Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 PHBP14-201ENST00000512887 367 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
SIX1Q15475 OR5M10-201ENST00000526812 1052 ntAPPRIS P1 BASIC3.31□□□□□ -1.88
SIX1Q15475 AP000857.2-201ENST00000532123 419 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
SIX1Q15475 FBXO3-AS1-202ENST00000533046 386 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
SIX1Q15475 LINC00508-201ENST00000538901 194 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
SIX1Q15475 NACA-211ENST00000548563 827 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
SIX1Q15475 LINC00640-203ENST00000556479 576 ntTSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
SIX1Q15475 AC037487.4-201ENST00000577423 625 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
SIX1Q15475 MIR5186-201ENST00000577504 120 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
SIX1Q15475 AC069304.2-201ENST00000605154 435 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
SIX1Q15475 AL591516.1-201ENST00000611326 274 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
SIX1Q15475 AC092142.2-201ENST00000614642 354 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
SIX1Q15475 AL713922.2-201ENST00000619384 716 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
SIX1Q15475 AC015967.1-201ENST00000619893 476 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
SIX1Q15475 PLCE1-AS2-213ENST00000620469 432 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
SIX1Q15475 BTG3-AS1-201ENST00000626994 552 ntTSL 4 BASIC3.31□□□□□ -1.88
SIX1Q15475 STEAP4-202ENST00000380079 9988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
SIX1Q15475 PLPPR4-201ENST00000370184 4505 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
SIX1Q15475 CREM-206ENST00000354759 1589 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
SIX1Q15475 CCDC178-205ENST00000406524 3039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
SIX1Q15475 SNORA70E-201ENST00000384492 135 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
SIX1Q15475 MS4A4E-202ENST00000398986 522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
SIX1Q15475 SSXP10-201ENST00000402595 565 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
SIX1Q15475 BTBD10P2-201ENST00000404779 676 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
SIX1Q15475 AL023807.1-201ENST00000407932 359 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
SIX1Q15475 AL133384.1-201ENST00000412744 351 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
SIX1Q15475 AC005062.1-204ENST00000415499 743 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
SIX1Q15475 DARS-AS1-205ENST00000444649 558 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
SIX1Q15475 AL606519.1-201ENST00000458146 580 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
SIX1Q15475 RPL37P6-202ENST00000464216 403 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
SIX1Q15475 ZBTB20-AS3-201ENST00000498630 464 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
SIX1Q15475 PDLIM1P4-201ENST00000504327 1006 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
SIX1Q15475 MND1-203ENST00000504860 638 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
SIX1Q15475 AC093895.1-203ENST00000506814 591 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
SIX1Q15475 RNU6-1129P-201ENST00000515964 104 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
SIX1Q15475 RN7SKP277-201ENST00000516895 283 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
SIX1Q15475 AC022390.1-201ENST00000517854 434 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
SIX1Q15475 ZNF705CP-201ENST00000530515 889 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
SIX1Q15475 PTP4A1P6-201ENST00000531034 478 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
SIX1Q15475 AP002993.1-201ENST00000538624 210 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
SIX1Q15475 AP002373.1-201ENST00000544347 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
SIX1Q15475 SARNP-203ENST00000552080 726 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
SIX1Q15475 LSM6P2-201ENST00000552208 177 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
SIX1Q15475 AC022706.1-202ENST00000585387 540 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
SIX1Q15475 AC022601.1-201ENST00000596954 577 ntTSL 4 BASIC3.3□□□□□ -1.88
SIX1Q15475 SRGNP1-201ENST00000603392 451 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
SIX1Q15475 AC083899.3-201ENST00000603413 594 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
SIX1Q15475 AL031281.1-201ENST00000604049 488 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
SIX1Q15475 AL162713.1-201ENST00000604480 262 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
SIX1Q15475 AL139418.1-201ENST00000613613 177 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
SIX1Q15475 uc_338.25-201ENST00000613756 156 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
SIX1Q15475 AC131159.1-201ENST00000621854 213 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
SIX1Q15475 AL139220.2-223ENST00000625982 921 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
SIX1Q15475 MTND2P41-201ENST00000637599 773 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
SIX1Q15475 OR6C2-202ENST00000641202 2105 ntAPPRIS P1 BASIC3.3□□□□□ -1.88
SIX1Q15475 EXOC5P1-201ENST00000510543 1969 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
SIX1Q15475 SAGE1-203ENST00000537770 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
SIX1Q15475 TUSC7-203ENST00000477539 2415 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
SIX1Q15475 RNF6-201ENST00000346166 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
SIX1Q15475 CCDC68-201ENST00000337363 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SIX1Q15475 MTND4P34-201ENST00000572715 1371 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SIX1Q15475 TSHB-201ENST00000256592 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SIX1Q15475 SNRPEP3-201ENST00000338402 276 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SIX1Q15475 MIR208A-201ENST00000362287 71 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SIX1Q15475 RNA5SP387-201ENST00000364226 106 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SIX1Q15475 RNA5SP72-201ENST00000364442 117 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SIX1Q15475 EQTN-202ENST00000380032 1033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
SIX1Q15475 C1GALT1-202ENST00000402468 930 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
SIX1Q15475 AC073264.1-201ENST00000411508 416 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SIX1Q15475 RAP1BP1-201ENST00000412709 553 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SIX1Q15475 AL359195.1-201ENST00000416657 339 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SIX1Q15475 TIMM9P2-201ENST00000419324 266 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SIX1Q15475 BX842559.1-201ENST00000419615 532 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SIX1Q15475 AL590378.1-201ENST00000426818 303 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SIX1Q15475 MTND5P25-201ENST00000430499 799 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SIX1Q15475 YWHAZP7-201ENST00000436906 631 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SIX1Q15475 MTCYBP11-201ENST00000447254 1109 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SIX1Q15475 BX276092.4-201ENST00000452056 248 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SIX1Q15475 RPL18AP17-201ENST00000455326 198 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SIX1Q15475 TRBV26-201ENST00000456572 344 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SIX1Q15475 AC073359.1-201ENST00000486545 521 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SIX1Q15475 OR4G11P-201ENST00000492842 939 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SIX1Q15475 RNF138P1-201ENST00000502765 546 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SIX1Q15475 PGRMC2-204ENST00000503872 1028 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SIX1Q15475 AC002460.1-201ENST00000504394 370 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SIX1Q15475 ZNF131-215ENST00000509931 970 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SIX1Q15475 AC119751.5-201ENST00000514077 770 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SIX1Q15475 RNY4P37-201ENST00000516225 96 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SIX1Q15475 AC108863.1-201ENST00000520863 650 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SIX1Q15475 AHI1-212ENST00000528103 441 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
SIX1Q15475 AP003170.4-201ENST00000543486 586 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SIX1Q15475 MRPL42-203ENST00000547098 701 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SIX1Q15475 CCNG2P1-201ENST00000549521 1000 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SIX1Q15475 AC107958.2-201ENST00000555396 592 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
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SIX1Q15475 AC002400.1-201ENST00000569310 726 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SIX1Q15475 AC091691.2-201ENST00000581940 567 ntTSL 4 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SIX1Q15475 ZNF415P1-201ENST00000582279 1166 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SIX1Q15475 LINC02109-204ENST00000602801 563 ntTSL 4 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SIX1Q15475 AC103881.1-201ENST00000603476 538 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
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