Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 Y_RNA.463-201ENST00000384271 102 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 RNU6-601P-201ENST00000384540 107 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 MIR105-2-201ENST00000385083 81 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 MTERF4-204ENST00000406593 802 ntTSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 CCDC126-203ENST00000410069 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 OFD1P1Y-201ENST00000411756 1225 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 AC083867.1-201ENST00000413567 457 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 AC068533.1-201ENST00000418542 415 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 LINC02542-201ENST00000418567 822 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 AC048351.1-201ENST00000420064 602 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 MED13P1-201ENST00000428342 171 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 PPIAP13-201ENST00000434706 478 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 FTH1P1-201ENST00000437933 532 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 MTND1P17-201ENST00000448961 204 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 AC013460.1-205ENST00000450695 518 ntTSL 4 BASIC4.15□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 CBX1P2-201ENST00000453841 458 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 AC005229.2-201ENST00000456995 399 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 RPL35AP28-201ENST00000459730 331 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 AC128713.1-201ENST00000471495 306 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 AC058823.1-201ENST00000485315 474 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 AC104564.1-201ENST00000493028 407 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 RPS4XP20-201ENST00000505751 772 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 AC110794.1-201ENST00000505816 425 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 AC091976.1-202ENST00000509211 630 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 RN7SKP96-201ENST00000516948 297 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 AC087854.1-201ENST00000519706 414 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 LSM6P2-201ENST00000552208 177 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 AC068446.3-201ENST00000555285 382 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 SLC14A2-AS1-201ENST00000585759 494 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 AC104695.3-201ENST00000604052 296 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 AC013244.1-201ENST00000604279 193 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 PRR13P7-201ENST00000605538 430 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 AC133104.2-201ENST00000615272 193 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 AL049794.2-201ENST00000616301 365 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 AC000123.2-201ENST00000623124 461 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 CYP4F35P-202ENST00000636121 390 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 AL669831.3-213ENST00000636676 183 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 AC008013.2-202ENST00000637965 364 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 AL732372.2-225ENST00000642124 456 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 ZNF284-201ENST00000421176 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 KCTD16-201ENST00000507359 13950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 AC107081.3-201ENST00000612715 2034 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 SCN2A-201ENST00000283256 8660 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 CHRM2-203ENST00000445907 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 VWC2L-202ENST00000427124 4480 ntTSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 SMNDC1-202ENST00000369603 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 RCOR3-201ENST00000367005 4246 ntTSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 CTAGE5-207ENST00000396165 3071 ntTSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 TMEM59-205ENST00000371348 1911 ntTSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 LINC01416-201ENST00000563553 2310 ntTSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 GOLPH3L-201ENST00000271732 2999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 LRIT3-201ENST00000327908 3781 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 MGAT4A-203ENST00000409391 2018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 PICALM-209ENST00000528398 2049 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 AC011460.1-201ENST00000636268 1834 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 ARHGAP18-201ENST00000368149 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 TJP1-202ENST00000356107 6747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 SLC1A3-202ENST00000381918 3652 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 PRG4-206ENST00000635041 4915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 SCARNA15-201ENST00000607520 4325 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 DOCK9-207ENST00000442173 7643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 SON-204ENST00000381692 2463 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 C4BPAP1-201ENST00000415474 1893 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 AL442639.1-201ENST00000625030 1899 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 NRK-204ENST00000540278 1687 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 AC134882.1-201ENST00000603738 1676 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 ANKRD30A-201ENST00000361713 4405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 SNORA17.1-201ENST00000362945 126 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 Y_RNA.234-201ENST00000364409 97 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 Y_RNA.252-201ENST00000364556 101 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 Y_RNA.307-201ENST00000365022 117 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 RNU6-146P-201ENST00000384602 108 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 SOD2P1-201ENST00000396543 562 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 DSTNP4-201ENST00000399472 474 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 RNU4-6P-201ENST00000410804 122 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 RNU6-603P-201ENST00000411403 107 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 AL591848.1-201ENST00000413092 322 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 AC080125.1-201ENST00000414888 684 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 MOBP-203ENST00000415443 577 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC4.14□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 RPL7P10-201ENST00000417407 739 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 AL139396.1-201ENST00000421137 167 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 BX005214.1-201ENST00000427327 476 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 AC007566.1-201ENST00000427458 643 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 AL080248.1-201ENST00000428954 388 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 AL355340.1-201ENST00000433085 344 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 AL359265.2-201ENST00000434367 631 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 AL451139.1-201ENST00000434718 346 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 LINC00969-211ENST00000438608 525 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 AC093083.1-201ENST00000438633 347 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 C2CD6-202ENST00000439140 5512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 AL078587.1-201ENST00000448580 542 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 NRG3-AS1-201ENST00000448936 555 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 AL389915.2-201ENST00000454576 441 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 SNRPFP3-201ENST00000457792 225 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 RPL5P30-201ENST00000465511 891 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 RPS20P21-201ENST00000466859 343 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 RN7SL222P-201ENST00000476452 299 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 RN7SL727P-201ENST00000482164 296 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 AC015911.1-201ENST00000495111 156 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 AC097473.1-201ENST00000508142 408 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
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