Protein–RNA interactions for Protein: O95484

CLDN9, Claudin-9, humanhuman

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Length 217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN9O95484 AC027807.1-201ENST00000559921 996 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CLDN9O95484 MIR5708-201ENST00000579723 85 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CLDN9O95484 AC015908.4-201ENST00000582334 575 ntTSL 4 BASIC3□□□□□ -1.93
CLDN9O95484 SATB1-AS1-207ENST00000593741 955 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
CLDN9O95484 BDH2P1-201ENST00000602288 736 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CLDN9O95484 PRELID3BP8-201ENST00000604148 295 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CLDN9O95484 AC008962.1-201ENST00000605729 304 ntBASIC3□□□□□ -1.93
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CLDN9O95484 AL512427.1-201ENST00000618593 349 ntBASIC3□□□□□ -1.93
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CLDN9O95484 AC109454.4-201ENST00000623411 649 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CLDN9O95484 SATB1-AS1-266ENST00000630271 813 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
CLDN9O95484 MAPK10-362ENST00000641864 4484 ntBASIC3□□□□□ -1.93
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CLDN9O95484 BAZ2B-202ENST00000343439 2364 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
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CLDN9O95484 ADAMTS9-AS1-207ENST00000594810 3609 ntTSL 4 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CLDN9O95484 C9orf72-202ENST00000379997 1873 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CLDN9O95484 ARPP19-211ENST00000568196 1489 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CLDN9O95484 LY96-201ENST00000284818 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
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CLDN9O95484 SNORA7.4-201ENST00000384249 137 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CLDN9O95484 U3.19-201ENST00000390893 196 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CLDN9O95484 RNA5SP274-201ENST00000410484 108 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CLDN9O95484 C1DP1-201ENST00000426049 402 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CLDN9O95484 AC007271.1-201ENST00000428188 382 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CLDN9O95484 AC005300.1-201ENST00000428401 373 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CLDN9O95484 MTCO1P3-201ENST00000429327 192 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
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CLDN9O95484 AC104211.1-202ENST00000521307 866 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
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CLDN9O95484 SPANXN4-202ENST00000446864 431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
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CLDN9O95484 AL606834.2-201ENST00000602954 668 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CLDN9O95484 AC016877.3-201ENST00000606778 504 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CLDN9O95484 AC106028.5-201ENST00000610332 395 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CLDN9O95484 SLC38A9-201ENST00000318672 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CLDN9O95484 AL365361.1-201ENST00000566942 3481 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CLDN9O95484 SAMD9-201ENST00000379958 6852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
CLDN9O95484 MTND5P1-201ENST00000445440 1375 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CLDN9O95484 MUC15-201ENST00000281268 2968 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
CLDN9O95484 KIAA1107-202ENST00000636278 4065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
CLDN9O95484 ANGPTL1-201ENST00000234816 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
CLDN9O95484 AC093831.2-201ENST00000624393 3427 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CLDN9O95484 METTL18-201ENST00000303469 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
CLDN9O95484 DIRC1-201ENST00000308100 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
CLDN9O95484 PTPRC-202ENST00000367364 1017 ntTSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
CLDN9O95484 RNU6-878P-201ENST00000384578 110 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CLDN9O95484 SNORD65.1-201ENST00000390889 71 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
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