Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYF3

FAM53C, Protein FAM53C, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM53CQ9NYF3 AC093311.1-201ENST00000506586 2021 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
FAM53CQ9NYF3 SLC26A7-209ENST00000617078 5094 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
FAM53CQ9NYF3 DAZ4-207ENST00000634662 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
FAM53CQ9NYF3 ARHGAP42P1-201ENST00000507474 1976 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
FAM53CQ9NYF3 IL1RL1-201ENST00000233954 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
FAM53CQ9NYF3 OR8H2-203ENST00000641311 3092 ntAPPRIS P2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
FAM53CQ9NYF3 TMEM71-202ENST00000377901 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
FAM53CQ9NYF3 ECHDC1-222ENST00000531967 2585 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
FAM53CQ9NYF3 OPRM1-206ENST00000419506 1402 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
FAM53CQ9NYF3 AL512646.1-201ENST00000269395 1077 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
FAM53CQ9NYF3 U3.12-201ENST00000364498 214 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
FAM53CQ9NYF3 RNU4-48P-201ENST00000365559 182 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
FAM53CQ9NYF3 GCSAML-201ENST00000366488 3820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
FAM53CQ9NYF3 RNU6-890P-201ENST00000384121 107 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
FAM53CQ9NYF3 Y_RNA.473-201ENST00000384333 102 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
FAM53CQ9NYF3 RNU6-39P-201ENST00000384344 107 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
FAM53CQ9NYF3 Y_RNA.556-201ENST00000384677 113 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
FAM53CQ9NYF3 AL133388.1-201ENST00000404509 287 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
FAM53CQ9NYF3 SNORA77-201ENST00000408716 125 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
FAM53CQ9NYF3 RNU4-6P-201ENST00000410804 122 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
FAM53CQ9NYF3 AC104463.1-201ENST00000411431 365 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
FAM53CQ9NYF3 AC073333.1-201ENST00000418907 648 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
FAM53CQ9NYF3 AC093911.1-201ENST00000419129 552 ntTSL 4 BASIC5.01□□□□□ -1.61
FAM53CQ9NYF3 AC104777.1-203ENST00000423428 554 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
FAM53CQ9NYF3 BX323845.3-201ENST00000428215 527 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
FAM53CQ9NYF3 AP001476.3-201ENST00000429512 415 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
FAM53CQ9NYF3 FGF12-202ENST00000430714 603 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
FAM53CQ9NYF3 AC079781.2-201ENST00000446424 169 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
FAM53CQ9NYF3 AC023194.2-201ENST00000465398 406 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
FAM53CQ9NYF3 RPL7L1P8-201ENST00000469911 741 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
FAM53CQ9NYF3 AC098818.1-201ENST00000478593 252 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
FAM53CQ9NYF3 RPL37P23-201ENST00000492641 294 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
FAM53CQ9NYF3 AC092666.1-202ENST00000493400 442 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
FAM53CQ9NYF3 EEF1A1P25-201ENST00000495704 1267 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
FAM53CQ9NYF3 AL136537.1-202ENST00000501725 430 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
FAM53CQ9NYF3 AC109481.1-201ENST00000509173 282 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
FAM53CQ9NYF3 AC002456.2-201ENST00000509356 380 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
FAM53CQ9NYF3 RN7SKP238-201ENST00000516483 249 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
FAM53CQ9NYF3 RN7SKP283-201ENST00000517197 270 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
FAM53CQ9NYF3 AC111149.1-201ENST00000522560 343 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
FAM53CQ9NYF3 AP000827.1-201ENST00000527814 258 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
FAM53CQ9NYF3 AC091053.2-201ENST00000534169 537 ntTSL 4 BASIC5.01□□□□□ -1.61
FAM53CQ9NYF3 AC084819.1-201ENST00000537293 424 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
FAM53CQ9NYF3 AC128657.1-201ENST00000549459 145 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
FAM53CQ9NYF3 DAZAP2-209ENST00000549732 601 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
FAM53CQ9NYF3 FKBP1BP1-201ENST00000553366 325 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
FAM53CQ9NYF3 AC069061.3-201ENST00000582254 823 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
FAM53CQ9NYF3 AC004448.4-204ENST00000585389 743 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
FAM53CQ9NYF3 MIR212-201ENST00000586026 110 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
FAM53CQ9NYF3 AC009271.1-202ENST00000588803 492 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
FAM53CQ9NYF3 BNIP3P25-201ENST00000596023 559 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
FAM53CQ9NYF3 AL022099.1-201ENST00000604551 712 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
FAM53CQ9NYF3 AC087783.2-201ENST00000605070 562 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
FAM53CQ9NYF3 ST6GALNAC3-203ENST00000621530 617 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
FAM53CQ9NYF3 AL669831.3-213ENST00000636676 183 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
FAM53CQ9NYF3 ATM-230ENST00000640388 578 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
FAM53CQ9NYF3 NOL8P1-201ENST00000508336 3529 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
FAM53CQ9NYF3 EMSY-207ENST00000525919 4074 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
FAM53CQ9NYF3 DST-220ENST00000518935 3547 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
FAM53CQ9NYF3 SLC26A7-210ENST00000617233 5257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
FAM53CQ9NYF3 KCNC4-201ENST00000369787 18750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
FAM53CQ9NYF3 ZNF445-201ENST00000396077 18299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
FAM53CQ9NYF3 USP9YP4-201ENST00000424401 1745 ntBASIC5□□□□□ -1.61
FAM53CQ9NYF3 CTAGE5-201ENST00000280082 2554 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
FAM53CQ9NYF3 RASGRP1-209ENST00000559830 1910 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
FAM53CQ9NYF3 AC099792.1-203ENST00000634701 2183 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
FAM53CQ9NYF3 DEFB107A-201ENST00000335021 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
FAM53CQ9NYF3 DEFB107B-201ENST00000355602 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
FAM53CQ9NYF3 OR6K2-201ENST00000359610 975 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
FAM53CQ9NYF3 RNU6-552P-201ENST00000362869 119 ntBASIC5□□□□□ -1.61
FAM53CQ9NYF3 Y_RNA.80-201ENST00000362996 102 ntBASIC5□□□□□ -1.61
FAM53CQ9NYF3 RNU6-774P-201ENST00000363238 107 ntBASIC5□□□□□ -1.61
FAM53CQ9NYF3 Y_RNA.485-201ENST00000384395 102 ntBASIC5□□□□□ -1.61
FAM53CQ9NYF3 MIR320B1-201ENST00000390209 79 ntBASIC5□□□□□ -1.61
FAM53CQ9NYF3 HMGB1P17-201ENST00000403495 628 ntBASIC5□□□□□ -1.61
FAM53CQ9NYF3 MIR548I2-201ENST00000408348 149 ntBASIC5□□□□□ -1.61
FAM53CQ9NYF3 AL596448.1-201ENST00000415024 392 ntBASIC5□□□□□ -1.61
FAM53CQ9NYF3 TRBV29-1-201ENST00000422143 402 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
FAM53CQ9NYF3 AL133173.1-201ENST00000423458 397 ntBASIC5□□□□□ -1.61
FAM53CQ9NYF3 RPL23AP4-201ENST00000427757 463 ntBASIC5□□□□□ -1.61
FAM53CQ9NYF3 LINC01307-201ENST00000439146 474 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
FAM53CQ9NYF3 AC093579.1-201ENST00000439455 352 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
FAM53CQ9NYF3 TRAPPC2P3-201ENST00000443200 321 ntBASIC5□□□□□ -1.61
FAM53CQ9NYF3 AC105399.1-202ENST00000447303 205 ntBASIC5□□□□□ -1.61
FAM53CQ9NYF3 RPL7P52-201ENST00000449200 742 ntBASIC5□□□□□ -1.61
FAM53CQ9NYF3 LINC01729-201ENST00000450640 358 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
FAM53CQ9NYF3 LINC01150-201ENST00000455671 315 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
FAM53CQ9NYF3 AC019084.1-201ENST00000457337 432 ntBASIC5□□□□□ -1.61
FAM53CQ9NYF3 RPL23AP12-201ENST00000467573 473 ntBASIC5□□□□□ -1.61
FAM53CQ9NYF3 AP001025.2-201ENST00000490908 477 ntBASIC5□□□□□ -1.61
FAM53CQ9NYF3 AC108022.1-201ENST00000493466 478 ntBASIC5□□□□□ -1.61
FAM53CQ9NYF3 RPS26P24-201ENST00000497656 331 ntBASIC5□□□□□ -1.61
FAM53CQ9NYF3 GZMAP1-201ENST00000503054 631 ntBASIC5□□□□□ -1.61
FAM53CQ9NYF3 RNU6-202P-201ENST00000515998 96 ntBASIC5□□□□□ -1.61
FAM53CQ9NYF3 RNA5SP340-201ENST00000517132 107 ntBASIC5□□□□□ -1.61
FAM53CQ9NYF3 AC109635.4-202ENST00000531666 412 ntBASIC5□□□□□ -1.61
FAM53CQ9NYF3 AC099518.4-202ENST00000576433 455 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
FAM53CQ9NYF3 MIR5583-1-201ENST00000580941 59 ntBASIC5□□□□□ -1.61
FAM53CQ9NYF3 AL391422.2-201ENST00000602854 361 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
FAM53CQ9NYF3 AL713866.2-201ENST00000603579 219 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 141.3 ms