264 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
UBE4AQ14139 MIR135A2-201ENST00000384854 100 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
UBE4AQ14139 U3.20-201ENST00000390909 217 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
UBE4AQ14139 ZC3H14-206ENST00000406216 1341 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
UBE4AQ14139 SNORA11.1-201ENST00000408133 129 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
UBE4AQ14139 PTPN22-202ENST00000420377 2726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
UBE4AQ14139 CYP4F29P-201ENST00000420685 446 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
UBE4AQ14139 AL365203.2-201ENST00000423444 196 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
UBE4AQ14139 CCDC30-203ENST00000428554 3063 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
UBE4AQ14139 MTATP6P17-201ENST00000431030 672 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
UBE4AQ14139 HMGN2P31-201ENST00000432430 273 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
UBE4AQ14139 AC096638.2-201ENST00000434965 711 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
UBE4AQ14139 HSPD1P21-201ENST00000436541 245 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
UBE4AQ14139 KRR1-202ENST00000438169 975 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
UBE4AQ14139 RAC1P7-201ENST00000445367 377 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
UBE4AQ14139 AL133217.1-201ENST00000450980 425 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
UBE4AQ14139 FGF14-AS1-202ENST00000451630 321 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
UBE4AQ14139 OR6C5P-201ENST00000452388 923 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
UBE4AQ14139 TAB3P1-202ENST00000452645 1634 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
UBE4AQ14139 ETV5-AS1-201ENST00000453370 560 ntTSL 4 BASIC4.59□□□□□ -1.67
UBE4AQ14139 ART2BP-201ENST00000453501 499 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
UBE4AQ14139 BZW1P2-201ENST00000473537 826 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
UBE4AQ14139 C1GALT1C1L-201ENST00000475092 1172 ntAPPRIS P1 BASIC4.59□□□□□ -1.67
UBE4AQ14139 DNAJC12-205ENST00000483798 769 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
UBE4AQ14139 AC093534.2-201ENST00000511418 420 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
UBE4AQ14139 AC026726.1-201ENST00000512859 601 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
UBE4AQ14139 AC093879.2-201ENST00000513645 427 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
UBE4AQ14139 AC026801.2-201ENST00000515352 425 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
UBE4AQ14139 SNORA31.8-201ENST00000516327 108 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
UBE4AQ14139 RNU6-232P-201ENST00000517144 64 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
UBE4AQ14139 DUXAP2-201ENST00000519198 589 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
UBE4AQ14139 AC013828.2-201ENST00000532487 235 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
UBE4AQ14139 AC027018.1-201ENST00000533978 396 ntTSL 4 BASIC4.59□□□□□ -1.67
UBE4AQ14139 AC007493.1-202ENST00000567899 517 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
UBE4AQ14139 FOPNL-204ENST00000573396 735 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
UBE4AQ14139 ZNF573-209ENST00000585724 453 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
UBE4AQ14139 AC022601.1-201ENST00000596954 577 ntTSL 4 BASIC4.59□□□□□ -1.67
UBE4AQ14139 AC012531.5-201ENST00000611375 151 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
UBE4AQ14139 AC019176.2-201ENST00000611579 315 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
UBE4AQ14139 AL391261.4-201ENST00000616012 481 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
UBE4AQ14139 AC095031.1-201ENST00000623685 672 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
UBE4AQ14139 AC079248.2-201ENST00000623779 326 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
UBE4AQ14139 AL391597.2-201ENST00000635698 479 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
UBE4AQ14139 OR6C71P-202ENST00000641886 1107 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
UBE4AQ14139 POU2F1-204ENST00000367866 13905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
UBE4AQ14139 FNDC3A-202ENST00000398316 5714 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
UBE4AQ14139 RNF128-202ENST00000324342 2654 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
UBE4AQ14139 RAPH1-203ENST00000374493 3909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.2 ms