Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

Predictions only

Length 767 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 AP000676.2-201ENST00000529711 301 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
SEC23BQ15437 C8orf59-206ENST00000545322 491 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
SEC23BQ15437 SETP7-201ENST00000552169 453 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
SEC23BQ15437 RPL38-208ENST00000584577 344 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
SEC23BQ15437 HMGN1P30-201ENST00000589286 268 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
SEC23BQ15437 XIAPP1-201ENST00000603162 600 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
SEC23BQ15437 AC012669.1-201ENST00000603209 283 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
SEC23BQ15437 MALAT1-206ENST00000612781 234 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
SEC23BQ15437 AC006065.6-201ENST00000625201 545 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
SEC23BQ15437 AC099654.14-201ENST00000638599 341 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
SEC23BQ15437 OR4K15-202ENST00000641512 1216 ntAPPRIS P1 BASIC4.06□□□□□ -1.76
SEC23BQ15437 AK9-202ENST00000355283 2499 ntTSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
SEC23BQ15437 ENPP3-202ENST00000358229 3026 ntTSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
SEC23BQ15437 DENND2C-203ENST00000393277 4730 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
SEC23BQ15437 CFTR-201ENST00000003084 6132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
SEC23BQ15437 OSBPL6-201ENST00000190611 10513 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
SEC23BQ15437 TPTE2-201ENST00000255310 1562 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
SEC23BQ15437 MFSD8-242ENST00000641690 4199 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
SEC23BQ15437 NR5A2-201ENST00000236914 3115 ntTSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
SEC23BQ15437 NLGN1-206ENST00000457714 8242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
SEC23BQ15437 OR8H2-203ENST00000641311 3092 ntAPPRIS P2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
SEC23BQ15437 AC131971.1-201ENST00000332881 1482 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SEC23BQ15437 NCK1-204ENST00000469404 2403 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
SEC23BQ15437 GPX8-203ENST00000503787 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
SEC23BQ15437 USH2A-201ENST00000307340 18883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
SEC23BQ15437 PTPN22-202ENST00000420377 2726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
SEC23BQ15437 DNAH6-201ENST00000237449 12666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
SEC23BQ15437 ZMYND11-217ENST00000627286 3914 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
SEC23BQ15437 ZNF639-206ENST00000484866 1730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
SEC23BQ15437 Y_RNA.46-201ENST00000362695 102 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SEC23BQ15437 RNY4P14-201ENST00000363656 96 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SEC23BQ15437 MIR513A2-201ENST00000385249 127 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SEC23BQ15437 RPS3AP36-201ENST00000398190 775 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SEC23BQ15437 AL109941.1-201ENST00000401925 229 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SEC23BQ15437 FGF7P8-201ENST00000402994 292 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SEC23BQ15437 AC112721.2-201ENST00000409910 541 ntTSL 4 BASIC4.05□□□□□ -1.76
SEC23BQ15437 RNU4-55P-201ENST00000410731 137 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SEC23BQ15437 MIR1911-201ENST00000410783 80 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SEC23BQ15437 RNA5SP104-201ENST00000410989 118 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SEC23BQ15437 LINC01312-201ENST00000412745 775 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
SEC23BQ15437 AC098820.3-201ENST00000414135 976 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
SEC23BQ15437 AC079163.1-201ENST00000418416 407 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
SEC23BQ15437 TOMM22P1-201ENST00000418578 312 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SEC23BQ15437 AL445123.1-201ENST00000422023 446 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
SEC23BQ15437 Z82246.1-201ENST00000428201 457 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
SEC23BQ15437 PCDH9-AS1-201ENST00000430861 532 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
SEC23BQ15437 CBX1P1-201ENST00000440184 427 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SEC23BQ15437 MYCBP2-AS1-202ENST00000448470 333 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
SEC23BQ15437 ZEB1-AS1-204ENST00000450834 576 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
SEC23BQ15437 AL365318.1-201ENST00000453128 705 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
SEC23BQ15437 HMGB1P36-201ENST00000487709 576 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SEC23BQ15437 AC019235.1-201ENST00000503847 207 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SEC23BQ15437 FAM92A1P2-202ENST00000504766 877 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SEC23BQ15437 AC145146.2-202ENST00000508118 326 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
SEC23BQ15437 AC093824.1-201ENST00000508796 343 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SEC23BQ15437 PARP4P3-201ENST00000510265 317 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SEC23BQ15437 AC109454.3-201ENST00000512748 669 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
SEC23BQ15437 ARL2BPP6-201ENST00000512757 439 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SEC23BQ15437 AC093677.1-201ENST00000514414 678 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SEC23BQ15437 RNU6-714P-201ENST00000516963 103 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SEC23BQ15437 AC109466.1-204ENST00000519570 717 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
SEC23BQ15437 AC024958.1-203ENST00000520256 577 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
SEC23BQ15437 OR5AQ1P-201ENST00000527596 927 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SEC23BQ15437 PHBP17-201ENST00000528576 541 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SEC23BQ15437 AP000790.2-201ENST00000534388 522 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
SEC23BQ15437 KLRC2-204ENST00000536833 771 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
SEC23BQ15437 AC055720.1-201ENST00000539552 475 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
SEC23BQ15437 AL352979.3-201ENST00000553515 247 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SEC23BQ15437 AL358335.2-201ENST00000555693 487 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
SEC23BQ15437 AC020659.1-204ENST00000562920 400 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
SEC23BQ15437 AC103876.1-201ENST00000568634 418 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
SEC23BQ15437 AC090844.2-203ENST00000582263 632 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
SEC23BQ15437 AL157938.2-204ENST00000589667 826 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
SEC23BQ15437 BNIP3P30-201ENST00000601184 574 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SEC23BQ15437 AC025946.2-201ENST00000603398 234 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SEC23BQ15437 AC004853.1-201ENST00000604902 698 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SEC23BQ15437 AC020634.1-201ENST00000608701 549 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SEC23BQ15437 SLC38A2-214ENST00000612232 1221 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
SEC23BQ15437 uc_338.32-201ENST00000615087 172 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SEC23BQ15437 NAA60-237ENST00000615865 326 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
SEC23BQ15437 MIR6891-201ENST00000618788 93 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SEC23BQ15437 MIR6730-201ENST00000622213 67 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SEC23BQ15437 AC068880.5-201ENST00000624331 290 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SEC23BQ15437 ADAM7-201ENST00000175238 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
SEC23BQ15437 SCFD1-207ENST00000544052 2058 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
SEC23BQ15437 THUMPD3P1-201ENST00000506556 1480 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SEC23BQ15437 AL157396.1-201ENST00000630034 8444 ntTSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
SEC23BQ15437 STON1-GTF2A1L-202ENST00000394754 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
SEC23BQ15437 BMPR1B-203ENST00000440890 5388 ntTSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
SEC23BQ15437 TAB3-204ENST00000378932 3698 ntTSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
SEC23BQ15437 MRPL50-201ENST00000374865 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
SEC23BQ15437 PJA2-202ENST00000361557 4645 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
SEC23BQ15437 AC008725.1-201ENST00000605123 2263 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SEC23BQ15437 ENPP2-202ENST00000259486 3233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
SEC23BQ15437 UBE4A-202ENST00000431736 6061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
SEC23BQ15437 FRG1BP-201ENST00000278882 761 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SEC23BQ15437 SNORA58B-201ENST00000364259 136 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SEC23BQ15437 RNA5SP235-201ENST00000365411 114 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SEC23BQ15437 RGS10-201ENST00000369101 738 ntTSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
SEC23BQ15437 Y_RNA.402-201ENST00000383972 102 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.5 ms