Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 SATB1-AS1-258ENST00000629405 664 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 INPP4B-223ENST00000630044 354 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 ITGA9-AS1-218ENST00000630762 751 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 SMARCA2-229ENST00000634781 1106 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 AGL-205ENST00000370163 7166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 NEB-201ENST00000172853 20634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 AL354733.2-209ENST00000589233 1434 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 AC007823.1-201ENST00000569932 1566 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 MTCO1P6-201ENST00000481192 1384 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 AC090229.1-201ENST00000590983 1609 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 CRISP1-202ENST00000335847 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 RNF13-202ENST00000361785 1939 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 AP001148.1-201ENST00000624124 2359 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 SYNE1-201ENST00000341594 26584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 TEX43-201ENST00000357147 464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 OR2M2-201ENST00000359682 1044 ntAPPRIS P1 BASIC3.23□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 RNU1-85P-201ENST00000364127 164 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 U3.15-201ENST00000365398 212 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 SPANXN4-201ENST00000370504 560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 SEC61A2-203ENST00000379017 600 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 SNORA75-201ENST00000384158 137 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 SNORA48.7-201ENST00000391302 135 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 PIGPP2-201ENST00000411569 458 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 AC019064.1-201ENST00000414796 499 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 AC097717.1-228ENST00000417006 754 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 GRM7-AS1-201ENST00000420230 430 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 LINC01389-201ENST00000420876 483 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 AP003025.1-201ENST00000421650 149 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 MTND4LP11-201ENST00000422184 280 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 CYCSP46-201ENST00000423569 204 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 AL109761.1-201ENST00000428689 422 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 LINC01884-201ENST00000433429 440 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 AC018865.1-201ENST00000433507 578 ntTSL 4 BASIC3.23□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 AC241584.1-201ENST00000438469 1241 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 MTATP6P23-201ENST00000440153 476 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 AL031667.1-201ENST00000440222 725 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 USP9YP29-201ENST00000445112 563 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 OR6C5P-201ENST00000452388 923 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 ZNF114P1-201ENST00000453500 292 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 MDM2-217ENST00000478070 692 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 TAF8-207ENST00000482432 556 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 AC073359.1-201ENST00000486545 521 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 AC005726.1-201ENST00000494679 427 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 AC092608.1-201ENST00000503505 267 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 THAP6-205ENST00000504190 1004 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 MTND2P33-201ENST00000506452 1031 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 TEMN3-AS1-201ENST00000510211 401 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 RN7SKP31-201ENST00000516354 278 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 AC018861.2-201ENST00000518078 513 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 MTND4LP26-201ENST00000518144 282 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 IGKV2D-19-201ENST00000523346 262 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 AP000873.5-201ENST00000533906 236 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 AP001360.2-201ENST00000534423 562 ntTSL 4 BASIC3.23□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 LINC02378-201ENST00000540399 1003 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 AC133480.1-201ENST00000547563 381 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 NR2F2-AS1-208ENST00000560395 441 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 AL512347.1-201ENST00000566420 503 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 AC130371.1-204ENST00000576197 401 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 MIR4425-201ENST00000580572 84 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 AC009704.1-201ENST00000583702 331 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 AC079089.3-201ENST00000603094 673 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 SNORA51-201ENST00000606420 132 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 AC108747.1-201ENST00000609508 535 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 AC055764.2-201ENST00000610089 670 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 TLR6-205ENST00000610323 1443 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 AC025594.3-201ENST00000613068 790 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 MAGI2-AS3-224ENST00000619135 205 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 AC069209.1-201ENST00000619282 651 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 AC008443.7-201ENST00000622195 246 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 AC112200.1-201ENST00000625015 234 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 FOXP2-227ENST00000638397 240 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 ZBTB20-201ENST00000357258 27125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 AC058791.1-201ENST00000608412 3198 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 MME-211ENST00000492661 2854 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 TIMM9-202ENST00000395159 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 FAM111A-207ENST00000531147 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 FAM81B-201ENST00000283357 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 PTPN22-211ENST00000538253 3575 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 SYCP2-201ENST00000357552 5567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 RNU6-1339P-201ENST00000363574 91 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 MIR217-201ENST00000384817 110 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 LGALS16-201ENST00000392051 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 UBE2Q2P5Y-201ENST00000413867 207 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 AC017079.2-201ENST00000416102 485 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 MRPS36P1-201ENST00000421291 307 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 RPL30P3-201ENST00000424262 333 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 AC004870.4-201ENST00000424359 360 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 BLOC1S2P1-201ENST00000428431 301 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 MYCBP2-AS2-201ENST00000428716 428 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 CYCSP4-201ENST00000429682 331 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 GCA-203ENST00000429691 824 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 RPL39L-202ENST00000433055 749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 UBE2Q2P4Y-201ENST00000433767 207 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 AC068533.3-201ENST00000435524 404 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 USP9YP22-201ENST00000438971 294 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 AC093155.1-201ENST00000440164 826 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 COX6CP2-201ENST00000444980 225 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 MTCO2P25-201ENST00000447065 681 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 AL355592.1-201ENST00000450292 386 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 Z98749.1-201ENST00000454123 541 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
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