Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT2

C9orf135, Protein C9orf135, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135Q5VTT2 CD2-201ENST00000369477 478 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
C9orf135Q5VTT2 RN7SKP123-201ENST00000410732 291 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
C9orf135Q5VTT2 UBE2Q2P12-201ENST00000414573 204 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
C9orf135Q5VTT2 AC019064.1-201ENST00000414796 499 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
C9orf135Q5VTT2 AL355989.1-202ENST00000419406 408 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
C9orf135Q5VTT2 RPL7P30-201ENST00000420888 709 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
C9orf135Q5VTT2 AL033504.1-201ENST00000427015 773 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
C9orf135Q5VTT2 LINC01473-202ENST00000427108 695 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
C9orf135Q5VTT2 AC104332.2-201ENST00000429959 156 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
C9orf135Q5VTT2 SPINK8-201ENST00000434006 444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
C9orf135Q5VTT2 BX679664.1-201ENST00000434429 253 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
C9orf135Q5VTT2 AC004866.2-201ENST00000438285 481 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
C9orf135Q5VTT2 AC092393.1-201ENST00000439625 742 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
C9orf135Q5VTT2 RPS3AP12-201ENST00000443616 753 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
C9orf135Q5VTT2 LINC00278-202ENST00000444263 587 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
C9orf135Q5VTT2 MRPL42P4-201ENST00000453267 443 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
C9orf135Q5VTT2 Z82190.1-201ENST00000454534 490 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
C9orf135Q5VTT2 AL590639.1-201ENST00000456484 337 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
C9orf135Q5VTT2 AC117465.1-201ENST00000457125 522 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
C9orf135Q5VTT2 FAIM-205ENST00000464668 641 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
C9orf135Q5VTT2 RN7SL807P-201ENST00000470923 297 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
C9orf135Q5VTT2 POU5F1P7-201ENST00000508759 541 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
C9orf135Q5VTT2 RNU4ATAC3P-201ENST00000516699 126 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
C9orf135Q5VTT2 LINC02267-202ENST00000522173 799 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
C9orf135Q5VTT2 LINCR-0001-203ENST00000524047 545 ntTSL 4 BASIC2.82□□□□□ -1.96
C9orf135Q5VTT2 AP001636.2-201ENST00000525517 696 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
C9orf135Q5VTT2 AC068339.2-201ENST00000534395 618 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
C9orf135Q5VTT2 AL160191.1-202ENST00000554008 576 ntTSL 4 BASIC2.82□□□□□ -1.96
C9orf135Q5VTT2 AL136520.1-202ENST00000555494 763 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
C9orf135Q5VTT2 AP005205.1-201ENST00000563503 508 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
C9orf135Q5VTT2 AC122134.1-202ENST00000569111 1201 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
C9orf135Q5VTT2 MIR2682-201ENST00000580305 110 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
C9orf135Q5VTT2 MIR5195-201ENST00000583555 115 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
C9orf135Q5VTT2 AC233702.6-201ENST00000584594 396 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
C9orf135Q5VTT2 AC098617.1-215ENST00000594798 1152 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
C9orf135Q5VTT2 PRELID3BP8-201ENST00000604148 295 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
C9orf135Q5VTT2 ESRRAP2-204ENST00000606337 280 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
C9orf135Q5VTT2 AC090948.3-201ENST00000606713 551 ntTSL 4 BASIC2.82□□□□□ -1.96
C9orf135Q5VTT2 AC131902.3-201ENST00000611767 581 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
C9orf135Q5VTT2 uc_338.25-201ENST00000613756 156 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
C9orf135Q5VTT2 MIR6076-201ENST00000617521 113 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
C9orf135Q5VTT2 AC022509.4-201ENST00000621404 572 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
C9orf135Q5VTT2 C8orf89-203ENST00000625134 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
C9orf135Q5VTT2 AC090740.1-201ENST00000623193 2262 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
C9orf135Q5VTT2 CHD9-203ENST00000447540 11509 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
C9orf135Q5VTT2 MIER3-203ENST00000381213 5198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
C9orf135Q5VTT2 CUL1P1-201ENST00000509510 2425 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
C9orf135Q5VTT2 ATP2C1-202ENST00000359644 3401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
C9orf135Q5VTT2 CDK1-201ENST00000316629 1733 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
C9orf135Q5VTT2 RNU5D-1-201ENST00000363299 116 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
C9orf135Q5VTT2 RNU6-1155P-201ENST00000363554 107 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
C9orf135Q5VTT2 MIR491-201ENST00000384877 84 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
C9orf135Q5VTT2 SPINK13-201ENST00000398450 509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
C9orf135Q5VTT2 RPS4XP3-201ENST00000398541 413 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
C9orf135Q5VTT2 AL136372.1-201ENST00000403060 228 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
C9orf135Q5VTT2 FAT1P1-201ENST00000406588 507 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
C9orf135Q5VTT2 RNA5SP229-201ENST00000410809 99 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
C9orf135Q5VTT2 RNU2-72P-201ENST00000411175 163 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
C9orf135Q5VTT2 AC003075.1-202ENST00000419382 720 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
C9orf135Q5VTT2 AL590432.1-201ENST00000420071 566 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
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C9orf135Q5VTT2 AC092598.1-201ENST00000431708 797 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
C9orf135Q5VTT2 AL355340.1-201ENST00000433085 344 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
C9orf135Q5VTT2 LINC00113-203ENST00000442550 572 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
C9orf135Q5VTT2 AL020998.1-201ENST00000444923 229 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
C9orf135Q5VTT2 RFC5P1-201ENST00000454419 874 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
C9orf135Q5VTT2 RPL30P14-201ENST00000482744 348 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
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C9orf135Q5VTT2 AL022099.1-201ENST00000604551 712 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
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C9orf135Q5VTT2 AC090617.7-201ENST00000623952 126 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
C9orf135Q5VTT2 C8orf89-202ENST00000624510 658 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
C9orf135Q5VTT2 ERBIN-204ENST00000380943 6410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
C9orf135Q5VTT2 AL513185.3-201ENST00000433335 1300 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
C9orf135Q5VTT2 SEPT7-205ENST00000432293 1362 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
C9orf135Q5VTT2 AC011460.1-201ENST00000636268 1834 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
C9orf135Q5VTT2 LRRC70-201ENST00000334994 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
C9orf135Q5VTT2 AC009487.2-201ENST00000420969 6821 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
C9orf135Q5VTT2 LCA5L-218ENST00000485895 2551 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
C9orf135Q5VTT2 OR9G4-203ENST00000641581 2603 ntAPPRIS P1 BASIC2.81□□□□□ -1.96
C9orf135Q5VTT2 MBNL3-205ENST00000370857 8760 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
C9orf135Q5VTT2 MTRNR2L10-201ENST00000545075 1530 ntAPPRIS P1 BASIC2.8□□□□□ -1.96
C9orf135Q5VTT2 AL136520.1-201ENST00000600311 1322 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
C9orf135Q5VTT2 OR6C75-201ENST00000343399 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.8□□□□□ -1.96
C9orf135Q5VTT2 RNA5SP374-201ENST00000362939 125 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
C9orf135Q5VTT2 SUGT1P1-201ENST00000379514 476 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
C9orf135Q5VTT2 RNU6-878P-201ENST00000384578 110 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
C9orf135Q5VTT2 AL355615.1-201ENST00000406187 641 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
C9orf135Q5VTT2 RNU6ATAC10P-201ENST00000408635 111 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
C9orf135Q5VTT2 AL353148.1-204ENST00000426752 477 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
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