Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

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Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 AL353608.2-201ENST00000425587 340 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 LINC01817-201ENST00000429317 564 ntTSL 4 BASIC5.62□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 AC104634.1-201ENST00000452720 462 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 AC112229.2-201ENST00000456683 476 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 RPS3AP41-201ENST00000462701 778 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 AC008481.1-201ENST00000463278 396 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 AC008571.1-201ENST00000467232 300 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 RPS27AP1-201ENST00000475545 471 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 VN1R105P-201ENST00000486595 910 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 AC093001.1-201ENST00000489011 551 ntTSL 4 BASIC5.62□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 CLEC19A-204ENST00000493231 557 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 MFAP3L-206ENST00000506110 548 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 HIGD1AP14-201ENST00000507617 282 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 SPRY4-AS1-205ENST00000514303 152 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 AC079209.1-202ENST00000521953 522 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 AP000827.1-201ENST00000527814 258 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 STX3-204ENST00000530221 534 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 AC022882.1-201ENST00000532142 501 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 CLEC7A-212ENST00000533022 625 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 CACNA1C-IT2-201ENST00000541871 589 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 HSBP1P1-201ENST00000555205 166 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 AC011477.3-201ENST00000585571 403 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 AC011494.1-201ENST00000596454 237 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 Z98949.1-207ENST00000609157 814 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 AC025574.2-201ENST00000615621 514 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 AC109780.1-201ENST00000451768 1344 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 RIMS2-205ENST00000436393 4384 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 TBCK-205ENST00000432496 3362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 LMNTD1-201ENST00000282881 1718 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 AC008758.3-201ENST00000507003 1829 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 AL078621.3-201ENST00000623707 2042 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 ATXN7-208ENST00000484332 2741 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 VWC2L-202ENST00000427124 4480 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 RAB18-209ENST00000621805 4894 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 U3.7-201ENST00000363668 216 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 RNU6-1284P-201ENST00000363701 100 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 Y_RNA.210-201ENST00000364161 110 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 RHOT1P2-201ENST00000366423 333 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 LCLAT1-203ENST00000379509 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 Y_RNA.489-201ENST00000384410 101 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 KRTAP29-1-201ENST00000391353 1026 ntAPPRIS P1 BASIC5.61□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 GAPT-202ENST00000396776 3016 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 YPEL5-204ENST00000402003 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 MIR1203-201ENST00000408812 85 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 RNU4-61P-201ENST00000411243 107 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 AMMECR1LP1-201ENST00000415152 841 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 AC092809.3-201ENST00000415453 231 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 RPS12P5-201ENST00000423449 371 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 SOCS5P3-201ENST00000425115 1576 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 RPL7AP49-201ENST00000429522 581 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 CEP57L1P1-201ENST00000430943 1201 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 AL591438.1-201ENST00000433508 581 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 MTCO3P45-201ENST00000443036 613 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 DARS-AS1-206ENST00000446492 488 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 GAPDHP27-201ENST00000447427 1020 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 CALCOCO2-204ENST00000448105 1916 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 AC017101.1-201ENST00000453665 571 ntTSL 4 BASIC5.61□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 RPL10P17-201ENST00000453852 316 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 AL353752.1-201ENST00000454946 260 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 LINC01210-201ENST00000465283 625 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 AP000797.2-201ENST00000475768 606 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 RN7SL273P-201ENST00000481561 299 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 RPL22P13-201ENST00000493291 347 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 AC114801.2-201ENST00000503825 781 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 NDUFB5P1-201ENST00000508134 564 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 AC131281.1-201ENST00000522984 164 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 AC026371.1-201ENST00000551867 419 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 SETP7-201ENST00000552169 453 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 AC023906.2-201ENST00000558343 462 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 DPP8-210ENST00000559233 2953 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 C16orf97-203ENST00000566314 281 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 MSMB-201ENST00000581478 386 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 AC092070.3-201ENST00000596041 337 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 ERVK-28-203ENST00000600419 457 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 AC024075.3-201ENST00000601687 453 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 AC007566.2-201ENST00000603642 413 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 AL670379.6-201ENST00000603753 252 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 AL670379.1-201ENST00000604752 252 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 AL670379.5-201ENST00000605253 252 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 AL670379.8-201ENST00000605353 252 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 AL670379.7-201ENST00000605823 252 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 SNORD58B-201ENST00000607313 66 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 AC020634.1-201ENST00000608701 549 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 MIR6768-201ENST00000610734 72 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 CPNE4-214ENST00000617767 3556 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 SNHG22-203ENST00000617833 660 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 AC074140.1-201ENST00000621617 208 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 AP001784.1-201ENST00000624107 428 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 HUWE1-214ENST00000612484 14311 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 OBSCN-214ENST00000636875 23907 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 PIGK-203ENST00000445065 4318 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 SMC2-202ENST00000374787 4266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 AC018628.1-201ENST00000624147 3819 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 OR8J3-204ENST00000642058 3806 ntAPPRIS P1 BASIC5.61□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 EYA4-211ENST00000525849 3456 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 ITGAV-204ENST00000433736 3288 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 RAB3GAP1-207ENST00000539493 3161 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 SRRM1-202ENST00000374389 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 OR4F5-202ENST00000641515 2618 ntAPPRIS P1 BASIC5.61□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 USP45-204ENST00000369233 2514 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
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