Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 OR5T2-201ENST00000313264 1248 ntAPPRIS P2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
CTF1Q16619 RNU1-14P-201ENST00000362759 152 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CTF1Q16619 SNORD35B-201ENST00000363660 87 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CTF1Q16619 RNY4P34-201ENST00000364779 95 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CTF1Q16619 RNU6-283P-201ENST00000364788 107 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CTF1Q16619 PTPRC-202ENST00000367364 1017 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
CTF1Q16619 ERMN-204ENST00000409925 556 ntTSL 4 BASIC3.53□□□□□ -1.84
CTF1Q16619 RNA5SP36-201ENST00000410197 133 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CTF1Q16619 TMSB10P2-201ENST00000416049 131 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CTF1Q16619 LINC01074-201ENST00000422527 555 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
CTF1Q16619 TTC3-AS1-201ENST00000424733 1097 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
CTF1Q16619 FTH1P1-201ENST00000437933 532 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CTF1Q16619 MTND1P34-201ENST00000438556 671 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CTF1Q16619 AC007003.1-202ENST00000439318 349 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
CTF1Q16619 AL138799.4-201ENST00000443939 643 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
CTF1Q16619 AL365271.1-201ENST00000448909 603 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
CTF1Q16619 MRPS31P2-201ENST00000451581 518 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CTF1Q16619 AL603839.1-201ENST00000453437 432 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
CTF1Q16619 AC098824.1-201ENST00000453565 980 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CTF1Q16619 AC099563.1-201ENST00000456086 418 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CTF1Q16619 AC096554.1-201ENST00000458182 529 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
CTF1Q16619 ST13P14-201ENST00000474095 734 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CTF1Q16619 RN7SL30P-201ENST00000488416 306 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CTF1Q16619 AC012170.1-201ENST00000495139 359 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CTF1Q16619 RPL29P14-201ENST00000495837 428 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CTF1Q16619 AC097478.1-202ENST00000508021 567 ntTSL 4 BASIC3.53□□□□□ -1.84
CTF1Q16619 AC016550.2-202ENST00000511940 581 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
CTF1Q16619 NPM1P41-201ENST00000512920 831 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CTF1Q16619 APELA-204ENST00000515275 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
CTF1Q16619 RNU6-430P-201ENST00000517078 107 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CTF1Q16619 OR4R3P-201ENST00000525084 838 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CTF1Q16619 AC022240.1-201ENST00000532065 684 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
CTF1Q16619 ZNF84-205ENST00000535439 647 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
CTF1Q16619 LINC02398-201ENST00000536666 431 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
CTF1Q16619 CR383656.7-201ENST00000548164 174 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CTF1Q16619 AC126177.3-201ENST00000551839 688 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CTF1Q16619 AL049875.1-201ENST00000554328 582 ntTSL 4 BASIC3.53□□□□□ -1.84
CTF1Q16619 AC245505.1-201ENST00000556398 224 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CTF1Q16619 AC068397.1-201ENST00000560337 531 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
CTF1Q16619 AC055855.3-201ENST00000564269 578 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
CTF1Q16619 AL356432.3-201ENST00000568952 465 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CTF1Q16619 AC137800.2-201ENST00000574375 120 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CTF1Q16619 AC022655.2-201ENST00000577280 318 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CTF1Q16619 AC005304.3-201ENST00000581533 511 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
CTF1Q16619 AC037487.2-201ENST00000581796 537 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
CTF1Q16619 RN7SL690P-201ENST00000582087 240 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CTF1Q16619 TCF4-AS2-201ENST00000586467 445 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
CTF1Q16619 AL157938.2-204ENST00000589667 826 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
CTF1Q16619 CKS1BP3-201ENST00000600888 237 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CTF1Q16619 AP001972.3-202ENST00000603012 375 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
CTF1Q16619 AC090948.1-201ENST00000607464 549 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CTF1Q16619 AC109347.2-201ENST00000610220 349 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CTF1Q16619 UBE2Q2P2-203ENST00000613592 761 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CTF1Q16619 AC243585.1-201ENST00000617867 607 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
CTF1Q16619 AC087385.3-201ENST00000620477 187 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CTF1Q16619 OR5B3-202ENST00000641865 1046 ntAPPRIS P1 BASIC3.53□□□□□ -1.84
CTF1Q16619 UBE2D3-233ENST00000618836 3472 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
CTF1Q16619 KCNT2-202ENST00000367433 5883 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
CTF1Q16619 PCAT4-201ENST00000504263 2091 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
CTF1Q16619 WDR17-204ENST00000507824 4119 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
CTF1Q16619 RNF38-203ENST00000353739 4945 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
CTF1Q16619 ETV1-202ENST00000399357 6096 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
CTF1Q16619 FAM111B-206ENST00000620384 3405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.85
CTF1Q16619 ATP2B1-202ENST00000359142 6977 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CTF1Q16619 ABCA12-202ENST00000389661 7005 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
CTF1Q16619 RNU6-1215P-201ENST00000384441 102 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CTF1Q16619 Y_RNA.516-201ENST00000384541 124 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CTF1Q16619 TRAJ32-201ENST00000390505 66 ntAPPRIS P1 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CTF1Q16619 TRAJ7-201ENST00000390530 59 ntAPPRIS P1 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CTF1Q16619 RNU6-837P-201ENST00000391056 108 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CTF1Q16619 RNU11-4P-201ENST00000391149 133 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CTF1Q16619 SNORA17A-201ENST00000391185 133 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CTF1Q16619 RPA3-203ENST00000401447 414 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CTF1Q16619 RN7SKP33-201ENST00000410942 340 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CTF1Q16619 LINC01312-201ENST00000412745 775 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CTF1Q16619 AC073626.1-201ENST00000415146 582 ntTSL 4 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CTF1Q16619 C1DP2-201ENST00000418167 426 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CTF1Q16619 AL033539.1-201ENST00000427775 743 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CTF1Q16619 RBMY2QP-201ENST00000429799 1147 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CTF1Q16619 AC093581.1-202ENST00000430890 391 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CTF1Q16619 AC092598.1-201ENST00000431708 797 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CTF1Q16619 Z74696.2-201ENST00000436514 498 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CTF1Q16619 TRIM60P9Y-201ENST00000438459 816 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CTF1Q16619 AC083863.1-201ENST00000438811 231 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CTF1Q16619 LINC01698-201ENST00000443636 727 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CTF1Q16619 TRIM60P11Y-201ENST00000445313 801 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CTF1Q16619 AC010655.1-201ENST00000449336 292 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CTF1Q16619 NANOGP10-201ENST00000453325 895 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CTF1Q16619 AL390730.1-201ENST00000457106 692 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CTF1Q16619 AC092620.2-201ENST00000458007 744 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CTF1Q16619 RNU7-170P-201ENST00000459303 61 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CTF1Q16619 RPL7P15-201ENST00000461190 712 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CTF1Q16619 RPL7P16-201ENST00000479738 738 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CTF1Q16619 AC083982.1-201ENST00000485679 344 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CTF1Q16619 AC020893.1-201ENST00000502452 580 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CTF1Q16619 AC008629.1-202ENST00000504820 525 ntTSL 4 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CTF1Q16619 AP002075.1-201ENST00000505091 603 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CTF1Q16619 MRPL36-203ENST00000505818 595 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CTF1Q16619 AC024132.2-201ENST00000506878 482 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CTF1Q16619 AC020593.1-201ENST00000507399 299 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.8 ms