Protein–RNA interactions for Protein: Q12816

TRO, Trophinin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROQ12816 OR6C3-203ENST00000641740 1093 ntAPPRIS P1 BASIC3□□□□□ -1.93
TROQ12816 AC244517.1-201ENST00000606030 2086 ntBASIC3□□□□□ -1.93
TROQ12816 AP005901.5-201ENST00000545779 1796 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
TROQ12816 LINC01684-201ENST00000415182 2176 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
TROQ12816 FAM46D-201ENST00000308293 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
TROQ12816 AC104777.3-201ENST00000416350 545 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
TROQ12816 AC129850.1-201ENST00000436203 508 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
TROQ12816 RPL34P26-201ENST00000445636 354 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
TROQ12816 SNORD13-201ENST00000459299 104 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
TROQ12816 AL162742.2-201ENST00000472915 244 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
TROQ12816 LINC02488-201ENST00000504287 652 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
TROQ12816 HMGB1P1-201ENST00000522557 636 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
TROQ12816 AL133166.1-201ENST00000551040 1034 ntTSL 4 BASIC2.99□□□□□ -1.93
TROQ12816 FAM35CP-201ENST00000554755 2470 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
TROQ12816 NTS-201ENST00000256010 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
TROQ12816 Y_RNA.226-201ENST00000364337 114 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
TROQ12816 LUZP4P1-201ENST00000415420 344 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
TROQ12816 ACTR3BP6-201ENST00000422332 1241 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
TROQ12816 RPS26P30-201ENST00000443431 335 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
TROQ12816 MTAPP1-201ENST00000489154 819 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
TROQ12816 GZMAP1-201ENST00000503054 631 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
TROQ12816 ATG10-AS1-201ENST00000504846 648 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
TROQ12816 AC010265.1-201ENST00000513509 211 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
TROQ12816 SMARCE1P4-201ENST00000523647 241 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
TROQ12816 AC105094.2-202ENST00000590968 566 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
TROQ12816 AC097717.1-211ENST00000600604 687 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
TROQ12816 AC007687.1-201ENST00000602704 304 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
TROQ12816 ABI1P1-201ENST00000603375 1120 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
TROQ12816 AC128687.1-201ENST00000605304 619 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
TROQ12816 ERBIN-212ENST00000508515 4374 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
TROQ12816 SNORA40.18-201ENST00000391200 128 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
TROQ12816 AL109914.1-201ENST00000414740 146 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
TROQ12816 LINC01317-202ENST00000442026 677 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
TROQ12816 AC003001.1-201ENST00000443247 1135 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
TROQ12816 VN1R48P-201ENST00000448149 1036 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
TROQ12816 HMGB3P30-201ENST00000457863 606 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
TROQ12816 AC008571.1-201ENST00000467232 300 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
TROQ12816 AC104435.1-201ENST00000483483 166 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
TROQ12816 RPL23AP63-201ENST00000498752 471 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
TROQ12816 SNORD116-26-201ENST00000516006 96 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
TROQ12816 AC074052.2-201ENST00000562516 214 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
TROQ12816 DARS-AS1-221ENST00000608471 532 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
TROQ12816 AL391813.2-201ENST00000609113 322 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
TROQ12816 AC108479.2-201ENST00000617314 601 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
TROQ12816 AC091953.2-201ENST00000623979 160 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
TROQ12816 ESF1-202ENST00000617257 1470 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
TROQ12816 SENP7-206ENST00000394094 4703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
TROQ12816 ACTR6-212ENST00000552376 1659 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
TROQ12816 AKR1C1-201ENST00000380859 858 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
TROQ12816 MIR591-201ENST00000385290 95 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
TROQ12816 RNA5SP181-201ENST00000410246 98 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
TROQ12816 AC027124.2-201ENST00000428249 105 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
TROQ12816 NDUFB4P6-201ENST00000436819 366 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
TROQ12816 AL138799.3-201ENST00000438968 350 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
TROQ12816 snoZ278.1-201ENST00000517059 112 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
TROQ12816 RRAS2-205ENST00000529237 1278 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
TROQ12816 AC087623.1-201ENST00000533301 377 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
TROQ12816 OR4T1P-201ENST00000554933 911 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
TROQ12816 AC007906.1-201ENST00000568648 510 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
TROQ12816 AC067838.1-201ENST00000606064 577 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
TROQ12816 AC016877.3-201ENST00000606778 504 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
TROQ12816 ZNF644-212ENST00000621077 2056 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
TROQ12816 POLK-217ENST00000515295 1438 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
TROQ12816 AL355578.1-201ENST00000607405 1328 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
TROQ12816 MT-ND3-201ENST00000361227 346 ntAPPRIS P1 BASIC2.95□□□□□ -1.94
TROQ12816 SNORA26.7-201ENST00000391288 122 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
TROQ12816 RNU2-37P-201ENST00000410695 177 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
TROQ12816 AL445685.2-201ENST00000422551 342 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
TROQ12816 TRIAP1P1-201ENST00000427062 225 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
TROQ12816 AC093579.1-201ENST00000439455 352 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
TROQ12816 AC132942.1-201ENST00000486753 483 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
TROQ12816 LNX1-AS1-203ENST00000511989 488 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
TROQ12816 LINC01256-201ENST00000513270 508 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
TROQ12816 OR8X1P-201ENST00000534542 869 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
TROQ12816 AC090695.1-201ENST00000561269 1222 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
TROQ12816 AL354810.1-201ENST00000618134 635 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
TROQ12816 RBM12B-AS1-201ENST00000623283 653 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
TROQ12816 RFC1-217ENST00000639695 867 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
TROQ12816 ALG6-201ENST00000263440 1895 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
TROQ12816 AL353746.1-201ENST00000566293 6881 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
TROQ12816 OR5AC2-201ENST00000358642 930 ntAPPRIS P1 BASIC2.94□□□□□ -1.94
TROQ12816 SET-203ENST00000372688 801 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
TROQ12816 HIGD1C-201ENST00000398455 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
TROQ12816 RNU6ATAC16P-201ENST00000408591 138 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
TROQ12816 Z82205.1-201ENST00000428456 297 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
TROQ12816 AC022022.1-201ENST00000430304 178 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
TROQ12816 AL354936.1-201ENST00000441521 649 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
TROQ12816 LNX1-AS1-202ENST00000510785 550 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
TROQ12816 AC023200.1-201ENST00000519660 651 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
TROQ12816 C14orf105-204ENST00000526336 598 ntTSL 4 BASIC2.94□□□□□ -1.94
TROQ12816 AC079584.2-201ENST00000548756 515 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
TROQ12816 AC011611.5-201ENST00000552477 578 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
TROQ12816 AC005951.1-201ENST00000576706 485 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
TROQ12816 AP005433.1-202ENST00000580845 521 ntTSL 4 BASIC2.94□□□□□ -1.94
TROQ12816 MIR4512-201ENST00000583257 77 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
TROQ12816 PSMA6P4-201ENST00000603247 718 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
TROQ12816 AC011468.4-201ENST00000603942 409 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
TROQ12816 snoU13.31-201ENST00000607291 104 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
TROQ12816 AF230666.1-202ENST00000608375 870 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
TROQ12816 AC009318.3-201ENST00000616916 503 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
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