Protein–RNA interactions for Protein: Q12789

GTF3C1, General transcription factor 3C polypeptide 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C1Q12789 AKT3-201ENST00000263826 7081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
GTF3C1Q12789 DST-204ENST00000361203 22431 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
GTF3C1Q12789 C8orf34-202ENST00000337103 3652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
GTF3C1Q12789 NEDD4-208ENST00000508342 7235 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
GTF3C1Q12789 PRKACB-201ENST00000370680 1914 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
GTF3C1Q12789 AC007496.3-201ENST00000624987 3443 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
GTF3C1Q12789 CNBD1-202ENST00000518476 1594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
GTF3C1Q12789 MIS12-201ENST00000381165 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
GTF3C1Q12789 DEFB112-201ENST00000322246 342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
GTF3C1Q12789 MT-ND2-201ENST00000361453 1042 ntAPPRIS P1 BASIC2.8□□□□□ -1.96
GTF3C1Q12789 RNU4-92P-201ENST00000363783 136 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
GTF3C1Q12789 RNU6-1200P-201ENST00000384162 107 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
GTF3C1Q12789 AL162394.1-201ENST00000413271 419 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
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GTF3C1Q12789 NUP35P1-201ENST00000422734 947 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
GTF3C1Q12789 AC024619.1-202ENST00000426489 495 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
GTF3C1Q12789 SETP5-201ENST00000437270 562 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
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GTF3C1Q12789 AC003001.1-201ENST00000443247 1135 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
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GTF3C1Q12789 RNF138P1-201ENST00000502765 546 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
GTF3C1Q12789 MTCYBP35-201ENST00000503630 1137 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
GTF3C1Q12789 SNX5P1-201ENST00000505757 1041 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
GTF3C1Q12789 PAIP2-205ENST00000510080 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
GTF3C1Q12789 RN7SKP283-201ENST00000517197 270 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
GTF3C1Q12789 AP003461.1-201ENST00000528866 78 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
GTF3C1Q12789 OR4A45P-201ENST00000529954 901 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
GTF3C1Q12789 AC009320.1-201ENST00000549070 349 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
GTF3C1Q12789 AC008147.1-201ENST00000551284 325 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
GTF3C1Q12789 GTF3AP2-201ENST00000557014 266 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
GTF3C1Q12789 LINC02490-201ENST00000559915 601 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
GTF3C1Q12789 SLC12A1-210ENST00000561031 735 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
GTF3C1Q12789 AL132657.2-201ENST00000564417 358 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
GTF3C1Q12789 MYL12B-204ENST00000584539 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
GTF3C1Q12789 AC118755.2-201ENST00000584676 212 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
GTF3C1Q12789 LINC01899-203ENST00000584810 337 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
GTF3C1Q12789 AC016866.2-201ENST00000585251 502 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
GTF3C1Q12789 AC006557.3-201ENST00000592926 517 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
GTF3C1Q12789 uc_338.25-201ENST00000613756 156 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
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GTF3C1Q12789 AL450489.1-201ENST00000612071 468 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
GTF3C1Q12789 FAM157B-203ENST00000639350 358 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
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