Protein–RNA interactions for Protein: Q12824

SMARCB1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily B member 1, humanhuman

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCB1Q12824 AC234064.1-201ENST00000436312 247 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SMARCB1Q12824 LINC00393-201ENST00000443621 282 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
SMARCB1Q12824 AL592437.1-201ENST00000443781 492 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SMARCB1Q12824 COX6CP2-201ENST00000444980 225 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SMARCB1Q12824 AC108733.1-201ENST00000479244 705 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
SMARCB1Q12824 AC091860.1-201ENST00000505723 432 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SMARCB1Q12824 AC093725.2-201ENST00000507808 356 ntTSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
SMARCB1Q12824 AC113385.1-201ENST00000511468 563 ntTSL 4 BASIC3.01□□□□□ -1.93
SMARCB1Q12824 MTCO2P32-201ENST00000514865 403 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SMARCB1Q12824 AC027544.2-201ENST00000539313 630 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
SMARCB1Q12824 OR6C68-201ENST00000548615 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.01□□□□□ -1.93
SMARCB1Q12824 AC068643.2-202ENST00000552759 622 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
SMARCB1Q12824 AC007495.1-203ENST00000569025 888 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
SMARCB1Q12824 AC097717.1-211ENST00000600604 687 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
SMARCB1Q12824 HSPE1P14-201ENST00000605812 302 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SMARCB1Q12824 AC016542.1-201ENST00000608259 493 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SMARCB1Q12824 AC008759.3-201ENST00000613300 508 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SMARCB1Q12824 AC231759.1-201ENST00000616455 597 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SMARCB1Q12824 AP002371.2-201ENST00000624450 503 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SMARCB1Q12824 KTN1-223ENST00000555573 1712 ntTSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
SMARCB1Q12824 THUMPD3P1-201ENST00000506556 1480 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SMARCB1Q12824 MLF1-203ENST00000392822 2157 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
SMARCB1Q12824 TOPORSLP1-203ENST00000493279 2871 ntTSL 4 BASIC3.01□□□□□ -1.93
SMARCB1Q12824 HMGN5-201ENST00000358130 2126 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
SMARCB1Q12824 VSTM2A-OT1-201ENST00000456049 3031 ntTSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
SMARCB1Q12824 CFHR3-201ENST00000367425 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
SMARCB1Q12824 AL365361.1-201ENST00000566942 3481 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SMARCB1Q12824 SNORA51.4-201ENST00000364993 124 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SMARCB1Q12824 Y_RNA.500-201ENST00000384466 111 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SMARCB1Q12824 MIR512-1-201ENST00000384913 84 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SMARCB1Q12824 MIR16-1-201ENST00000385271 89 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SMARCB1Q12824 RNU6-1176P-201ENST00000390955 107 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SMARCB1Q12824 RPL21P3-201ENST00000395517 478 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SMARCB1Q12824 AL603865.2-201ENST00000401679 213 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SMARCB1Q12824 HIST1H2APS3-201ENST00000403259 134 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SMARCB1Q12824 RNA5SP184-201ENST00000411071 108 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SMARCB1Q12824 AC069282.1-201ENST00000411911 526 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SMARCB1Q12824 SLC16A12-AS1-201ENST00000423474 405 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
SMARCB1Q12824 AC005165.1-203ENST00000423689 1281 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
SMARCB1Q12824 AC005517.2-201ENST00000424673 553 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SMARCB1Q12824 RPP40P1-201ENST00000426762 456 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SMARCB1Q12824 AC063976.3-201ENST00000426849 329 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SMARCB1Q12824 AL050338.2-202ENST00000431609 956 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
SMARCB1Q12824 AC106053.1-201ENST00000431697 368 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
SMARCB1Q12824 AC005160.1-201ENST00000432405 381 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
SMARCB1Q12824 AC007179.2-207ENST00000435557 556 ntTSL 4 BASIC3□□□□□ -1.93
SMARCB1Q12824 AL139230.1-201ENST00000440094 425 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
SMARCB1Q12824 RPL17P49-201ENST00000443728 411 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SMARCB1Q12824 SEPT14P24-201ENST00000447236 180 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SMARCB1Q12824 RPL23AP20-201ENST00000447965 421 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SMARCB1Q12824 TPTE2P6-203ENST00000450973 649 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
SMARCB1Q12824 AC011352.3-201ENST00000505162 593 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SMARCB1Q12824 KLHL2P1-201ENST00000508691 521 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SMARCB1Q12824 RNU6-56P-201ENST00000516986 93 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SMARCB1Q12824 AC068339.2-201ENST00000534395 618 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SMARCB1Q12824 AC010185.1-201ENST00000542489 456 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
SMARCB1Q12824 AC073912.2-201ENST00000542821 317 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
SMARCB1Q12824 AC069029.1-201ENST00000558736 263 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
SMARCB1Q12824 CMC2-208ENST00000564249 890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
SMARCB1Q12824 MTCYBP28-201ENST00000566728 1132 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SMARCB1Q12824 MIR4513-201ENST00000581077 86 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SMARCB1Q12824 MIR3162-201ENST00000581818 82 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SMARCB1Q12824 LINC01482-203ENST00000589610 468 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
SMARCB1Q12824 RPL12P50-201ENST00000603116 116 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SMARCB1Q12824 ATP1B3P1-201ENST00000605365 821 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SMARCB1Q12824 AC099785.1-201ENST00000605697 437 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SMARCB1Q12824 AC090115.4-201ENST00000609970 188 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SMARCB1Q12824 AC004696.1-201ENST00000614345 607 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SMARCB1Q12824 ZFAT-AS1_1.1-201ENST00000620907 79 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SMARCB1Q12824 AC007275.1-201ENST00000621243 671 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SMARCB1Q12824 AP003485.2-201ENST00000623636 610 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SMARCB1Q12824 AL139220.2-223ENST00000625982 921 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
SMARCB1Q12824 AC092447.7-201ENST00000422212 1621 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SMARCB1Q12824 AC091534.1-201ENST00000548779 1751 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
SMARCB1Q12824 CUL3-204ENST00000409777 3147 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
SMARCB1Q12824 NOC3L-201ENST00000371361 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
SMARCB1Q12824 SPEF2-203ENST00000440995 5964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
SMARCB1Q12824 MME-216ENST00000615825 5523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
SMARCB1Q12824 SNORA18.3-201ENST00000384122 132 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SMARCB1Q12824 OFD1P1Y-201ENST00000411756 1225 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SMARCB1Q12824 BOLA3P4-201ENST00000418151 400 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SMARCB1Q12824 SFR1P2-201ENST00000421841 730 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SMARCB1Q12824 AC104777.1-203ENST00000423428 554 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
SMARCB1Q12824 AC019097.1-201ENST00000424783 735 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SMARCB1Q12824 LINC01884-201ENST00000433429 440 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
SMARCB1Q12824 AC020594.1-201ENST00000437680 338 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
SMARCB1Q12824 AC064874.1-202ENST00000440101 287 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
SMARCB1Q12824 AL136164.1-201ENST00000456795 352 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
SMARCB1Q12824 AC105389.2-201ENST00000506475 435 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
SMARCB1Q12824 AC087241.1-201ENST00000508615 429 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
SMARCB1Q12824 C1GALT1P2-201ENST00000510813 1104 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SMARCB1Q12824 COX6CP8-201ENST00000522620 226 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SMARCB1Q12824 RRAS2-205ENST00000529237 1278 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
SMARCB1Q12824 HPRT1P3-201ENST00000539521 576 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SMARCB1Q12824 AC026462.2-201ENST00000565771 286 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
SMARCB1Q12824 AC008507.2-201ENST00000588402 1176 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SMARCB1Q12824 AL161896.1-201ENST00000597248 508 ntTSL 4 BASIC2.99□□□□□ -1.93
SMARCB1Q12824 AC006023.1-201ENST00000603944 259 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SMARCB1Q12824 AC073387.2-201ENST00000604797 784 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SMARCB1Q12824 OR2AS2P-201ENST00000606902 342 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
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