Protein–RNA interactions for Protein: Q13247

SRSF6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF6Q13247 U8.2-201ENST00000363156 134 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SRSF6Q13247 MIR142-201ENST00000384835 87 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SRSF6Q13247 MIR504-201ENST00000385065 83 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SRSF6Q13247 RNU6ATAC40P-201ENST00000408580 137 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SRSF6Q13247 ARHGAP15-202ENST00000409869 2968 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
SRSF6Q13247 RN7SKP58-201ENST00000411010 305 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SRSF6Q13247 RBM6-203ENST00000421682 684 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
SRSF6Q13247 AC233981.1-201ENST00000423224 461 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SRSF6Q13247 AC097499.1-201ENST00000444277 208 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SRSF6Q13247 RPL23AP20-201ENST00000447965 421 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SRSF6Q13247 AC020719.1-201ENST00000448977 518 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
SRSF6Q13247 RPL21P41-201ENST00000459863 264 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SRSF6Q13247 RPL21P18-201ENST00000469899 480 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SRSF6Q13247 AC147055.1-201ENST00000509261 750 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SRSF6Q13247 AC087373.1-201ENST00000524920 491 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SRSF6Q13247 UBTFL10-201ENST00000528532 562 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SRSF6Q13247 AC091814.1-201ENST00000545258 719 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
SRSF6Q13247 AC108721.1-201ENST00000547088 348 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
SRSF6Q13247 MRPL42-208ENST00000552217 920 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
SRSF6Q13247 MAFTRR-204ENST00000568389 506 ntTSL 4 BASIC2.55□□□□□ -2
SRSF6Q13247 AC020895.1-201ENST00000595362 272 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SRSF6Q13247 AC128687.1-201ENST00000605304 619 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SRSF6Q13247 AL627309.6-201ENST00000606857 840 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SRSF6Q13247 AL355810.1-201ENST00000614629 552 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SRSF6Q13247 AL360181.4-201ENST00000621752 134 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SRSF6Q13247 AC008505.1-204ENST00000637363 2714 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
SRSF6Q13247 MIR133A1HG-202ENST00000581072 4226 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
SRSF6Q13247 AC011460.1-201ENST00000636268 1834 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SRSF6Q13247 WDR3-201ENST00000349139 9974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
SRSF6Q13247 JCHAIN-206ENST00000543780 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
SRSF6Q13247 RNA5SP139-201ENST00000364340 117 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SRSF6Q13247 ATP6V1G3-203ENST00000367382 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
SRSF6Q13247 SSXP10-201ENST00000402595 565 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SRSF6Q13247 FAT1P1-201ENST00000406588 507 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SRSF6Q13247 AL117337.1-201ENST00000412789 444 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
SRSF6Q13247 OR2AS1P-201ENST00000427827 319 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SRSF6Q13247 snoU13.26-201ENST00000459452 105 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SRSF6Q13247 RC3H2-207ENST00000471874 749 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
SRSF6Q13247 SRIP1-201ENST00000489235 288 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SRSF6Q13247 AC025465.2-201ENST00000502809 608 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
SRSF6Q13247 SEM1P1-201ENST00000506694 209 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SRSF6Q13247 AC008885.2-201ENST00000509506 930 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SRSF6Q13247 AC108157.1-201ENST00000510511 539 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SRSF6Q13247 AC109329.2-201ENST00000519658 482 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SRSF6Q13247 AC104211.1-202ENST00000521307 866 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
SRSF6Q13247 C1DP5-201ENST00000525775 383 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SRSF6Q13247 TAS2R43-201ENST00000531678 1027 ntAPPRIS P1 BASIC2.54□□□□□ -2
SRSF6Q13247 AP000462.3-201ENST00000545593 330 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
SRSF6Q13247 LINC00640-203ENST00000556479 576 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
SRSF6Q13247 LIVAR-201ENST00000578633 384 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
SRSF6Q13247 DPRXP5-201ENST00000604662 539 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SRSF6Q13247 HSPE1P14-201ENST00000605812 302 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SRSF6Q13247 TFG-209ENST00000615993 1244 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
SRSF6Q13247 AL359094.1-201ENST00000627944 566 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
SRSF6Q13247 SOX2-OT-255ENST00000630150 649 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
SRSF6Q13247 DDX6-206ENST00000534980 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
SRSF6Q13247 THOC2-201ENST00000245838 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
SRSF6Q13247 AC004972.1-201ENST00000623934 2209 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SRSF6Q13247 ZNF626-204ENST00000612591 4404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
SRSF6Q13247 GABRG2-229ENST00000641017 3628 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SRSF6Q13247 MTND5P19-201ENST00000424872 1794 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SRSF6Q13247 SENP7-205ENST00000394091 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
SRSF6Q13247 TPTE2-202ENST00000382978 1677 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
SRSF6Q13247 MUC7-203ENST00000456088 2479 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC2.53□□□□□ -2
SRSF6Q13247 AC090740.1-201ENST00000623193 2262 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SRSF6Q13247 CHD9-218ENST00000566029 13110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
SRSF6Q13247 RNF219-AS1-214ENST00000607862 6001 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
SRSF6Q13247 ATP6V1G3-202ENST00000309309 678 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
SRSF6Q13247 TFPI-202ENST00000339091 1088 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
SRSF6Q13247 CRLS1-202ENST00000378868 994 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
SRSF6Q13247 RPL21P3-201ENST00000395517 478 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SRSF6Q13247 RPS4XP3-201ENST00000398541 413 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SRSF6Q13247 RPS4XP7-201ENST00000406274 780 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SRSF6Q13247 BX682237.1-201ENST00000415016 335 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SRSF6Q13247 BX276092.3-201ENST00000424182 230 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SRSF6Q13247 AC006548.1-201ENST00000427470 102 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SRSF6Q13247 UBE2D3P1-201ENST00000436669 444 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SRSF6Q13247 AL590664.1-201ENST00000448065 339 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SRSF6Q13247 AC090525.1-201ENST00000479116 478 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SRSF6Q13247 RN7SL499P-201ENST00000481141 276 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SRSF6Q13247 BLNK-209ENST00000495266 440 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
SRSF6Q13247 OR5H5P-201ENST00000503164 928 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SRSF6Q13247 AC118282.1-201ENST00000506408 765 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SRSF6Q13247 AC119751.1-201ENST00000513357 765 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SRSF6Q13247 AC090833.1-201ENST00000513853 806 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
SRSF6Q13247 Y_RNA.673-201ENST00000516306 88 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SRSF6Q13247 SNORA31.8-201ENST00000516327 108 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SRSF6Q13247 RPL7P20-201ENST00000520308 745 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SRSF6Q13247 AC099520.1-205ENST00000524083 316 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
SRSF6Q13247 AP003122.3-201ENST00000526316 255 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SRSF6Q13247 AL353699.1-201ENST00000529078 365 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
SRSF6Q13247 AC073912.2-201ENST00000542821 317 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
SRSF6Q13247 AC092470.1-201ENST00000546187 132 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SRSF6Q13247 AL133279.2-201ENST00000556546 428 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
SRSF6Q13247 AC009145.1-201ENST00000563230 433 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
SRSF6Q13247 AC055876.1-202ENST00000567053 138 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SRSF6Q13247 AL138880.2-201ENST00000616214 239 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SRSF6Q13247 CR381572.1-201ENST00000625098 102 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SRSF6Q13247 LIG4-203ENST00000442234 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
SRSF6Q13247 CEP83-202ENST00000397807 2737 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
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