Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 uc_338.32-201ENST00000615087 172 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
TUBA3CQ13748 MSANTD4-206ENST00000617528 508 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
TUBA3CQ13748 AC090617.10-201ENST00000624308 134 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
TUBA3CQ13748 AC138305.3-201ENST00000624988 240 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
TUBA3CQ13748 AC134503.1-201ENST00000633048 54 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
TUBA3CQ13748 PHKBP1-201ENST00000450951 1951 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
TUBA3CQ13748 PRLR-217ENST00000618457 11688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
TUBA3CQ13748 AL672167.1-203ENST00000641299 2975 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
TUBA3CQ13748 ZNF736P3Y-201ENST00000428264 1465 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
TUBA3CQ13748 SLC13A1-201ENST00000194130 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
TUBA3CQ13748 AC009643.2-201ENST00000603543 1448 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
TUBA3CQ13748 OTOGL-204ENST00000547103 8032 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
TUBA3CQ13748 UBE2D3-233ENST00000618836 3472 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
TUBA3CQ13748 RNU5E-1-201ENST00000362477 120 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
TUBA3CQ13748 RNU6-398P-201ENST00000384143 109 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
TUBA3CQ13748 RNU6-456P-201ENST00000384493 107 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
TUBA3CQ13748 RNU6-1160P-201ENST00000384546 104 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
TUBA3CQ13748 RPL23AP32-201ENST00000395315 459 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
TUBA3CQ13748 RPS4XP9-201ENST00000405151 780 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
TUBA3CQ13748 Z85994.1-201ENST00000406912 606 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
TUBA3CQ13748 RNU6-373P-201ENST00000411247 98 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
TUBA3CQ13748 FAR2P2-201ENST00000413041 594 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
TUBA3CQ13748 FAR2P4-202ENST00000425399 584 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
TUBA3CQ13748 AC024619.1-202ENST00000426489 495 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
TUBA3CQ13748 AC023590.1-205ENST00000430457 676 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
TUBA3CQ13748 NRBF2P3-201ENST00000432731 865 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
TUBA3CQ13748 LIX1L-AS1-204ENST00000437207 222 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
TUBA3CQ13748 RPL7P28-201ENST00000437739 740 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
TUBA3CQ13748 AC010157.1-201ENST00000440589 527 ntTSL 4 BASIC4.49□□□□□ -1.69
TUBA3CQ13748 TPT1P13-201ENST00000449760 499 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
TUBA3CQ13748 SIDT1-AS1-201ENST00000462180 465 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
TUBA3CQ13748 RPL23AP12-201ENST00000467573 473 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
TUBA3CQ13748 RPL23AP71-201ENST00000470966 469 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
TUBA3CQ13748 AC121764.1-201ENST00000472238 563 ntTSL 4 BASIC4.49□□□□□ -1.69
TUBA3CQ13748 AC108022.1-201ENST00000493466 478 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
TUBA3CQ13748 AC106872.2-201ENST00000494303 480 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
TUBA3CQ13748 RN7SKP276-201ENST00000516242 268 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
TUBA3CQ13748 SNORA40.12-201ENST00000516329 111 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
TUBA3CQ13748 Y_RNA.719-201ENST00000517156 106 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
TUBA3CQ13748 AC022616.6-201ENST00000520479 119 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
TUBA3CQ13748 PSMA2P1-201ENST00000526365 646 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
TUBA3CQ13748 ARL1-211ENST00000551828 776 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
TUBA3CQ13748 AL355836.1-201ENST00000555951 870 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
TUBA3CQ13748 AC004943.1-202ENST00000558618 503 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
TUBA3CQ13748 hsa-mir-3119-1.1-201ENST00000577602 85 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
TUBA3CQ13748 MIR3167-201ENST00000579623 85 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
TUBA3CQ13748 AC010525.2-201ENST00000590920 195 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
TUBA3CQ13748 AC104687.2-201ENST00000604442 342 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
TUBA3CQ13748 AC008966.2-201ENST00000606157 453 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
TUBA3CQ13748 AC008035.1-201ENST00000607353 448 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
TUBA3CQ13748 AC068831.8-201ENST00000620171 435 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
TUBA3CQ13748 AC021106.3-201ENST00000623925 531 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
TUBA3CQ13748 LINC01232-201ENST00000625254 836 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
TUBA3CQ13748 LINC01002-236ENST00000634022 378 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
TUBA3CQ13748 CENPE-208ENST00000611174 8260 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
TUBA3CQ13748 SGO1-AS1-203ENST00000455626 2041 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
TUBA3CQ13748 MTTP-201ENST00000265517 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
TUBA3CQ13748 MBNL3-201ENST00000370839 1575 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
TUBA3CQ13748 SGO1-205ENST00000419233 1582 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
TUBA3CQ13748 MGAT4C-202ENST00000548651 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
TUBA3CQ13748 ZNF732-202ENST00000619749 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
TUBA3CQ13748 PRLR-220ENST00000620785 11063 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
TUBA3CQ13748 PLCH1-201ENST00000334686 6128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
TUBA3CQ13748 AC008725.1-201ENST00000605123 2263 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
TUBA3CQ13748 AC046195.1-201ENST00000518973 4171 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
TUBA3CQ13748 MFSD8-216ENST00000641147 4009 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
TUBA3CQ13748 TAF7L-201ENST00000324762 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
TUBA3CQ13748 IFI16-208ENST00000448393 2245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
TUBA3CQ13748 KATNAL1-201ENST00000380615 7551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
TUBA3CQ13748 AC024940.1-203ENST00000398963 4423 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
TUBA3CQ13748 OR1E2-201ENST00000248384 972 ntAPPRIS P1 BASIC4.48□□□□□ -1.69
TUBA3CQ13748 AC079741.1-201ENST00000321498 212 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
TUBA3CQ13748 RPL7P26-201ENST00000333817 754 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
TUBA3CQ13748 OR8D1-201ENST00000357821 1026 ntAPPRIS P1 BASIC4.48□□□□□ -1.69
TUBA3CQ13748 RNU6-223P-201ENST00000362830 107 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
TUBA3CQ13748 TMLHE-202ENST00000369439 1248 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
TUBA3CQ13748 SNORA32.2-201ENST00000384049 122 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
TUBA3CQ13748 RNU6-474P-201ENST00000384243 107 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
TUBA3CQ13748 TRAJ21-201ENST00000390516 55 ntAPPRIS P1 BASIC4.48□□□□□ -1.69
TUBA3CQ13748 RNU6-952P-201ENST00000391164 108 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
TUBA3CQ13748 MIR298-201ENST00000401212 88 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
TUBA3CQ13748 AL357515.1-201ENST00000402967 542 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
TUBA3CQ13748 AL590290.1-201ENST00000405336 380 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
TUBA3CQ13748 TXNP7-201ENST00000406296 293 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
TUBA3CQ13748 RNA5SP104-201ENST00000410989 118 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
TUBA3CQ13748 AC009505.1-201ENST00000413151 424 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
TUBA3CQ13748 AC114755.2-201ENST00000413520 361 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
TUBA3CQ13748 SNRPFP1-201ENST00000414761 252 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
TUBA3CQ13748 AC107081.2-201ENST00000425779 802 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
TUBA3CQ13748 AL589935.1-209ENST00000432050 418 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
TUBA3CQ13748 RPL36AP15-201ENST00000444514 266 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
TUBA3CQ13748 AC000111.2-201ENST00000448200 210 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
TUBA3CQ13748 AC123023.1-201ENST00000455974 555 ntTSL 4 BASIC4.48□□□□□ -1.69
TUBA3CQ13748 RNU6-261P-201ENST00000459506 102 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
TUBA3CQ13748 RPL21P71-201ENST00000465598 459 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
TUBA3CQ13748 AL162742.2-201ENST00000472915 244 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
TUBA3CQ13748 AC098851.1-201ENST00000476561 570 ntTSL 4 BASIC4.48□□□□□ -1.69
TUBA3CQ13748 AP000926.1-201ENST00000479573 241 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
TUBA3CQ13748 AC123768.1-201ENST00000486285 432 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
TUBA3CQ13748 AC025445.1-201ENST00000502728 300 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 128.3 ms