Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

Predictions only

Length 3,210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPFP49454 MTND5P27-201ENST00000428871 1720 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CENPFP49454 CCDC30-212ENST00000507855 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
CENPFP49454 MUPP-201ENST00000438111 566 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CENPFP49454 AC092473.1-201ENST00000441098 221 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CENPFP49454 AL513321.1-201ENST00000441175 761 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CENPFP49454 TFEC-202ENST00000320239 6605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
CENPFP49454 AL355578.1-201ENST00000607405 1328 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CENPFP49454 OR52E2-201ENST00000321522 978 ntAPPRIS P1 BASIC2.13□□□□□ -2.07
CENPFP49454 AC019129.1-201ENST00000403786 261 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CENPFP49454 HMGN1P33-201ENST00000432945 451 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CENPFP49454 AC079117.1-201ENST00000445178 1000 ntTSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
CENPFP49454 SEMA6A-AS2-201ENST00000508766 482 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
CENPFP49454 AC079907.1-201ENST00000552707 374 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
CENPFP49454 PDE1A-205ENST00000435564 4885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
CENPFP49454 CXADR-203ENST00000400165 603 ntTSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
CENPFP49454 AL589765.2-201ENST00000420382 424 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
CENPFP49454 AL591704.1-201ENST00000432574 275 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CENPFP49454 LINC01359-202ENST00000436350 710 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
CENPFP49454 AC114316.1-201ENST00000511323 278 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
CENPFP49454 ESF1-202ENST00000617257 1470 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
CENPFP49454 Y_RNA.36-201ENST00000362602 112 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CENPFP49454 RNA5SP502-201ENST00000362694 119 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CENPFP49454 HMGB1P1-201ENST00000522557 636 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CENPFP49454 AP000889.2-201ENST00000532684 490 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CENPFP49454 C3orf79-201ENST00000623038 580 ntTSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
CENPFP49454 AC244517.1-201ENST00000606030 2086 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CENPFP49454 ANKRD62P1-201ENST00000434304 1623 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CENPFP49454 IGLV5-37-201ENST00000390300 374 ntAPPRIS P1 BASIC2.12□□□□□ -2.07
CENPFP49454 AC009969.1-201ENST00000438726 172 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CENPFP49454 AC068205.1-204ENST00000532989 481 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
CENPFP49454 AC003973.1-201ENST00000600071 546 ntTSL 4 BASIC2.12□□□□□ -2.07
CENPFP49454 AGTR1-205ENST00000461609 1545 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
CENPFP49454 SNRPFP4-201ENST00000456366 242 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CENPFP49454 AC108734.3-201ENST00000481241 1165 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CENPFP49454 TTC39CP1-201ENST00000512513 755 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CENPFP49454 AP003170.4-201ENST00000543486 586 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
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CENPFP49454 SERPINI2-206ENST00000471111 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
CENPFP49454 AC090518.1-201ENST00000562300 1495 ntTSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
CENPFP49454 AL606537.1-201ENST00000607258 2011 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CENPFP49454 SYNE2-212ENST00000554584 20508 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
CENPFP49454 MAPK10-266ENST00000641066 6555 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CENPFP49454 FER-201ENST00000281092 12119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
CENPFP49454 MIR1294-201ENST00000408503 142 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CENPFP49454 AC119800.1-201ENST00000429871 423 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
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CENPFP49454 AC097460.1-201ENST00000514624 590 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
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CENPFP49454 ATP2B1-202ENST00000359142 6977 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
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CENPFP49454 AC027458.1-201ENST00000563639 613 ntTSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
CENPFP49454 AC005336.3-201ENST00000623833 2679 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CENPFP49454 OR9G4-203ENST00000641581 2603 ntAPPRIS P1 BASIC2.11□□□□□ -2.07
CENPFP49454 OR9G4-204ENST00000641668 2608 ntAPPRIS P1 BASIC2.11□□□□□ -2.07
CENPFP49454 GABRA2-209ENST00000510861 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
CENPFP49454 LPP-220ENST00000617246 18220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
CENPFP49454 ANKAR-201ENST00000313581 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
CENPFP49454 CDH8-205ENST00000577730 8009 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
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CENPFP49454 AC097512.1-203ENST00000506425 957 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
CENPFP49454 RAB3IP-214ENST00000550847 670 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
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CENPFP49454 EXOC5P1-201ENST00000510543 1969 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
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CENPFP49454 SLC16A7-201ENST00000261187 11777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
CENPFP49454 RPS4XP11-201ENST00000446897 772 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
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CENPFP49454 AC087463.1-201ENST00000568541 556 ntTSL 2 BASIC2.1□□□□□ -2.07
CENPFP49454 AC005730.3-201ENST00000583067 366 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CENPFP49454 PHC3-215ENST00000495893 12666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
CENPFP49454 LINC02510-201ENST00000509798 1576 ntTSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
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CENPFP49454 MIR5089-201ENST00000580047 84 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CENPFP49454 AC084768.2-201ENST00000622736 221 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CENPFP49454 PLCB4-204ENST00000378501 5833 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
CENPFP49454 SI-201ENST00000264382 6011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
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