Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 CYCSP6-201ENST00000434498 302 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 KRTAP8-2P-201ENST00000440620 186 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 AF064858.2-201ENST00000440714 292 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 AL445524.1-204ENST00000454631 458 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 TRBV1-201ENST00000476502 284 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 RN7SL447P-201ENST00000494711 245 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 MRPL36-203ENST00000505818 595 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 AC006427.1-201ENST00000514359 712 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 AC093689.1-201ENST00000514737 246 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 AC010280.1-201ENST00000515199 340 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 AC104057.1-201ENST00000515547 497 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 RNU6-941P-201ENST00000516346 108 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 LECT2-205ENST00000522943 574 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 AC090092.1-201ENST00000530576 510 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 AC007619.1-201ENST00000544086 412 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 CASC1-205ENST00000545133 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 AP001180.2-201ENST00000579413 422 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 AC011444.3-201ENST00000588342 325 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 ZNF561-AS1-207ENST00000591932 676 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 LINC00907-211ENST00000601948 795 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 PSMA6P4-201ENST00000603247 718 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 AC008814.1-201ENST00000603797 406 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 AC023813.4-201ENST00000607580 580 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 AL591926.2-202ENST00000615199 719 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 uc_338.11-201ENST00000619132 160 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 AC005911.1-201ENST00000619883 456 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 ATP1B4-202ENST00000361319 3856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 PCDH9-203ENST00000456367 5072 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 DTNA-202ENST00000283365 6522 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 FANCI-201ENST00000300027 4713 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 AC011912.1-201ENST00000623483 5819 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 ZNF807-201ENST00000328088 1707 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 ATPAF1-212ENST00000542495 1779 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 RASGEF1B-207ENST00000509081 3016 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 KCNJ16-204ENST00000585558 4014 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 BMPR2-201ENST00000374574 9683 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 AL022322.2-201ENST00000624072 20397 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 ASB14-202ENST00000487349 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 NSUN3-201ENST00000314622 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 GPATCH2L-214ENST00000621494 12396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 TRBV21OR9-2-201ENST00000331828 367 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 RNU6-1115P-201ENST00000362490 106 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 RNU6-179P-201ENST00000363350 107 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 RNU6-702P-201ENST00000364982 107 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 RNA5SP223-201ENST00000365174 120 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 OR14A2-201ENST00000366485 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 RNU6-278P-201ENST00000390945 109 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 RNA5SP339-201ENST00000390987 122 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 RNU6ATAC18P-201ENST00000408413 101 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 HMGB3P2-201ENST00000411913 584 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 VDAC1P9-201ENST00000412766 841 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 CBLL1-202ENST00000415884 804 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 AL035404.2-201ENST00000424418 304 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 OR2AH1P-201ENST00000425717 928 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 AC092162.1-201ENST00000432828 434 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 CFL1P1-202ENST00000432948 411 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 AL512658.1-202ENST00000433486 400 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 AC012442.1-201ENST00000436885 529 ntTSL 4 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 LINC01754-201ENST00000437920 750 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 GAPDHP58-201ENST00000438477 1006 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 FOCAD-AS1-201ENST00000439876 359 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 AL591501.1-201ENST00000439992 495 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 Z98949.2-201ENST00000440996 144 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 RPS11P7-201ENST00000442125 465 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 AC073587.1-201ENST00000447093 876 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 AC022431.1-201ENST00000450941 438 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 RN7SL283P-201ENST00000489055 303 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 AL139099.1-201ENST00000497398 403 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 AC119150.1-201ENST00000507143 563 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 MTND4LP22-201ENST00000508209 276 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 AC002456.2-201ENST00000509356 380 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 MEPE-206ENST00000511670 550 ntTSL 4 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 RNU6-976P-201ENST00000516086 111 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 RNU6-1271P-201ENST00000517049 105 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 AP001207.3-201ENST00000520268 491 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 IGKV2-18-201ENST00000522607 343 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 AP000676.2-201ENST00000529711 301 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 BNIP3P1-201ENST00000547295 580 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 AC126177.5-201ENST00000549599 178 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 TVP23CP2-201ENST00000571473 623 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 AC069061.3-201ENST00000582254 823 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 AC011518.1-202ENST00000592668 407 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 AL590099.1-201ENST00000615276 138 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 AC025034.2-201ENST00000623264 286 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 Z69720.2-201ENST00000624755 279 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 AL669831.3-213ENST00000636676 183 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 AC074101.1-201ENST00000637861 241 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 AC073869.10-201ENST00000642016 354 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 PTPRO-204ENST00000445537 4062 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 CPXCR1-202ENST00000373111 1577 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 ZNF442-205ENST00000545749 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 TMEM59-205ENST00000371348 1911 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 SLCO1B7-201ENST00000421593 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 DNAH12-203ENST00000389536 2613 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 SCN1A-218ENST00000640036 8131 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 ZMYM6-201ENST00000317538 2702 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 AC121333.1-201ENST00000567488 2709 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 ZBED6-201ENST00000545588 7979 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 TJP1-202ENST00000356107 6747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 SESN1-201ENST00000302071 2718 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 137.2 ms