Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 AL391646.1-201ENST00000603860 190 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
TUBB3Q13509 AC011468.4-201ENST00000603942 409 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
TUBB3Q13509 AC010680.4-201ENST00000605334 543 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
TUBB3Q13509 AC113194.1-201ENST00000606037 500 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
TUBB3Q13509 AL391813.2-201ENST00000609113 322 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
TUBB3Q13509 AL161734.1-201ENST00000609720 557 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
TUBB3Q13509 AC099669.2-201ENST00000616549 437 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
TUBB3Q13509 AC002553.4-201ENST00000616896 331 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
TUBB3Q13509 MIR6891-201ENST00000618788 93 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
TUBB3Q13509 ZNF345-216ENST00000640438 963 ntTSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
TUBB3Q13509 POLR2B-201ENST00000314595 3748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
TUBB3Q13509 AL592182.3-201ENST00000642132 3304 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
TUBB3Q13509 PTP4A1-205ENST00000626021 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
TUBB3Q13509 POLK-201ENST00000241436 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
TUBB3Q13509 TBC1D31-210ENST00000521676 3256 ntTSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
TUBB3Q13509 CYP19A1-201ENST00000396402 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
TUBB3Q13509 CACNB4-233ENST00000636773 4143 ntTSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
TUBB3Q13509 XKR3-201ENST00000331428 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
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TUBB3Q13509 AC087190.4-201ENST00000574616 8334 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
TUBB3Q13509 LINC01239-202ENST00000436786 2347 ntTSL 2 BASIC4.32□□□□□ -1.72
TUBB3Q13509 RPS4Y1-201ENST00000250784 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
TUBB3Q13509 KCNE2-201ENST00000290310 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
TUBB3Q13509 RNU6-878P-201ENST00000384578 110 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
TUBB3Q13509 TRAV21-201ENST00000390449 343 ntAPPRIS P1 BASIC4.32□□□□□ -1.72
TUBB3Q13509 RPL23AP32-201ENST00000395315 459 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
TUBB3Q13509 HSPD1P16-201ENST00000402302 394 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
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TUBB3Q13509 AL359704.1-201ENST00000411586 781 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
TUBB3Q13509 LINC00301-202ENST00000412599 772 ntTSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
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TUBB3Q13509 UTS2B-203ENST00000427544 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
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TUBB3Q13509 LINC01317-202ENST00000442026 677 ntTSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
TUBB3Q13509 DPPA3P1-201ENST00000448050 469 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
TUBB3Q13509 AC073486.1-201ENST00000453278 531 ntTSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
TUBB3Q13509 MTND1P12-201ENST00000455231 147 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
TUBB3Q13509 AC123023.1-201ENST00000455974 555 ntTSL 4 BASIC4.31□□□□□ -1.72
TUBB3Q13509 AP1S2P1-201ENST00000457344 379 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
TUBB3Q13509 AP001992.1-205ENST00000462248 379 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
TUBB3Q13509 IGKV2-30-201ENST00000468494 390 ntAPPRIS P1 BASIC4.31□□□□□ -1.72
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