Protein–RNA interactions for Protein: O43861

ATP9B, Probable phospholipid-transporting ATPase IIB, humanhuman

Predictions only

Length 1,147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP9BO43861 CSMD1-215ENST00000537824 13512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ATP9BO43861 EEF1A1P36-201ENST00000427807 1351 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
ATP9BO43861 AC139769.1-204ENST00000472297 1931 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
ATP9BO43861 Y_RNA.47-201ENST00000362697 108 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
ATP9BO43861 Y_RNA.473-201ENST00000384333 102 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
ATP9BO43861 AL590704.1-201ENST00000402856 794 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
ATP9BO43861 OR2AT2P-201ENST00000413438 905 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
ATP9BO43861 RPL7AP73-201ENST00000413490 353 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
ATP9BO43861 AC083867.1-201ENST00000413567 457 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ATP9BO43861 Z99755.1-201ENST00000414048 380 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
ATP9BO43861 AC011754.1-201ENST00000415201 491 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ATP9BO43861 AC004882.2-201ENST00000420180 244 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ATP9BO43861 AC026355.1-201ENST00000423466 587 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ATP9BO43861 USMG5P1-201ENST00000425964 177 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
ATP9BO43861 RSL24D1P6-201ENST00000426934 401 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
ATP9BO43861 HMGB1P27-201ENST00000431429 603 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
ATP9BO43861 AL731563.1-201ENST00000442202 214 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
ATP9BO43861 LINC01698-201ENST00000443636 727 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ATP9BO43861 MED28P3-201ENST00000444288 531 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
ATP9BO43861 RPS24P16-201ENST00000497294 392 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
ATP9BO43861 RPS27AP13-201ENST00000498403 237 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
ATP9BO43861 RN7SKP258-201ENST00000517151 304 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
ATP9BO43861 AP002404.1-201ENST00000532005 451 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
ATP9BO43861 AC025423.5-201ENST00000550230 219 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
ATP9BO43861 AL359219.2-201ENST00000555184 348 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
ATP9BO43861 AC074052.2-201ENST00000562516 214 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ATP9BO43861 AC009019.1-203ENST00000568603 515 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ATP9BO43861 MIR4505-201ENST00000582238 73 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
ATP9BO43861 CU639417.4-201ENST00000623928 207 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
ATP9BO43861 CRISP1-204ENST00000507853 1793 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
ATP9BO43861 AC092447.5-201ENST00000429367 2741 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
ATP9BO43861 IL15-204ENST00000477265 6026 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
ATP9BO43861 EBF1-211ENST00000622875 4430 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ATP9BO43861 ERP27-201ENST00000266397 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
ATP9BO43861 ERBIN-208ENST00000506030 4386 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
ATP9BO43861 AC104118.1-201ENST00000607625 1589 ntBASIC5.84□□□□□ -1.48
ATP9BO43861 SCN1A-209ENST00000635750 8299 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
ATP9BO43861 AC104964.3-201ENST00000606115 2860 ntBASIC5.84□□□□□ -1.48
ATP9BO43861 ZNF891-201ENST00000537226 15455 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ATP9BO43861 TEX26-201ENST00000380473 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
ATP9BO43861 AC066616.2-201ENST00000559334 1481 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ATP9BO43861 VCAN-201ENST00000265077 12625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
ATP9BO43861 RNF213-204ENST00000508628 17730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ATP9BO43861 AIG1-208ENST00000494282 3393 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
ATP9BO43861 ATF2-202ENST00000345739 4079 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
ATP9BO43861 DCDC1-203ENST00000406071 4758 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ATP9BO43861 CPSF2-201ENST00000298875 13035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
ATP9BO43861 SP110-202ENST00000258382 2080 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
ATP9BO43861 Y_RNA.80-201ENST00000362996 102 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ATP9BO43861 Y_RNA.176-201ENST00000363815 109 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ATP9BO43861 Y_RNA.428-201ENST00000384078 102 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ATP9BO43861 RNU6-45P-201ENST00000384471 107 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ATP9BO43861 MIR153-1-201ENST00000384914 90 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ATP9BO43861 MIR143-201ENST00000385300 106 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ATP9BO43861 MRLN-201ENST00000414264 422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
ATP9BO43861 AL590783.1-201ENST00000424138 456 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ATP9BO43861 AC096644.2-201ENST00000429278 159 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ATP9BO43861 H2AFZP6-201ENST00000444403 394 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ATP9BO43861 CEACAMP6-201ENST00000452007 574 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ATP9BO43861 AC017101.1-201ENST00000453665 571 ntTSL 4 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ATP9BO43861 AC128713.1-201ENST00000471495 306 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ATP9BO43861 RPL31P60-201ENST00000478450 367 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ATP9BO43861 AP000926.1-201ENST00000479573 241 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ATP9BO43861 RNU6-699P-201ENST00000517081 110 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ATP9BO43861 NRG1-IT1-203ENST00000523743 292 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ATP9BO43861 AL161670.1-201ENST00000554348 137 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ATP9BO43861 AC092718.6-202ENST00000563072 408 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ATP9BO43861 AC091043.1-201ENST00000579830 453 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ATP9BO43861 AC073539.2-201ENST00000597113 165 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ATP9BO43861 AC012119.1-201ENST00000603184 222 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ATP9BO43861 FO393422.1-201ENST00000603908 708 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ATP9BO43861 MIR6768-201ENST00000610734 72 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ATP9BO43861 AL122125.1-201ENST00000616999 600 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ATP9BO43861 LDHA-225ENST00000625635 141 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ATP9BO43861 LINC02431-201ENST00000503929 3601 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
ATP9BO43861 ABCB5-201ENST00000258738 2906 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
ATP9BO43861 LEPROT-206ENST00000613538 4625 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
ATP9BO43861 GPX8-201ENST00000296734 3245 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
ATP9BO43861 THEMIS-204ENST00000537166 3830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ATP9BO43861 AC009962.1-201ENST00000567327 3813 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ATP9BO43861 NR2C2-213ENST00000617312 8113 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
ATP9BO43861 LEPR-208ENST00000616738 5081 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
ATP9BO43861 TCF7L2-206ENST00000355995 4073 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
ATP9BO43861 RSF1-204ENST00000480887 5318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
ATP9BO43861 RYR3-208ENST00000622037 15564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ATP9BO43861 IGSF10-201ENST00000282466 11067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
ATP9BO43861 LIMA1-215ENST00000552823 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
ATP9BO43861 DBT-202ENST00000370132 10799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
ATP9BO43861 RWDD2A-201ENST00000369724 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
ATP9BO43861 BACH1-202ENST00000399921 5769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
ATP9BO43861 TRPC4-202ENST00000355779 2784 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
ATP9BO43861 AC024337.2-201ENST00000616608 2797 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
ATP9BO43861 AASDH-201ENST00000205214 3590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
ATP9BO43861 CD84-204ENST00000368048 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
ATP9BO43861 Y_RNA.480-201ENST00000384364 102 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
ATP9BO43861 RNU6-14P-201ENST00000384630 106 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
ATP9BO43861 IGKV5-2-201ENST00000390244 408 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
ATP9BO43861 AC079809.1-201ENST00000415468 276 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
ATP9BO43861 EEF1A1P29-201ENST00000416082 1096 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
ATP9BO43861 AC007566.1-201ENST00000427458 643 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.6 ms