Protein–RNA interactions for Protein: Q16473

TNXA, Putative tenascin-XA, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNXAQ16473 MTCO1P23-201ENST00000415223 1526 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TNXAQ16473 RGPD3-202ENST00000409886 5594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
TNXAQ16473 AP000526.1-201ENST00000603308 1388 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TNXAQ16473 GPBP1-201ENST00000264779 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
TNXAQ16473 PKIB-202ENST00000354275 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
TNXAQ16473 TRAJ59-201ENST00000390480 54 ntAPPRIS P1 BASIC2.52□□□□□ -2.01
TNXAQ16473 U3.19-201ENST00000390893 196 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TNXAQ16473 RNU2-25P-201ENST00000411041 191 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TNXAQ16473 RPL19P1-201ENST00000411635 428 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TNXAQ16473 AC069280.1-201ENST00000413094 439 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
TNXAQ16473 BMS1P22-201ENST00000414726 313 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TNXAQ16473 FCF1P2-201ENST00000415284 583 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TNXAQ16473 AC246680.2-201ENST00000422106 389 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TNXAQ16473 AL353678.1-201ENST00000422735 741 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TNXAQ16473 AC097713.2-201ENST00000430199 356 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TNXAQ16473 ACBD3-AS1-201ENST00000440540 535 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
TNXAQ16473 RPL23AP20-201ENST00000447965 421 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TNXAQ16473 MTND2P3-201ENST00000452458 470 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TNXAQ16473 PRSS3P4-201ENST00000453323 162 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TNXAQ16473 LINC01997-201ENST00000494900 429 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
TNXAQ16473 AC084024.2-201ENST00000503480 791 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TNXAQ16473 AL359273.1-203ENST00000506295 602 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
TNXAQ16473 AL359273.1-201ENST00000510918 627 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TNXAQ16473 SNORA31.21-201ENST00000517180 77 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TNXAQ16473 AC104986.1-201ENST00000517978 436 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TNXAQ16473 AC104211.1-202ENST00000521307 866 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
TNXAQ16473 MTCO1P47-201ENST00000523889 1271 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TNXAQ16473 AC068339.2-201ENST00000534395 618 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TNXAQ16473 AC022509.2-201ENST00000540392 699 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
TNXAQ16473 LYZ-203ENST00000549690 669 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
TNXAQ16473 LINC02258-201ENST00000551280 777 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
TNXAQ16473 AL355102.1-201ENST00000555383 460 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
TNXAQ16473 AL355097.1-201ENST00000555889 539 ntTSL 4 BASIC2.52□□□□□ -2.01
TNXAQ16473 LINC00557-201ENST00000563184 1279 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TNXAQ16473 MIR2682-201ENST00000580305 110 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TNXAQ16473 AC091132.5-202ENST00000587078 501 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
TNXAQ16473 AC008739.3-201ENST00000603262 127 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TNXAQ16473 RPL23AP92-201ENST00000603609 255 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TNXAQ16473 ELOCP35-201ENST00000604289 336 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TNXAQ16473 IL21-202ENST00000611104 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
TNXAQ16473 ADARB1-213ENST00000611195 159 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
TNXAQ16473 CYCSP41-201ENST00000616920 296 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TNXAQ16473 CDKN2B-AS.1-201ENST00000617921 150 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TNXAQ16473 AC138393.3-201ENST00000618397 573 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
TNXAQ16473 AC012314.7-201ENST00000619693 93 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TNXAQ16473 TEX30-201ENST00000376019 1689 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
TNXAQ16473 ZNF479-202ENST00000331162 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
TNXAQ16473 TECRL-202ENST00000507440 2876 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
TNXAQ16473 BCLAF1-205ENST00000527536 5371 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
TNXAQ16473 ZNF883-201ENST00000619044 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
TNXAQ16473 FAM46D-201ENST00000308293 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
TNXAQ16473 AL353743.1-202ENST00000431724 1695 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
TNXAQ16473 PLSCR5-201ENST00000443512 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
TNXAQ16473 RNU6-582P-201ENST00000362989 107 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
TNXAQ16473 RNU6-792P-201ENST00000363490 107 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
TNXAQ16473 RNU6-1180P-201ENST00000364935 107 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
TNXAQ16473 RNU1-109P-201ENST00000383960 147 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
TNXAQ16473 RNU6-1197P-201ENST00000391183 107 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
TNXAQ16473 AP002784.2-201ENST00000397300 549 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
TNXAQ16473 AL357075.1-201ENST00000404107 726 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
TNXAQ16473 RNU4-27P-201ENST00000410889 139 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
TNXAQ16473 BX682237.1-201ENST00000415016 335 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
TNXAQ16473 AC245054.2-201ENST00000415639 319 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
TNXAQ16473 LINC00845-201ENST00000417931 696 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
TNXAQ16473 FNDC1-IT1-201ENST00000419703 516 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
TNXAQ16473 AC023469.2-201ENST00000425983 657 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
TNXAQ16473 AL512658.1-202ENST00000433486 400 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
TNXAQ16473 AC011242.1-201ENST00000433596 1158 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
TNXAQ16473 AC006028.1-201ENST00000438379 402 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
TNXAQ16473 AC108734.1-201ENST00000439549 399 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
TNXAQ16473 LINC00278-202ENST00000444263 587 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
TNXAQ16473 LINC00412-201ENST00000444744 420 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
TNXAQ16473 AC044797.1-201ENST00000445744 679 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
TNXAQ16473 VN1R34P-201ENST00000447387 883 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
TNXAQ16473 NDUFAF4P3-201ENST00000456468 525 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
TNXAQ16473 OR6K1P-201ENST00000456766 971 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
TNXAQ16473 AC073359.1-201ENST00000486545 521 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
TNXAQ16473 RPL30P5-201ENST00000494923 336 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
TNXAQ16473 KLRA1P-201ENST00000503499 986 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
TNXAQ16473 VN1R104P-201ENST00000505115 1009 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
TNXAQ16473 SEM1P1-201ENST00000506694 209 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
TNXAQ16473 AC022118.1-201ENST00000512352 547 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
TNXAQ16473 AP002004.1-202ENST00000528437 586 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
TNXAQ16473 AL355773.1-201ENST00000554458 459 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
TNXAQ16473 AC090695.1-201ENST00000561269 1222 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
TNXAQ16473 MTCO1P40-201ENST00000574371 625 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
TNXAQ16473 AC007673.1-201ENST00000590604 1100 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
TNXAQ16473 AC013444.2-201ENST00000603317 787 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
TNXAQ16473 AP002906.1-201ENST00000603405 233 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
TNXAQ16473 AL137843.1-201ENST00000605078 385 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
TNXAQ16473 AC103798.2-201ENST00000624292 632 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
TNXAQ16473 LINC00836-203ENST00000628620 1179 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
TNXAQ16473 AC084035.1-201ENST00000634543 607 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
TNXAQ16473 U6.105-201ENST00000637379 88 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
TNXAQ16473 KERA-201ENST00000266719 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
TNXAQ16473 AL049781.1-201ENST00000623195 3585 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
TNXAQ16473 NUDT12-201ENST00000230792 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
TNXAQ16473 ZMYM2-203ENST00000382874 10139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
TNXAQ16473 MTND4P21-201ENST00000453886 1357 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TNXAQ16473 CC2D2B-210ENST00000636965 3247 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.9 ms