Protein–RNA interactions for Protein: Q16143

SNCB, Beta-synuclein, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNCBQ16143 LINC02030-201ENST00000492683 1602 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
SNCBQ16143 AL512646.1-201ENST00000269395 1077 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SNCBQ16143 C2orf76-201ENST00000334816 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
SNCBQ16143 RNA5SP258-201ENST00000362750 119 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SNCBQ16143 SPANXN4-201ENST00000370504 560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
SNCBQ16143 C1orf185-201ENST00000371759 915 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
SNCBQ16143 AL024507.1-201ENST00000412741 274 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SNCBQ16143 AC099566.1-204ENST00000413825 943 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
SNCBQ16143 MTND1P23-201ENST00000416931 372 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SNCBQ16143 AL356320.2-201ENST00000417263 507 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SNCBQ16143 AL137789.1-201ENST00000439443 682 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
SNCBQ16143 AC104978.1-201ENST00000449387 391 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SNCBQ16143 SNRPGP6-201ENST00000451124 220 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SNCBQ16143 HMGB1P5-202ENST00000451497 985 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SNCBQ16143 MRPL42P6-201ENST00000486397 371 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SNCBQ16143 UCHL1-AS1-201ENST00000507190 592 ntTSL 4 BASIC2.51□□□□□ -2.01
SNCBQ16143 AC109927.1-202ENST00000511951 282 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
SNCBQ16143 LINC02274-201ENST00000555539 1174 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
SNCBQ16143 FOPNL-208ENST00000575744 565 ntTSL 4 BASIC2.51□□□□□ -2.01
SNCBQ16143 ISCA1P3-201ENST00000577104 373 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SNCBQ16143 ZFP30-209ENST00000589018 444 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
SNCBQ16143 HMGB1P51-201ENST00000605166 638 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SNCBQ16143 WARS-244ENST00000627608 123 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
SNCBQ16143 AC009950.2-201ENST00000636548 183 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SNCBQ16143 ZNF382-210ENST00000639288 834 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
SNCBQ16143 TAB3-205ENST00000378933 6671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
SNCBQ16143 BCL2A1-202ENST00000335661 809 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
SNCBQ16143 OR51A7-201ENST00000359350 1048 ntAPPRIS P1 BASIC2.5□□□□□ -2.01
SNCBQ16143 OR1A2-201ENST00000381951 930 ntAPPRIS P1 BASIC2.5□□□□□ -2.01
SNCBQ16143 RNU6-1072P-201ENST00000384703 107 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SNCBQ16143 RNU6-443P-201ENST00000384780 107 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SNCBQ16143 RNU6ATAC10P-201ENST00000408635 111 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SNCBQ16143 AF064860.1-201ENST00000416555 544 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
SNCBQ16143 AC006333.1-201ENST00000422401 410 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
SNCBQ16143 TMEM167AP1-201ENST00000423409 219 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SNCBQ16143 AL138775.1-201ENST00000429539 575 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
SNCBQ16143 LINC02532-205ENST00000430094 628 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
SNCBQ16143 AC112220.1-201ENST00000434628 355 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SNCBQ16143 ARL5AP3-201ENST00000439327 386 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SNCBQ16143 AC013476.1-201ENST00000446709 537 ntTSL 4 BASIC2.5□□□□□ -2.01
SNCBQ16143 MYCBP2-AS1-202ENST00000448470 333 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
SNCBQ16143 AC104687.1-201ENST00000485829 412 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SNCBQ16143 AC021087.2-201ENST00000504656 1203 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SNCBQ16143 AC096734.1-201ENST00000511279 1128 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
SNCBQ16143 AC093879.2-201ENST00000513645 427 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
SNCBQ16143 SCGB1D5P-201ENST00000515134 247 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SNCBQ16143 SNORA74D-201ENST00000516404 141 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SNCBQ16143 RN7SKP57-201ENST00000517248 293 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SNCBQ16143 AP003170.4-201ENST00000543486 586 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
SNCBQ16143 PARPBP-212ENST00000543784 992 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
SNCBQ16143 AC121758.2-201ENST00000553271 193 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
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SNCBQ16143 AP005205.1-201ENST00000563503 508 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SNCBQ16143 MIR4504-201ENST00000577413 92 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SNCBQ16143 MIR5694-201ENST00000581190 76 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SNCBQ16143 AC024563.1-202ENST00000597533 419 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
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SNCBQ16143 AL035413.2-201ENST00000604801 525 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SNCBQ16143 AC128687.1-201ENST00000605304 619 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SNCBQ16143 MIR92B-201ENST00000607575 96 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SNCBQ16143 LINC00836-203ENST00000628620 1179 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
SNCBQ16143 SOX2-OT-255ENST00000630150 649 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
SNCBQ16143 FBXO11-201ENST00000402508 3844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
SNCBQ16143 SPAM1-202ENST00000340011 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
SNCBQ16143 OR4M1-202ENST00000641200 3493 ntAPPRIS P1 BASIC2.49□□□□□ -2.01
SNCBQ16143 FAM214A-201ENST00000261844 4217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
SNCBQ16143 KPNA5-202ENST00000368564 11311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
SNCBQ16143 ENAM-201ENST00000396073 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
SNCBQ16143 OR5H2-201ENST00000355273 945 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SNCBQ16143 MIRLET7G-201ENST00000362280 84 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SNCBQ16143 MRRF-203ENST00000373723 1176 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
SNCBQ16143 EEF1E1-BLOC1S5-201ENST00000397456 768 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
SNCBQ16143 SNORA11C-201ENST00000408532 129 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SNCBQ16143 RPS3AP25-201ENST00000411660 793 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SNCBQ16143 AF241725.1-201ENST00000416182 480 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
SNCBQ16143 FNDC3CP-201ENST00000420795 1155 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
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SNCBQ16143 PRKG1-AS1-202ENST00000426785 1111 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
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SNCBQ16143 AC009812.2-201ENST00000517657 457 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SNCBQ16143 AC104233.2-201ENST00000518922 414 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
SNCBQ16143 CKS1BP7-201ENST00000522230 235 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SNCBQ16143 AL138812.1-201ENST00000525573 471 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
SNCBQ16143 RGS4-207ENST00000527809 817 ntTSL 4 BASIC2.49□□□□□ -2.01
SNCBQ16143 AP000867.2-201ENST00000532468 320 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SNCBQ16143 SNRPGP16-201ENST00000533275 226 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SNCBQ16143 AL136146.2-201ENST00000534594 494 ntTSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
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SNCBQ16143 AC104002.1-201ENST00000557025 380 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
SNCBQ16143 PSMA4-204ENST00000558094 651 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
SNCBQ16143 AC053481.3-201ENST00000577881 843 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SNCBQ16143 MIR5195-201ENST00000583555 115 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SNCBQ16143 THOC1-220ENST00000621904 1083 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
SNCBQ16143 TUBD1-214ENST00000592426 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
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