Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 AL133384.1-201ENST00000412744 351 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
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SGCAQ16586 AC005104.1-201ENST00000414896 442 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SGCAQ16586 MTND4P3-201ENST00000417829 541 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SGCAQ16586 KRR1P1-201ENST00000419430 803 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SGCAQ16586 AL034347.1-201ENST00000420766 835 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SGCAQ16586 FNDC3CP-201ENST00000420795 1155 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SGCAQ16586 MTCO3P1-205ENST00000422088 832 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
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SGCAQ16586 AC118942.1-201ENST00000529674 1035 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SGCAQ16586 MTCYBP27-201ENST00000555160 670 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
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SGCAQ16586 MIR4429-201ENST00000580105 73 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SGCAQ16586 AC011518.1-202ENST00000592668 407 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
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SGCAQ16586 SMARCA2-229ENST00000634781 1106 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
SGCAQ16586 AC007218.2-201ENST00000636913 179 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SGCAQ16586 MFSD8-245ENST00000641743 948 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SGCAQ16586 BCLAF1P1-201ENST00000505813 2752 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SGCAQ16586 AC138915.1-201ENST00000565427 1685 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SGCAQ16586 XKR3-201ENST00000331428 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
SGCAQ16586 KIAA1107-202ENST00000636278 4065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SGCAQ16586 HDX-201ENST00000297977 6200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
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SGCAQ16586 C11orf74-202ENST00000347206 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
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SGCAQ16586 FPGT-TNNI3K-202ENST00000370895 7566 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SGCAQ16586 AC020571.1-202ENST00000433933 1413 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
SGCAQ16586 TRAPPC13-208ENST00000505553 1410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
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SGCAQ16586 PRKACB-201ENST00000370680 1914 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
SGCAQ16586 PEX3-201ENST00000367591 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
SGCAQ16586 NPVF-201ENST00000222674 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
SGCAQ16586 OR1S2-201ENST00000302592 978 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SGCAQ16586 SUGT1P1-201ENST00000379514 476 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
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